5-Hydroxy-deoxyuridine | 5168-36-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 5-Hydroxy-deoxyuridine
• 英文别名: 5-hydroxy-1-[4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 5168-36-5
• 化学式: C₉H₁₂N₂O₆
• 分子量: 244.204
• InChiKey: UIJSURSVLVISBO-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 溶解度：
  加热、超声处理轻微溶于甲醇、轻微溶于水

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.7
• 重原子数：
  17
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  119
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  6

制备方法与用途

生物活性

5-Hydroxy-2'-deoxyuridine (5-OHdU) 是一种 2'-Deoxycytidine 的主要稳定氧化产物。5-Hydroxy-2'-deoxyuridine 可以通过 DNA 聚合酶在体外掺入 DNA。

靶点

Human Endogenous Metabolite

体外研究

为了研究核苷酸在模板 DNA 上方特定位点的插入特异性，使用了含有内部 2'-deoxy-5-hydroxyuridine (5-OHdU) 的两种不同序列背景下的18-和45-成员寡脱氧核苷酸。在这两个寡聚核苷酸中均发生了在 2'-deoxy-5-hydroxyuridine (5-OHdU) 上的转录后合成，但在模板中观察到对修改碱基前后的暂停现象。核苷酸插入 2'-deoxy-5-hydroxyuridine (5-OHdU) 在模板上的特异性依赖于序列背景。在一个序列背景下，dA 是主要被掺入的核苷酸；而在另一个序列背景下，则是 dC 占主导地位。同样，在同一序列背景下，dC 也是主要被插入的核苷酸。

文献信息

• [EN] OLIGONUCLEOTIDE COMPOSITIONS AND METHODS THEREOF<br/>[FR] COMPOSITIONS D'OLIGONUCLÉOTIDES ET PROCÉDÉS ASSOCIÉS
  申请人：WAVE LIFE SCIENCES LTD

  公开号：WO2022099159A1

  公开（公告）日：2022-05-12

  Among other things, the present disclosure provides oligonucleotides and compositions thereof. In some embodiments, provided oligonucleotides and compositions are useful for adenosine modification. In some embodiments, the present disclosure provides methods for treating various conditions, disorders or diseases that can benefit from adenosine modification.

  除其他事项外，本公开提供寡核苷酸及其组合物。在某些实施例中，提供的寡核苷酸及其组合物对腺苷修饰有用。在某些实施例中，本公开提供了治疗各种需要腺苷修饰的疾病、疾病或病症的方法。
• [EN] MITOCHONDRIAL APOPTOSIS-INDUCED INFLAMMATION<br/>[FR] INFLAMMATION INDUITE PAR L'APOPTOSE MITOCHONDRIALE
  申请人：CEDARS SINAI MEDICAL CENTER

  公开号：WO2012016145A2

  公开（公告）日：2012-02-02

  Disclosed is a method of treating inflammation, an inflammatory disease, an inflammatory disease condition and/or an autoimmune disease in a subject in need thereof. The method can comprise providing a composition comprising a mitochondrial apoptosis inhibitor or an oxidative nucleotide and administering the composition to the subject to treat the inflammation, the inflammatory disease, the inflammatory disease condition and/or the autoimmune disease. Said method is based on the mitochondria actingg as a unifying point that integrates diverse NLRP3 stimuli and that mitochondrial dysfunction and apoptosis of macrophages are critical steps in various danger signal-induced NLRP3 inflammasome activation.