(1S,2R,5R)-5-(4-氨基-1H-咪唑并[4,5-C]吡啶-1-基)-3-羟甲基-3-环戊烯-1,2-二醇 | 102052-95-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 咪唑并吡啶类
• 中文名称: (1S,2R,5R)-5-(4-氨基-1H-咪唑并[4,5-C]吡啶-1-基)-3-羟甲基-3-环戊烯-1,2-二醇
• 中文别名: 3-去氮腺嘌呤；(1S,2r,5r)-5-(4-氨基-1H-咪唑并[4,5-c]吡啶-1-基)-3-(羟基甲基)-3-环戊烯-1,2-二醇
• 英文名称: 3-deazaneplanocin A
• 英文别名: DZNep；3-deazaneplanocin；5R-(4-amino-1H-imidazo[4,5-c]pyridin-1-yl)-3-(hydroxymethyl)-3-cyclopentene-1S,2R-diol；deazaneplanocin A；(1S,2R,5R)-5-(4-aminoimidazo[4,5-c]pyridin-1-yl)-3-(hydroxymethyl)cyclopent-3-ene-1,2-diol
• CAS: 102052-95-9
• 化学式: C₁₂H₁₄N₄O₃
• 分子量: 262.268
• InChiKey: OMKHWTRUYNAGFG-IEBDPFPHSA-N

物化性质

• 沸点：
  624.1±65.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.75
• 溶解度：
  可溶于 DMSO（高达 20 mg/ml）

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.7
• 重原子数：
  19
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.33
• 拓扑面积：
  117
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  6

制备方法与用途

生物活性

3-Deazaneplanocin A (DZNep) 是一种有效的组蛋白甲基转移酶 (EZH2) 抑制剂，同时也是一种有效的 S-腺苷同型半胱氨酸水解酶 (AHCY) 抑制剂。

靶点

• EZH2

体外研究

3-Deazaneplanocin A 是一种强效的 EZH2 抑制剂。在 OCI-AML3 细胞中使用 1.0 μM 的 3-Deazaneplanocin A 处理会导致细胞周期 G₀/G₁ 相显著增加（58.5%），同时 S 期和 G₂/M 期的细胞数量减少（分别为 35.2% 和 6.3%，P < 0.05）。在 48 小时内，使用 200 nM 至 2.0 μM 的 3-Deazaneplanocin A 按剂量依赖性抑制 OCI-AML3 和 HL-60 细胞的集落生长。3-Deazaneplanocin A 还能减少 EZH2 的表达，尤其是在 PANC-1、MIA-PaCa-2 和 LPc006 细胞中 72 小时后的表达（分别减少了 48%、32% 和 36%）。在 PANC-1 细胞中的生长抑制作用较小，即使暴露于最高浓度 (20 μM) 后仍有超过 50% 的细胞继续增殖。相比之下，MIA-PaCa-2 和 LPc006 细胞更为敏感，IC₀ 值分别为 1±0.3 和 0.1±0.03 μM。此外，在非小细胞肺癌 (NSCLC) 细胞系中，3-Deazaneplanocin A 以剂量依赖性方式抑制细胞增殖，IC₀ 值范围为 0.08 至 0.24 μM。

体内研究

接受 HL-60 细胞诱导的急性髓系白血病 (AML) 的 NOD/SCID 小鼠在接受 3-Deazaneplanocin A 和 Panobinostat (PS) 联合治疗后的存活率显著高于单独使用 PS、3-Deazaneplanocin A 或仅接受溶剂对照的组（P < 0.05）。中位生存期分别为：对照组，42 天；PS 组，42 天；3-Deazaneplanocin A 组，43 天；联合治疗组，52 天。与生理盐水处理的实验小鼠相比，经过 3-Deazaneplanocin A 治疗的小鼠在前三天内体重显著下降（分别为 -2.0%、-4.9% 和 -1.2%），从第四天开始体重增长速率降低至每天 2.6%。

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  (-)-1-<(1R,4R,5S)-3-(Hydroxymethyl)-4,5-dihydroxy-2-cyclopenten-1-yl>-4-chloroimidazo<4,5-c>pyridine 在 镍 氨 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 52.0h， 以52%的产率得到(1S,2R,5R)-5-(4-氨基-1H-咪唑并[4,5-C]吡啶-1-基)-3-羟甲基-3-环戊烯-1,2-二醇
  参考文献：
  名称：

  WO2007/47793

  摘要：

  公开号：

文献信息

• [EN] 3-DEAZANEPLANOCIN DERIVATIVES<br/>[FR] DÉRIVÉS 3-DÉSAZANÉPLANOCINE
  申请人：AGENCY SCIENCE TECH & RES

  公开号：WO2010036213A1

  公开（公告）日：2010-04-01

  This invention describes the series of compounds based on the 3-deazaneplanocin A (DZNep) core structure designed to inhibit the function of Polycomb repressive complex 2 (PRC2) proteins.

  这项发明描述了基于3-去氮烯普拉辛A（DZNep）核心结构的一系列化合物，旨在抑制Polycomb抑制性复合物2（PRC2）蛋白的功能。
• [EN] HETEROCYCLIC COMPOUNDS AND USES THEREOF<br/>[FR] COMPOSÉS HÉTÉROCYCLIQUES ET LEURS UTILISATIONS
  申请人：INFINITY PHARMACEUTICALS INC

  公开号：WO2016054491A1

  公开（公告）日：2016-04-07

  Compounds of formula I' and formula II' and their pharmaceutical compositions that modulate kinase activity, including PI3 kinase activity for the treatment of diseases and conditions associated with kinase activity, including PI3 kinase activity.

  式I'和式II'的化合物及其调节激酶活性的药物组合物，包括用于治疗与激酶活性相关的疾病和状况，包括PI3激酶活性。
• 3-Deazaneplanocin Derivatives
  申请人：Chai Christina L. L.

  公开号：US20110237606A1

  公开（公告）日：2011-09-29

  This invention describes the series of compounds based on the 3-deazaneplanocin A (DZNep) core structure designed to inhibit the function of Polycomb repressive complex 2 (PRC2) proteins.

  这项发明描述了基于3-去氮依普利新A（DZNep）核心结构的一系列化合物，旨在抑制多能性组蛋白抑制复合物2（PRC2）蛋白的功能。
• SALTS AND SOLID FORMS OF ISOQUINOLINONES AND COMPOSITION COMPRISING AND METHODS OF USING THE SAME
  申请人：INFINITY PHARMACEUTICALS, INC.

  公开号：US20160024051A1

  公开（公告）日：2016-01-28

  Solid forms of chemical compounds that modulate kinase activity, including PI3 kinase activity, and compounds, pharmaceutical compositions, and methods of treatment of diseases and conditions associated with kinase activity, including PI3 kinase activity, are described herein. Also provided herein are processes for preparing compounds, solid forms thereof, and pharmaceutical compositions thereof.

  本文描述了调节激酶活性的化合物的固态形式，包括PI3激酶活性，以及与激酶活性相关的疾病和状况的化合物、制药组合物和治疗方法，包括PI3激酶活性。本文还提供了制备化合物、其固态形式和制药组合物的方法。
• Synthesis of 3-deazaneplanocin A analogs and their antiviral activity against RNA-viruses
  作者：Se Myeong Choi、Yeon Jin An、Eun Rang Choi、Ye Eun Nam、Eun Woo Seo、Changhyun Kang、Soo Bin Ahn、Uk-Il Kim、Meehyein Kim、Kyungjin Kim、Jong Hyun Cho

  DOI：10.1016/j.molstruc.2022.134775

  日期：2023.4

  spectrum of biological activity against some cancers and DNA/RNA viruses as a promising inhibitor of the S-adenosyl-L-homocysteine (SAH) hydrolase and the enhancer of zeste homolog 2 (EZH2). Recently, 3-halogenated DZNep analogs were reported as potent inhibitors against RNA viruses as an inhibitor of SAH hydrolase, but 6-halogenated DZNep and its analogs was not studied as an antiviral agent to date

  3-Deazaneplanosin A (DZNep, 2 ) 类似物作为 S-腺苷-L-高半胱氨酸 (SAH) 水解酶抑制剂和 zeste 同系物 2 的增强剂，显示出对某些癌症和 DNA/RNA 病毒具有广泛的生物活性（ EZH2). 最近，据报道 3-卤代 DZNep 类似物作为 SAH 水解酶抑制剂可作为 RNA 病毒的有效抑制剂，但迄今为止尚未研究 6-卤代 DZNep 及其类似物作为抗病毒剂。因此，使用3-脱氮嘌呤衍生物与手性环戊烯-1-醇衍生物( 22a -b ). 通过对先前合成方法的改进程序，从D-核糖中以 50% 的总收率制备了手性22a和22b。此外，3-脱氮嘌呤类似物包括 2,6-二溴-3-脱氮嘌呤30a 、 2,6-二氯-3-脱氮嘌呤30b、6-叠氮基-3-脱氮嘌呤36、N 6 -Bz-3-脱氮嘌呤38a和N如图6所示，N 6 -bisBz-3-脱氮嘌呤38b的合成总收率为