GTP-γ-S

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷酸
• 英文名称: GTP-γ-S
• 英文别名: guanosine 5'-O-(3-thiotriphosphate)；[[(2R,3S,4R,5R)-5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxy-oxidophosphoryl] dioxidophosphinothioyl phosphate
• 化学式: C₁₀H₁₂N₅O₁₃P₃S
• 分子量: 535.218
• InChiKey: XOFLBQFBSOEHOG-UUOKFMHZSA-J

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -5.1
• 重原子数：
  32
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  321
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  15

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  GTP-γ-S 在 copper(II) sulfate 、 sodium ascorbate 作用下， 以 水 、 二甲基亚砜 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 0.33h， 生成
  参考文献：
  名称：

  制备 5' 帽子模拟物和加帽 RNA 的新途径：通过点击化学获得磷酸盐修饰的帽子类似物†

  摘要：

  mRNA 5'帽在翻译起始中的重要生物学作用使其成为化学修饰的一个有趣的主题，旨在产生用于选择性调节细胞间过程和开发新型治疗干预的有用工具。然而，帽类似物的传统化学合成方法既耗时又费力，这阻碍了新型化合物的开发及其应用。在这里，我们探索了一种不同的合成 5'帽模拟物的方法，利用点击化学 (CuAAC) 组合两个单核苷酸单元，并产生一类在寡磷酸链内含有三唑环的新型二核苷酸帽类似物。结果，我们合成了 36 个 mRNA 帽子类似物的文库，这些类似物的三唑环位置、多磷酸链长度以及连接磷酸盐和三唑部分的接头类型有所不同。经过生化评估，我们鉴定了两种类似物，当它们掺入 mRNA 时，产生的转录物翻译效率类似于通过传统合成获得的寡磷酸桥中未修饰的化合物。此外，我们证明了可以使用两种替代加帽策略在 RNA 5' 端生成三唑修饰的帽结构：典型的共转录方法或基于 CuAAC 的新转录后方法。我们的研究结果为开发用于研究和治疗应用的化学修饰

  DOI：

  10.1039/c6sc02437h

文献信息

• Fluorescence Anisotropy Assay with Guanine Nucleotides Provides Access to Functional Analysis of Gαi1 Proteins
  作者：Anna Pepanian、Paul Sommerfeld、Renata Kasprzyk、Toni Kühl、F. Ayberk Binbay、Christoph Hauser、Reik Löser、Robert Wodtke、Marcelina Bednarczyk、Mikolaj Chrominski、Joanna Kowalska、Jacek Jemielity、Diana Imhof、Markus Pietsch

  DOI：10.1021/acs.analchem.2c03176

  日期：2022.10.18

  ligands at the GTP-binding site and to quantify the fraction of active Gαi1 protein. An advanced bacterial expression protocol was applied to produce active human Gαi1 protein, whose GTP binding capability was determined with novel fluorescently labeled guanine nucleotides acting as high-affinity Gαi1 binders compared to the commonly used BODIPY FL GTPγS. This study thus contributes a new method for

  Gα 蛋白作为异源三聚体 G 蛋白的一部分，是 G 蛋白偶联受体介导的细胞内信号传导所必需的分子开关。Gα 亚基的作用已经用各种鸟嘌呤核苷酸进行了数十年的研究，以阐明激活机制和 Gα 蛋白依赖性信号转导。几种方法描述了模拟 GTP 功能的荧光配体，但缺乏对蛋白质的 GTP 结合活性和活性蛋白质分数的有效估计。在此，我们报告了一种可靠的基于荧光各向异性的方法的开发，以确定配体在 GTP 结合位点的亲和力并量化活性 Gαi1 蛋白的分数。应用先进的细菌表达方案来生产活性人 Gαi1 蛋白，与常用的 BODIPY FL GTPγS 相比，其 GTP 结合能力是用新型荧光标记的鸟嘌呤核苷酸作为高亲和力 Gαi1 结合剂确定的。因此，本研究为未来研究 Gαi 和其他 Gα 蛋白亚基的表征、探索其相应的信号转导系统和生物医学应用潜力提供了一种新方法。