cyclo(Asp(OBn))3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯丙烷和聚酮 - 大环内酰胺类
• 英文名称: cyclo(Asp(OBn))3
• 英文别名: tribenzyl (2S,6S,10S)-4,8,12-trioxo-1,5,9-triazacyclododecane-2,6,10-tricarboxylate
• 化学式: C₃₃H₃₃N₃O₉
• 分子量: 615.64
• InChiKey: FQXXRGVBMDYFSQ-QKDODKLFSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.1
• 重原子数：
  45
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.27
• 拓扑面积：
  166
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  (S)-2-[(S)-3-Benzyloxycarbonyl-3-((S)-3-benzyloxycarbonyl-3-tert-butoxycarbonylamino-propionylamino)-propionylamino]-succinic acid 1-benzyl ester 4-(2,2,2-trichloro-ethyl) ester 在 溶剂黄146 、 1-(3-二甲基氨基丙基)-3-乙基碳二亚胺 、 N,N-二异丙基乙胺 、 锌 作用下， 以 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 34.0h， 生成 cyclo(Asp(OBn))3
  参考文献：
  名称：

  Linear and cyclic β3-oligopeptides with functionalised side-chains (-CH2OBn, -CO2Bn, -CH2CH2CO2Bn) derived from serine and from aspartic and glutamic acid

  摘要：

  天然的β-氨基酸衍生物Boc-Asp(β-OH)-OBn，以及Boc-β-HGlu(OBn)-OH和Boc-β-HSer(OBn)-OH（分别通过Arndt-Eistert同系化法从适当保护的谷氨酸和丝氨酸制备），被用作合成由2到6个β-氨基酸组成的线性（11-20）和环状（21-23）β-寡肽的构建模块[使用三氯乙基（TCE）酯基团进行C端保护和五氟苯酯激活进行大环化]。尽管线性衍生物在溶液中足以用于反应和结构研究，但环状β-三肽和六肽则不然（根据FT-IR测量，它们形成了氢键网络，可能是由所谓的纳米管组成）。Boc-OTCE保护的六肽（19）和无保护的六肽（20）[β-Asp(OBn)-β-HGlu(OBn)-β-HSer(OBn)]2的CD光谱存在显著差异，只有无保护形式在210到220 nm之间显示熟悉的负Cotton效应模式（表明为314螺旋）。在甲醇中对自由末端的六肽20进行NMR分析揭示了存在一个中心、左旋的螺旋转弯（14元氢键环）。结果进行了讨论并与先前获得的具有非功能化侧链的类似β-肽的结果进行了比较。

  DOI：

  10.1039/a805478i

文献信息

• Linear and cyclic β3-oligopeptides with functionalised side-chains (-CH2OBn, -CO2Bn, -CH2CH2CO2Bn) derived from serine and from aspartic and glutamic acid
  作者：Jennifer L. Matthews、Karl Gademann、Bernhard Jaun、Dieter Seebach

  DOI：10.1039/a805478i

  日期：——

  The natural β-amino acid derivative Boc-Asp(β-OH)-OBn, as well as Boc-β-HGlu(OBn)-OH and Boc-β-HSer(OBn)-OH (prepared from appropriately protected glutamic acid and serine, respectively, by Arndt–Eistert homologation), were employed as building blocks for the synthesis of linear (11–20) and cyclic (21–23) β-oligopeptides consisting of two to six β-amino acids [using trichloroethyl (TCE) ester groups for C-terminal protection and pentafluorophenyl-ester activation for macrocyclisation]. While the linear derivatives are soluble enough for reactions and structural investigations in solution, the cyclo-β-tri- and -hexapeptides are not (according to FT-IR measurements they form networks of hydrogen bonds, perhaps consisting of so-called nanotubes). The CD spectra of the Boc–OTCE-protected (19) and of the unprotected (20) β-hexapeptides [β-Asp(OBn)-β-HGlu(OBn)-β-HSer(OBn)]2 differ drastically, and only the unprotected form shows the familiar pattern of a negative Cotton effect between 210 and 220 nm (indicative of a 314 helix). An NMR analysis in methanol of the β-hexapeptide 20 with free termini reveals the presence of a single, central, left-handed helix turn (14-membered hydrogen-bonded ring). The results are discussed and compared with those obtained previously for analogous β-peptides carrying non-functionalised side chains.

  天然的β-氨基酸衍生物Boc-Asp(β-OH)-OBn，以及Boc-β-HGlu(OBn)-OH和Boc-β-HSer(OBn)-OH（分别通过Arndt-Eistert同系化法从适当保护的谷氨酸和丝氨酸制备），被用作合成由2到6个β-氨基酸组成的线性（11-20）和环状（21-23）β-寡肽的构建模块[使用三氯乙基（TCE）酯基团进行C端保护和五氟苯酯激活进行大环化]。尽管线性衍生物在溶液中足以用于反应和结构研究，但环状β-三肽和六肽则不然（根据FT-IR测量，它们形成了氢键网络，可能是由所谓的纳米管组成）。Boc-OTCE保护的六肽（19）和无保护的六肽（20）[β-Asp(OBn)-β-HGlu(OBn)-β-HSer(OBn)]2的CD光谱存在显著差异，只有无保护形式在210到220 nm之间显示熟悉的负Cotton效应模式（表明为314螺旋）。在甲醇中对自由末端的六肽20进行NMR分析揭示了存在一个中心、左旋的螺旋转弯（14元氢键环）。结果进行了讨论并与先前获得的具有非功能化侧链的类似β-肽的结果进行了比较。