Residues critical for substrate binding appear to be conserved glutamine and tyrosine residues that form hydrogen bonds with the carbonyl oxygen at C4, a conserved threonine residue that forms hydrogen bonds with N5, and another conserved threonine residue that forms hydrogen bonds with the carbonyl group at C7. These conserved active site residues were used to identify 24 other genes which are predicted
已经鉴定了两种以前未表征的蛋白质,它们有效地催化
异黄蝶呤和蝶呤 6-
羧酸酯的脱
氨基作用。编码这两种酶的
基因 NYSGXRC-9339a (gi|44585104) 和 NYSGXRC-9236b (gi|44611670),首先从马尾藻海分离的 DNA 中鉴定出来,作为全球海洋采样项目的一部分。
基因被合成,蛋白质随后被表达和纯化。Sgx9339a 的 X 射线结构以 2.7 Å 分辨率测定(蛋白质数据库条目 2PAJ)。该蛋白质折叠为扭曲的 (β/α) 8桶状,在活性部位含有一个
锌离子。这些酶是酰胺
水解酶超家族的成员,属于直系同源群 (COG) 中的 cog0402。cog0402 中的酶先前已被证明可催化
鸟嘌呤、
胞嘧啶、S-
腺苷高半胱
氨酸和 8-氧
鸟嘌呤的脱
氨基作用。蝶啶、
嘌呤和
嘧啶的小型化合物库用于探测催化活性。在该搜索中确定的唯一底物是
异黄蝶呤和蝶呤 6-
羧酸盐。
异黄蝶呤与 Sgx9339a