5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-[[(triisopropylsilyl)oxy]-methyl]-2-N-methyl-6-O-(diphenylcarbamoyl) guanosine | 1189320-64-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-[[(triisopropylsilyl)oxy]-methyl]-2-N-methyl-6-O-(diphenylcarbamoyl) guanosine
• 英文别名: [9-[(2R,3R,4R,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-hydroxy-3-[tri(propan-2-yl)silyloxymethoxy]oxolan-2-yl]-2-(methylamino)purin-6-yl] N,N-diphenylcarbamate
• CAS: 1189320-64-6
• 化学式: C₅₅H₆₄N₆O₉Si
• 分子量: 981.233
• InChiKey: OEEQXYNKUVABDH-PDPADYNLSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  11.02
• 重原子数：
  71
• 可旋转键数：
  21
• 环数：
  8.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.35
• 拓扑面积：
  161
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  13

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-[[(triisopropylsilyl)oxy]-methyl]-2-N-methyl-6-O-(diphenylcarbamoyl) guanosine 、 2-氰乙基N,N-二异丙基氯亚磷酰胺 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 2.0h， 以95%的产率得到5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-[[(triisopropylsilyl)oxy]-methyl]-2-N-methyl-6-O-(diphenylcarbamoyl) guanosine 3'-(2-cyanoethyl diisopropylphosphoramidite)
  参考文献：
  名称：

  大肠杆菌 16S 核糖体 RNA 970 发夹环中修饰核苷酸的合成和表征

  摘要：

  6-合成Ô -DPC -2- Ñ -methylguanosine（米2 G）的核苷和相应的5'- ø 5'-DMT-2'- ø -汤姆保护6- ö -DPC -2- Ñ -methylguanosine据报道，亚磷酰胺 [DPC，二苯基氨基甲酰基；DMT, 4,4'-二甲氧基三苯甲基；TOM，[(三异丙基甲硅烷基)氧基]甲基]。亚磷酰胺的可用性允许通过位点选择性掺入 2- N-甲基鸟苷修饰来合成发夹 RNA 。四个 18-nt 发夹 RNA 类似物，代表大肠杆菌的 970 环区域（螺旋 31 或 h31；U960–A975）合成的 16S rRNA 在环区经过和不经过修饰。随后，检查了单一和双重修饰的 RNA 的稳定性和构象，并与相应的未修饰的 RNA 进行了比较。显示了四种螺旋 31 RNA 类似物的热力学参数和圆二色光谱。令人惊讶的是，螺旋 31 环区域的甲基化会轻微破坏发夹结构，这

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2009.07.008
• 作为产物：
  描述：

  5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2-N-methyl-6-O-(diphenylcarbamoyl)guanosine 、 (异丙氧基硅)氯甲烷 在 二叔丁基二氯化锡 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 1,2-二氯乙烷 为溶剂， 反应 3.25h， 以70%的产率得到5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-[[(triisopropylsilyl)oxy]-methyl]-2-N-methyl-6-O-(diphenylcarbamoyl) guanosine
  参考文献：
  名称：

  大肠杆菌 16S 核糖体 RNA 970 发夹环中修饰核苷酸的合成和表征

  摘要：

  6-合成Ô -DPC -2- Ñ -methylguanosine（米2 G）的核苷和相应的5'- ø 5'-DMT-2'- ø -汤姆保护6- ö -DPC -2- Ñ -methylguanosine据报道，亚磷酰胺 [DPC，二苯基氨基甲酰基；DMT, 4,4'-二甲氧基三苯甲基；TOM，[(三异丙基甲硅烷基)氧基]甲基]。亚磷酰胺的可用性允许通过位点选择性掺入 2- N-甲基鸟苷修饰来合成发夹 RNA 。四个 18-nt 发夹 RNA 类似物，代表大肠杆菌的 970 环区域（螺旋 31 或 h31；U960–A975）合成的 16S rRNA 在环区经过和不经过修饰。随后，检查了单一和双重修饰的 RNA 的稳定性和构象，并与相应的未修饰的 RNA 进行了比较。显示了四种螺旋 31 RNA 类似物的热力学参数和圆二色光谱。令人惊讶的是，螺旋 31 环区域的甲基化会轻微破坏发夹结构，这

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2009.07.008