Carboxy Fluorescein-PEG3-Azide

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 苯并吡喃
• 英文名称: Carboxy Fluorescein-PEG3-Azide
• 英文别名: N-[2-[2-[2-(2-azidoethoxy)ethoxy]ethoxy]ethyl]-3',6'-dihydroxy-3-oxospiro[2-benzofuran-1,9'-xanthene]-5-carboxamide
• 化学式: C₂₉H₂₈N₄O₉
• 分子量: 576.563
• InChiKey: ZIMAZYOZIYBRJL-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.2
• 重原子数：
  42
• 可旋转键数：
  13
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.31
• 拓扑面积：
  147
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Carboxy Fluorescein-PEG3-Azide 、 (3-((5-(4-(((4-(prop-2-yn-1-yloxy)benzyl)amino)methyl)phenyl)-2,3-dihydrobenzofuran)-7-sulfonamido)thiophene-2-carbonyl)-L-arginine 在 copper complex 、 lutidine 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 以45%的产率得到
  参考文献：
  名称：

  发现了一种新型荧光化学探针，适用于评估小分子的 Neuropilin-1 结合。

  摘要：

  Neuropilin-1 (NRP1) 正在成为免疫信号传导中的重要分子，已被证明可以调节巨噬细胞和调节性 T 细胞中 TGF-β1 的作用。因此，开发具有成本效益且可靠的 NRP1 结合检测方法非常重要。我们合成了三种新的 NRP1 小分子荧光团，并检查了它们作为荧光偏振探针的性能。DS108 分子表现出良好的结合和荧光特性，使我们能够建立一种适合中高通量筛选小分子的简单测定方法。

  DOI：

  10.1002/ddr.21641
• 作为产物：
  描述：

  1-氨基-11-叠氮-3,6,9-三氧杂十一烷 、 5-羧基荧光素 在 benzotriazol-1-yloxyl-tris-(pyrrolidino)-phosphonium hexafluorophosphate 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 以38.9%的产率得到Carboxy Fluorescein-PEG3-Azide
  参考文献：
  名称：

  发现了一种新型荧光化学探针，适用于评估小分子的 Neuropilin-1 结合。

  摘要：

  Neuropilin-1 (NRP1) 正在成为免疫信号传导中的重要分子，已被证明可以调节巨噬细胞和调节性 T 细胞中 TGF-β1 的作用。因此，开发具有成本效益且可靠的 NRP1 结合检测方法非常重要。我们合成了三种新的 NRP1 小分子荧光团，并检查了它们作为荧光偏振探针的性能。DS108 分子表现出良好的结合和荧光特性，使我们能够建立一种适合中高通量筛选小分子的简单测定方法。

  DOI：

  10.1002/ddr.21641

文献信息

• Recombinant thiopeptides containing noncanonical amino acids
  作者：Xiaozhou Luo、Claudio Zambaldo、Tao Liu、Yuhan Zhang、Weimin Xuan、Chen Wang、Sean A. Reed、Peng-Yu Yang、Rongsheng E. Wang、Tsotne Javahishvili、Peter G. Schultz、Travis S. Young

  DOI：10.1073/pnas.1602733113

  日期：2016.3.29

  subclass of ribosomally synthesized and posttranslationally modified peptides (RiPPs) with complex molecular architectures and an array of biological activities, including potent antimicrobial activity. Here we report the generation of thiopeptides containing noncanonical amino acids (ncAAs) by introducing orthogonal amber suppressor aminoacyl-tRNA synthetase/tRNA pairs into a thiocillin producer...

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