(2'-OMe-C)p-dT | 1039429-44-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - （3'->5'）-二核苷酸和类似物
• 英文名称: (2'-OMe-C)p-dT
• 英文别名: Cyt-Ribf2Me-P-dThd；[(2R,3R,4R,5R)-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)-2-(hydroxymethyl)-4-methoxyoxolan-3-yl] [(2R,3S,5R)-3-hydroxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate
• CAS: 1039429-44-1
• 化学式: C₂₀H₂₈N₅O₁₂P
• 分子量: 561.442
• InChiKey: OWBQRRKGWQTRFV-WWJUSVCISA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -4.2
• 重原子数：
  38
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  232
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  12

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  Ade-Ribf2Me-P-dThd 在 氨 、 水 作用下， 反应 12.0h， 生成 (2'-OMe-C)p-dT
  参考文献：
  名称：

  O-Selective Condensation Using P−N Bond Cleavage in RNA Synthesis without Base Protection

  摘要：

  In RNA synthesis without base protection, a new method for O-selective condensation with more than 99% selectivity was developed by 6-nitro-HOBt-mediated cleavage of undesired P(III)-N bonds on nucleobase moieties. Moreover, we for the first time succeeded in synthesizing oligoRNAs without base protection.

  DOI：

  10.1021/ol800911b