2'-O-(tetrahydropyranyl)-5'-N-((9-fluorenylmethoxy)carbonyl)-5'-amino-5'-deoxyuridine | 149695-39-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 5'-脱氧核糖核苷
• 英文名称: 2'-O-(tetrahydropyranyl)-5'-N-((9-fluorenylmethoxy)carbonyl)-5'-amino-5'-deoxyuridine
• CAS: 149695-39-6
• 化学式: C₂₉H₃₁N₃O₈
• 分子量: 549.58
• InChiKey: RTVMKHSGUDEPIL-MQBQOYBCSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.25
• 重原子数：
  40.0
• 可旋转键数：
  7.0
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.41
• 拓扑面积：
  141.11
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  9.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-氰乙基N,N-二异丙基氯亚磷酰胺 、 2'-O-(tetrahydropyranyl)-5'-N-((9-fluorenylmethoxy)carbonyl)-5'-amino-5'-deoxyuridine 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 1.0h， 以60%的产率得到2'-O-(tetrahydropyranyl)-3'-O-<(N,N-diisopropylamino)(β-cyanoethoxy)phosphinyl>-5'-N-((9-fluorenylmethoxy)carbonyl)-5'-amino-5'-deoxyuridine
  参考文献：
  名称：

  5'-氨基芘提供灵敏、无干扰的 RNA 二级和三级结构形成荧光探针

  摘要：

  5'-氨基-5'-脱氧胞苷和5'-氨基-5'-脱氧尿苷的封闭亚磷酰胺已制备并偶联到寡核糖核苷酸的5'-末端。这些 5'-氨基 RNA 低聚物可以很容易地与各种市售的胺反应性荧光染料结合，包括琥珀酰亚胺酯衍生物。描述了 5'-芘标记的 RNA 寡聚体的合成、纯化和特性。这些寡聚体被证明是用于研究寡聚体-寡聚体和寡聚体-核酶相互作用的异常有吸引力的探针。特别是，5'-芘寡聚物稳定且对环境非常敏感，同时对 RNA 中二级和三级结构形成的热力学扰动最小。因此 5'

  DOI：

  10.1021/ja00065a006
• 作为产物：
  描述：

  O^2'-tetrahydropyran-2-yl-uridine 在 吡啶 、 二氯乙酸 、 叠氮化锂 、 四溴化碳 、 三乙胺 、 三苯基膦 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 46.25h， 生成 2'-O-(tetrahydropyranyl)-5'-N-((9-fluorenylmethoxy)carbonyl)-5'-amino-5'-deoxyuridine
  参考文献：
  名称：

  5'-氨基芘提供灵敏、无干扰的 RNA 二级和三级结构形成荧光探针

  摘要：

  5'-氨基-5'-脱氧胞苷和5'-氨基-5'-脱氧尿苷的封闭亚磷酰胺已制备并偶联到寡核糖核苷酸的5'-末端。这些 5'-氨基 RNA 低聚物可以很容易地与各种市售的胺反应性荧光染料结合，包括琥珀酰亚胺酯衍生物。描述了 5'-芘标记的 RNA 寡聚体的合成、纯化和特性。这些寡聚体被证明是用于研究寡聚体-寡聚体和寡聚体-核酶相互作用的异常有吸引力的探针。特别是，5'-芘寡聚物稳定且对环境非常敏感，同时对 RNA 中二级和三级结构形成的热力学扰动最小。因此 5'

  DOI：

  10.1021/ja00065a006