Rp-O-(3'-deoxycytidin-5'-yl)-O-(2'-O-methyl-5'-O-phosphorylguanosin-3'-yl)-N-[3-(malon-2-yl)propyl]phosphoramidate | 1243238-56-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷酸
• 英文名称: Rp-O-(3'-deoxycytidin-5'-yl)-O-(2'-O-methyl-5'-O-phosphorylguanosin-3'-yl)-N-[3-(malon-2-yl)propyl]phosphoramidate
• 英文别名: 2-[3-[[[(2R,3R,4R,5R)-5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-4-methoxy-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl]oxy-[[(2S,4R,5R)-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)-4-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy]phosphoryl]amino]propyl]propanedioic acid
• CAS: 1243238-56-3
• 化学式: C₂₆H₃₇N₉O₁₇P₂
• 分子量: 809.577
• InChiKey: ZQCRLTHRCQFOHO-TUUFIASQSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -5.9
• 重原子数：
  54
• 可旋转键数：
  18
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.58
• 拓扑面积：
  381
• 氢给体数：
  9
• 氢受体数：
  19

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  protected 7 在 水 、 sodium hydroxide 、 氨 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙腈 为溶剂， 反应 7.0h， 生成 Rp-O-(3'-deoxycytidin-5'-yl)-O-(2'-O-methyl-5'-O-phosphorylguanosin-3'-yl)-N-[3-(malon-2-yl)propyl]phosphoramidate 、 Sp-O-(3'-deoxycytidin-5'-yl)-O-(2'-O-methyl-5'-O-phosphorylguanosin-3'-yl)-N-[3-(malon-2-yl)propyl]phosphoramidate
  参考文献：
  名称：

  3'-脱氧氨基磷酸二核苷作为丙型肝炎病毒亚基因组复制子和 NS5B 聚合酶活性的改进抑制剂

  摘要：

  氨基磷酸酯双核苷命名为“GC 3'-OH”系列，携带各种氨基磷酸酯键，此前已报道为丙型肝炎病毒 (HCV) 抑制剂。为了提高这些二核苷酸的功效，我们合成了一种新的“GC 3'-H”系列作为潜在的链终止剂。我们表明，通过引入新的中性和双负电荷氨基磷酸酯侧链，它们的抑制效力大大提高。在体外和在含有 Huh-6 细胞的 HCV 亚基因组复制子中评估了它们对 HCV NS5B 聚合酶的抑制作用。正如预期的那样，3'-H 化合物比它们的 3'-OH 对应物更有效地抑制 HCV 聚合酶活性。最有效的抑制剂是一种带有双负电荷氨基侧链的 5'-磷酸化二核苷酸 ( 7 )，其 IC 值为50体外 8 μM 的值和 HCV 亚基因组复制子系统中的EC 50值为 2.6 μM。提出了一个分子结构模型来解释 3'-H-胞苷修饰所提供的增益。

  DOI：

  10.1021/jm100102v