4-(2-((1E,3E,5E)-5-(3-(1-azido-13-oxo-3,6,9,14-tetraoxa-12-azaicosan-20-yl)-1,1-dimethyl-1H-benzo[e]indol-2(3H)-ylidene)penta-1,3-dienyl)-1,1-dimethyl-1H-benzo[e]indolium-3-yl)butane-1-sulfonate | 1425272-43-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 萘
• 英文名称: 4-(2-((1E,3E,5E)-5-(3-(1-azido-13-oxo-3,6,9,14-tetraoxa-12-azaicosan-20-yl)-1,1-dimethyl-1H-benzo[e]indol-2(3H)-ylidene)penta-1,3-dienyl)-1,1-dimethyl-1H-benzo[e]indolium-3-yl)butane-1-sulfonate
• 英文别名: 4-[(2E)-2-[(2E,4E)-5-[3-[6-[2-[2-[2-(2-azidoethoxy)ethoxy]ethoxy]ethylcarbamoyloxy]hexyl]-1,1-dimethylbenzo[e]indol-3-ium-2-yl]penta-2,4-dienylidene]-1,1-dimethylbenzo[e]indol-3-yl]butane-1-sulfonate
• CAS: 1425272-43-0
• 化学式: C₅₂H₆₆N₆O₈S
• 分子量: 935.197
• InChiKey: WYBZBHSZZVFLOM-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  9.8
• 重原子数：
  67
• 可旋转键数：
  27
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.46
• 拓扑面积：
  152
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-(2-((1E,3E,5E)-5-(3-(1-azido-13-oxo-3,6,9,14-tetraoxa-12-azaicosan-20-yl)-1,1-dimethyl-1H-benzo[e]indol-2(3H)-ylidene)penta-1,3-dienyl)-1,1-dimethyl-1H-benzo[e]indolium-3-yl)butane-1-sulfonate 、 2-((1E,3Z,5E)-5-(1,1-dimethyl-6,8-disulfo-3-(3-sulfopropyl)-1H-benzo[e]indol-2(3H)-ylidene)-3-(3-(5-oxo-5-(prop-2-ynylamino)pentyl)phenyl)penta-1,3-dienyl)-1,1-dimethyl-8-sulfo-3-(3-sulfopropyl)-1H-benzo[e]indolium-6-sulfonate 在 copper(l) iodide 、 三[(1-苄基-1H-1,2,3-三唑-4-基)甲基]胺 作用下， 以 水 、 二甲基亚砜 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 2-((1E,3Z,5E)-3-(3-(5-((1-(20-((E)-2-((2E,4E)-5-(1,1-dimethyl-3-(4-sulfonatobutyl)-1H-benzo[e]indolium-2-yl)penta-2,4-dienylidene)-1,1-dimethyl-1H-benzo[e]indol-3(2H)-yl)-13-oxo-3,6,9,14-tetraoxa-12-azaicosyl)-1H-1,2,3-triazol-4-yl)methylamino)-5-oxopentyl)phenyl)-5-(1,1-dimethyl-6,8-disulfo-3-(3-sulfopropyl)-1H-benzo[e]indol-2(3H)-ylidene)penta-1,3-dienyl)-1,1-dimethyl-8-sulfo-3-(3-sulfopropyl)-1H-benzo[e]indolium-6-sulfonate
  参考文献：
  名称：

  NUCLEOTIDE DERIVATIVES

  摘要：

  本发明提供了化合物和方法，用于将荧光标签附加到生物分子，如核苷酸。这些化合物和方法对于包括DNA修饰反应在内的生物测定非常有用。

  公开号：

  US20130059343A1
• 作为产物：
  描述：

  4-(2-((1E,3E,5E)-5-(3-(6-hydroxyhexyl)-1,1-dimethyl-1H-benzo[e]indol-2(3H)-ylidene)penta-1,3-dienyl)-1,1-dimethyl-1H-benzo[e]indolium-3-yl)butane-1-sulfonate 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 反应 14.0h， 生成 4-(2-((1E,3E,5E)-5-(3-(1-azido-13-oxo-3,6,9,14-tetraoxa-12-azaicosan-20-yl)-1,1-dimethyl-1H-benzo[e]indol-2(3H)-ylidene)penta-1,3-dienyl)-1,1-dimethyl-1H-benzo[e]indolium-3-yl)butane-1-sulfonate
  参考文献：
  名称：

  NUCLEOTIDE DERIVATIVES

  摘要：

  本发明提供了化合物和方法，用于将荧光标签附加到生物分子，如核苷酸。这些化合物和方法对于包括DNA修饰反应在内的生物测定非常有用。

  公开号：

  US20130059343A1

文献信息

• NUCLEOTIDE DERIVATIVES
  申请人：Cheung Lael

  公开号：US20130059343A1

  公开（公告）日：2013-03-07

  The present invention provides compounds and methods for attaching fluorescent labels to biological molecules such as nucleotides. The compounds and methods are useful for biological assays including DNA modification reactions.

  本发明提供了化合物和方法，用于将荧光标签附加到生物分子，如核苷酸。这些化合物和方法对于包括DNA修饰反应在内的生物测定非常有用。