5'-O-dimethoxytrityluridine phosphoromorpholidite | 129451-67-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5'-O-dimethoxytrityluridine phosphoromorpholidite
• 英文别名: 1-[(3aR,4R,6R,6aR)-6-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-2-morpholin-4-yl-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3,2]dioxaphosphol-4-yl]pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 129451-67-8
• 化学式: C₃₄H₃₆N₃O₉P
• 分子量: 661.648
• InChiKey: PIQFOPWKNIFYLY-JBSILEFSSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.8
• 重原子数：
  47.0
• 可旋转键数：
  10.0
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.35
• 拓扑面积：
  122.71
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  11.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-O-dimethoxytrityluridine phosphoromorpholidite 、 alkaline earth salt of/the/ methylsulfuric acid 生成 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-氨基嘌呤-9-基)-3,4-二羟基四氢呋喃-2-基]甲基[(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-二氧代嘧啶-1-基)-4-羟基-2-(羟基甲基)四氢呋喃-3-基]磷酸氢酯
  参考文献：
  名称：

  Convenient Syntheses of Oligoribonucleotides Having 2′-5′ and/or 3′-5′ Phosphodiester Linkage

  摘要：

  通过在固体支持物上使用受 5′保护的核糖核苷 2′,3′-环磷酰胺，合成了具有 2′-5′和/或 3′-5′-磷酸二酯连接的序列确定的寡核苷酸。在偶联反应中，作为催化剂的唑的 pKa 对活化起决定作用。所得到的 2′-5′和/或 3′-5′连接的寡核苷酸很容易通过反相色谱法分离。

  DOI：

  10.1246/cl.1990.959
• 作为产物：
  描述：

  吗啉基磷酰二氯 、 5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)尿苷 在 2,6-二甲基吡啶 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 0.33h， 以31%的产率得到5'-O-dimethoxytrityluridine phosphoromorpholidite
  参考文献：
  名称：

  Convenient Syntheses of Oligoribonucleotides Having 2′-5′ and/or 3′-5′ Phosphodiester Linkage

  摘要：

  通过在固体支持物上使用受 5′保护的核糖核苷 2′,3′-环磷酰胺，合成了具有 2′-5′和/或 3′-5′-磷酸二酯连接的序列确定的寡核苷酸。在偶联反应中，作为催化剂的唑的 pKa 对活化起决定作用。所得到的 2′-5′和/或 3′-5′连接的寡核苷酸很容易通过反相色谱法分离。

  DOI：

  10.1246/cl.1990.959

文献信息

• OZAKI, HIROAKI;NAKAMOTO, AKIO;SHIMIDZU, TAKEO, CHEM. LETT.,(1990) N, C. 959-962
  作者：OZAKI, HIROAKI、NAKAMOTO, AKIO、SHIMIDZU, TAKEO

  DOI：——

  日期：——