N-(4-(2-(4,7-dichloro-3-hydroxy-2-oxoindolin-3-yl)acetyl)phenyl)-N-methyl-6-(5-((4R)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl)pentanamido)hexanamide

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 生物素及其衍生物
• 英文名称: N-(4-(2-(4,7-dichloro-3-hydroxy-2-oxoindolin-3-yl)acetyl)phenyl)-N-methyl-6-(5-((4R)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl)pentanamido)hexanamide
• 英文别名: N-[4-[2-(4,7-dichloro-3-hydroxy-2-oxo-1H-indol-3-yl)acetyl]phenyl]-N-methyl-6-[5-[(4R)-2-oxo-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoylamino]hexanamide
• 化学式: C₃₃H₃₉Cl₂N₅O₆S
• 分子量: 704.675
• InChiKey: BNRAAOGEEJZWFD-SPHXDRBSSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.4
• 重原子数：
  47
• 可旋转键数：
  15
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.48
• 拓扑面积：
  182
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  Boc-5-氨基戊酸 在 4-二甲氨基吡啶 、 1-羟基苯并三唑 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 二乙胺 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 30.5h， 生成 N-(4-(2-(4,7-dichloro-3-hydroxy-2-oxoindolin-3-yl)acetyl)phenyl)-N-methyl-6-(5-((4R)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl)pentanamido)hexanamide
  参考文献：
  名称：

  尤文氏肉瘤中EWS-FLI1相互作用的小分子干扰物的合成及其构效关系研究

  摘要：

  EWS-FLI1是一种致癌融合蛋白，与尤因氏肉瘤家族肿瘤（ESFT）的发生有关。使用我们先前报道的先导化合物2（YK-4-279），我们设计并合成了集中的类似物库。通过EWS-FLI1 / NR0B1报告荧光素酶测定法和配对细胞筛选方法测量类似物的功能抑制，该配对细胞筛选方法测量对含有EWS-FLI1（TC32和TC71）的人细胞和不含癌蛋白的对照PANC1细胞系对生长抑制的影响。我们的数据表明，苯环上对位上的给电子基团的取代是2的类似物对抑制EWS-FLI1最有利的。化合物9u（具有二甲氨基取代）是活性最高的抑制剂，GI 50 = 0.26±0.1μM。此外，建立了生长抑制（表达EWS-FLI1的TC32细胞）和荧光素酶报道分子活性之间的相关性（R 2＝ 0.84）。最后，我们设计并合成了生物素化的类似物，并确定了对重组EWS-FLI1的结合亲和力（K d = 4.8±2.6μM）。

  DOI：

  10.1021/jm501372p

文献信息

• Synthesis and Structure–Activity Relationship Studies of Small Molecule Disruptors of EWS-FLI1 Interactions in Ewing’s Sarcoma
  作者：Perrer N. Tosso、Yali Kong、Lauren Scher、Ryan Cummins、Jeffrey Schneider、Said Rahim、K. Travis Holman、Jeffrey Toretsky、Kan Wang、Aykut Üren、Milton L. Brown

  DOI：10.1021/jm501372p

  日期：2014.12.26

  EWS-FLI1 is an oncogenic fusion protein implicated in the development of Ewing’s sarcoma family tumors (ESFT). Using our previously reported lead compound 2 (YK-4-279), we designed and synthesized a focused library of analogues. The functional inhibition of the analogues was measured by an EWS-FLI1/NR0B1 reporter luciferase assay and a paired cell screening approach measuring effects on growth inhibition

  EWS-FLI1是一种致癌融合蛋白，与尤因氏肉瘤家族肿瘤（ESFT）的发生有关。使用我们先前报道的先导化合物2（YK-4-279），我们设计并合成了集中的类似物库。通过EWS-FLI1 / NR0B1报告荧光素酶测定法和配对细胞筛选方法测量类似物的功能抑制，该配对细胞筛选方法测量对含有EWS-FLI1（TC32和TC71）的人细胞和不含癌蛋白的对照PANC1细胞系对生长抑制的影响。我们的数据表明，苯环上对位上的给电子基团的取代是2的类似物对抑制EWS-FLI1最有利的。化合物9u（具有二甲氨基取代）是活性最高的抑制剂，GI 50 = 0.26±0.1μM。此外，建立了生长抑制（表达EWS-FLI1的TC32细胞）和荧光素酶报道分子活性之间的相关性（R 2＝ 0.84）。最后，我们设计并合成了生物素化的类似物，并确定了对重组EWS-FLI1的结合亲和力（K d = 4.8±2.6μM）。