2',3'-dideoxy-β-D-5-bromouridine | 28616-93-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 2',3'-dideoxy-β-D-5-bromouridine
• 英文别名: 5-bromo-2',3'-dideoxyuridine；5-bromo-1-(5-hydroxymethyl-tetrahydro-furan-2-yl)-1H-pyrimidine-2,4-dione；5-Bromo-2',3'-dideoxyuridin；5-bromo-1-[(2R,5S)-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 28616-93-5
• 化学式: C₉H₁₁BrN₂O₄
• 分子量: 291.101
• InChiKey: MREZUWMZVPBIEE-CAHLUQPWSA-N

物化性质

• 熔点：
  179-182 °C
• 密度：
  1.773±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.2
• 重原子数：
  16
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.56
• 拓扑面积：
  78.9
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  4

制备方法与用途

用途：抗病毒和抗癌的研究工具。

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  2',3'-二脱氧尿苷 在 吡啶 、 溴 作用下， 以 四氯化碳 为溶剂， 反应 2.0h， 以49%的产率得到2',3'-dideoxy-β-D-5-bromouridine
  参考文献：
  名称：

  嘧啶脱氧核糖核苷的各种3'-叠氮基，3'-氨基，2'，3'-不饱和和2'，3'-二脱氧类似物的合成及抗病毒活性。

  摘要：

  制备了嘧啶脱氧核糖核苷的各种3'-叠氮基，3'-氨基，2'，3'-不饱和，2'，3'-二脱氧和5取代的类似物并针对莫洛尼-鼠白血病病毒（M-MULV ），一种哺乳动物的T淋巴细胞逆转录病毒。在这些化合物中，胸苷的3'-叠氮基类似物，2'-脱氧-5-溴尿苷和2'-脱氧-5-碘尿苷，胸腺嘧啶和2'-脱氧胞苷的2'，3'-不饱和类似物，和2'，3'-二脱氧胞苷的活性最高，ED50分别为0.02、1.5、3.0、2.5、3.7和4.0 microM。这些活性化合物对高达100 microM浓度的宿主SC-1细胞无毒。胸腺嘧啶的3'-叠氮基类似物和2'-脱氧-5-溴尿苷也已在体外针对HTLV-III / LAV / AAV（“ AIDS” 病毒），发现其具有显着活性，ED50值分别为0.23和2.3 microM。讨论了构效关系。

  DOI：

  10.1021/jm00385a033

文献信息

• NMR studies of pyrimidinic nucleosides derived from 2,3-dideoxy-<scp>d</scp> -ribose with inhibitory activity on LINE-1 mobility
  作者：Guillermo Banuelos-Sanchez、Francisco Franco-Montalban、Juan A. Tamayo

  DOI：10.1002/mrc.4942

  日期：2020.1

  their minimal NMR data described in Reference 10. Here in this work, we describe the complete H and C signals assignment of these 36 nucleosides having pyrimidine, 5‐ aza‐pyrimidine, and 6‐aza‐pyrimidine bases with 2,3‐ dideoxy‐D‐ribose, both 5′‐O‐protected and unprotected (1–36), by means of its 2‐D spectra as well as 1D‐NOE experiments. In addition, and as previously reported by Okabe and Lin, we

  嘧啶核苷类似物具有很高的药理学价值。它们显示出非常有用的抗 VIH、乙型肝炎病毒和抗癌活性的抗病毒活性，目前用于治疗这些疾病。鉴于其重要性，许多科学家修改了这些核苷类似物的结构，以寻求改善其特性、靶向特异性、功效并降低其毒性。由于这项研究，一些类似物被描述为具有改进的特性，其中包括源自 2,3-双脱氧-D-核糖的核苷，如齐多夫定 (AZT)、去羟肌苷 (ddI) 和扎西他滨 (ddC)。许多研究人员还研究了这些化合物的核磁共振谱。特别是，他们描述了异头构型对化合物中的 H 和 C NMR 信号的影响，例如，腺苷核苷或异核苷。作为我们抑制转座因子（如 LINE-1）研究的一部分，我们合成了（方案 1）18 种 2',3'-双脱氧核糖核苷性质的核苷类似物（化合物 1-18，图 1）及其相应的前体（化合物 19-36，图 2）和针对哺乳动物 LINE-1 逆转录转座的 1-18 检测，获得了非常
• Synthesis and Characterization of Specific Reverse Transcriptase Inhibitors for Mammalian LINE-1 Retrotransposons
  作者：Guillermo Banuelos-Sanchez、Laura Sanchez、Maria Benitez-Guijarro、Valentin Sanchez-Carnerero、Carmen Salvador-Palomeque、Pablo Tristan-Ramos、Meriem Benkaddour-Boumzaouad、Santiago Morell、Jose L. Garcia-Puche、Sara R. Heras、Francisco Franco-Montalban、Juan A. Tamayo、Jose L. Garcia-Perez

  DOI：10.1016/j.chembiol.2019.04.010

  日期：2019.8

  LINE-1-retroelements use different mechanisms for retrotransposition, although both involve the reverse transcription of an intermediate retroelement-derived RNA. Retrotransposon activity continues to effect the germline and somatic genomes, generating interindividual variability over evolution and potentially influencing cancer and brain physiology, respectively. However, relatively little is known about

  逆转座子是在哺乳动物基因组中扩增到惊人数量的一种可转座元件（TE），包括超过三分之一的人类和小鼠基因组。长时间散布的1类元素（LINE-1或L1）反转录转座子丰富，目前在人类和小鼠基因组中具有活跃的反转录元件。同样，两个基因组中都含有长末端重复序列（LTR）的逆转座子，尽管仅在小鼠中有活性。LTR和LINE-1-逆转录元件使用不同的逆转座子机制，尽管两者都涉及中间逆向元件衍生的RNA的逆转录。反转录转座子的活性继续影响种系和体细胞基因组，在进化过程中产生个体差异，并分别影响癌症和脑部生理。然而，关于逆转座的功能后果知之甚少。在这项研究中，我们已经合成和表征了针对哺乳动物LINE-1逆转座子的逆转录酶抑制剂，这可能有助于破译体内逆转座子的功能。
• PROCESS FOR PREPARING DISULPHIDES AND THIOSULPHINATES AND COMPOUNDS PREPARED
  申请人：Decout Jean-Luc

  公开号：US20090264637A1

  公开（公告）日：2009-10-22

  Process for preparing a compound of the formula (I) R1-S(O) x —S(O) y R2 in which R1 represents a molecular hydrocarbon radical which can be substituted and/or interrupted by one or more atoms and/or by one or more groups containing one or more atoms, said atoms being selected from N, O, P, S, Si and X, where X represents a halogen; R2, independently of R1, represents a carbon-containing group or a molecular hydrocarbon radical which can be substituted and/or interrupted by one or more atoms and/or by one or more groups containing one or more atoms, said atoms being selected from N, O, P, S, Si and X, where X represents a halogen, and x and y are selected from 0 and 1 in such a way that the sum of x and y is not more than 1, characterized in that a compound of formula (II) R1-S(O) x —R3-Si(R4)(R5)(R6) in which R3 represents a hydrocarbon chain of two carbon atoms, which is optionally unsaturated and/or substituted, and R4, R5 and R6, which are identical or different, each represent, independently of one another, a hydrocarbon group, is reacted with a compound of formula (VII) R2-S(O) y —X in which X represents a halogen, intermediate compounds, and compounds prepared.

  制备化合物的过程（I）R1-S(O)x—S(O)yR2的公式，其中R1代表一个可以被一个或多个原子和/或一个或多个含有一个或多个原子的基团取代和/或中断的分子烃基团，所述原子选自N、O、P、S、Si和X，其中X代表一个卤素；独立于R1，R2代表一个含碳基团或一个可以被一个或多个原子和/或一个或多个含有一个或多个原子的基团取代和/或中断的分子烃基团，所述原子选自N、O、P、S、Si和X，其中X代表一个卤素，x和y选自0和1，使得x和y的和不超过1，其特征在于将公式（II）R1-S(O)x—R3-Si(R4)(R5)(R6)中R3代表一个含有两个碳原子的烃链，可以是不饱和和/或取代的，R4、R5和R6，它们相同或不同，每个独立地代表一个烃基团，与公式（VII）R2-S(O)y—X中的X代表一个卤素的化合物反应，中间化合物和制备的化合物。
• THIONUCLEOSIDES AND PHARMACEUTICAL APPLICATIONS
  申请人：Decout Jean-Luc

  公开号：US20100075917A1

  公开（公告）日：2010-03-25

  The invention relates to a pharmaceutical composition containing as an active ingredient at least one compound selected from the compounds of the formula (II), in which the S atom is bonded to the nucleoside carbon at T or to the nucleoside carbon at 3′, and from the compounds of the following formula (III): formulae in which B is a nucleotide natural or modified base, x is 0, 1 or 2, and R1 and R represent a carbonated group or a molecular hydrocarbon remnant that can be substituted and/or interrupted by one or more atoms and/or by one or more groups containing one or more atoms, said atoms being selected from N, O, P, S, Si, X where X is halogen. The invention also relates to pharmaceutically acceptable carrier.

  本发明涉及一种制药组合物，其包含至少一种从式（II）化合物中选择的活性成分，其中S原子连接到T核苷酸碳或3'核苷酸碳，并且从以下式（III）化合物中选择：其中B是核苷酸天然或修饰基，x为0、1或2，R1和R表示碳酸基团或分子烃残基，可以被一个或多个原子和/或一个或多个含有一个或多个原子的基团替代和/或中断，所述原子被选择自N、O、P、S、Si、X，其中X为卤素。本发明还涉及制药可接受载体。
• Use of nucleotide analogs in the analysis of oligonucleotide mixtures and in highly multiplexed nucleic acid sequencing
  申请人：The Trustees of Boston University

  公开号：US20020045178A1

  公开（公告）日：2002-04-18

  Methods and kits that use nucleotide analogs to confer increased accuracy and improved resolution in the analysis and sequencing of oligonucleotide mixtures are provided.

  提供了使用核苷酸类似物提高寡核苷酸混合物分析和测序准确性和分辨率的方法和试剂盒。