Thermodynamic parameters were determined for structurally-related inhibitors of HCV NS3 protease to assess how binding entropies and enthalpies vary with incremental changes at the P2 and P3 inhibitor subsites. Changing the heterocyclic substituent at P2 from a pyridyl to a 7-methoxy-2-phenyl-4-quinolyl group leads to a 710-fold increase in affinity. Annelating a benzene ring onto a pyridine ring leads
确定了HCV
NS3蛋白酶的结构相关
抑制剂的热力学参数,以评估结合熵和焓如何随P2和P3
抑制剂亚位点的增量变化而变化。将P2处的杂环取代基从
吡啶基更改为7-甲氧基-2-苯基-4-
喹啉基可导致亲和力增加710倍。将苯环退火到
吡啶环上会导致
喹啉衍生的
抑制剂具有更高的亲和力,但每个
配体对的焓和熵贡献均明显不同。在P2的杂环的C2处引入苯基均匀地导致具有更有利的结合熵的较高亲和力类似物,而在P2的
喹啉环的C7处加入甲氧基提供具有更有利的结合焓的衍
生物。对于缺少2-苯基取代基的
抑制剂的结构变化观察到显着的焓/熵补偿,而当存在2-苯基基团时,结合焓和熵的有利变化都伴随着结构修饰。总的来说,在P2处具有2-苯基-4-
喹啉基的
抑制剂的结合能受熵作用支配,而相应的去
甲苯基类似物的结合主要是由焓驱动的。值得注意的是,对于这组
抑制剂,从熵驱动的缔合转变为焓驱动的缔合也与替代的结合模式相关。当P3上侧链的空间体积从氢原子增加到