e-Pharmacophore model-guided design of potential DprE1 inhibitors: synthesis, in vitro antitubercular assay and molecular modelling studies
作者:Avinash Kumar、Revathi Rajappan、Suvarna G. Kini、Ekta Rathi、Sriram Dharmarajan、K. Sreedhara Ranganath Pai
DOI:10.1007/s11696-021-01743-3
日期:2021.10
around 1.4 million deaths in 2019. Hence, in our pursuit of developing novel antitubercular compounds, we are reporting the e-Pharmacophore-based design of DprE1 (decaprenylphosphoryl-ribose 2′-oxidase) inhibitors. In the present work, we have developed a four-feature e-Pharmacophore model based on the receptor–ligand cavity of DprE1 protein (PDB ID 4P8C) and mapped our previous reported library of compounds
结核病继续在世界范围内肆虐,2019 年造成约 140 万人死亡。 因此,在我们追求开发新型抗结核化合物的过程中,我们报告了基于 e-Pharmacophore 的 DprE1(癸烯基磷酰核糖 2'-氧化酶)抑制剂设计。在目前的工作中,我们开发了一个基于 DprE1 蛋白受体 - 配体腔(PDB ID 4P8C)的四特征 e-Pharmacophore 模型,并将我们之前报道的化合物库映射到它上面。这些化合物按阶段筛选分数排名,从它们的比对中获得的见解用于设计一些新化合物。使用 Maestro, Schrodinger 的 Glide 模块以超精密模式将设计的化合物与 DprE1 蛋白对接。一些衍生品如 B1、B2、B4、B5 和 B12 显示出可比的对接分数(对接分数 > − 6。0) 关于共结晶的配体。合成并表征了设计的化合物。体外抗结核活性在结核分枝杆菌H37Rv(ATCC27294