D,D-U(2'-5')pA | 10453-52-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷酸
• 英文名称: D,D-U(2'-5')pA
• 英文别名: U2'p5'A；[5']adenylic acid uridin-2'-yl ester；[5']Adenylsaeure-uridin-2'-ylester；Uridylyl-2'-5'-phospho-adenosine；[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl [(2R,3R,4R,5R)-2-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate
• CAS: 10453-52-8
• 化学式: C₁₉H₂₄N₇O₁₂P
• 分子量: 573.413
• InChiKey: QARCCHXXGAIRFS-KPKSGTNCSA-N

物化性质

• 密度：
  2.23±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -4.8
• 重原子数：
  39
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.53
• 拓扑面积：
  274
• 氢给体数：
  7
• 氢受体数：
  16

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-氨基嘌呤-9-基)-3,4-二羟基四氢呋喃-2-基]甲基[(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-二氧代嘧啶-1-基)-4-羟基-2-(羟基甲基)四氢呋喃-3-基]磷酸氢酯 以 水 为溶剂， 生成 D,D-U(2'-5')pA
  参考文献：
  名称：

  尿嘧啶-（3'，5'）-8-羧甲基氨基腺苷的磷酸二酯键被水合氢氧根，氢氧根和锌（II）离子裂解：模型研究旨在阐明羧酸盐作为分子内催化剂的潜力。

  摘要：

  合成了铀酰-（3'，5'）-8-羧甲基氨基腺苷，并且研究了在有和没有Zn2 +离子的情况下将其酯交换为尿苷2'，3'-环状磷酸酯。结果表明，磷酸二酯键附近的羧酸盐功能促进金属离子促进的裂解，但不促进金属离子非依赖性反应。在酸性条件下，主要反应是侧链的裂解，得到8-氨基衍生物。

  DOI：

  10.1080/15257770008045452

文献信息

• A Nucleotide Dimer Synthesis Without Protecting Groups Using Montmorillonite as Catalyst
  作者：Prakash C. Joshi、Michael F. Aldersley、Dmitri V. Zagorevskii、James P. Ferris

  DOI：10.1080/15257770.2012.701787

  日期：2012.7

  including heterochiral and chimeric syntheses. This greener chemistry has enabled the synthesis of dimers from activated nucleotides themselves, activated nucleotides with nucleosides, and activated nucleotides with nucleotide 5′-monophosphates. [Supplemental materials are available for this article. Go to the publisher's online edition of Nucleosides, Nucleotides & Nucleic Acids to view the free supplemental

  已经开发了提供包含天然或非天然核苷残基的核苷酸二聚体的合成。在不存在保护基的情况下，将核糖核苷5'-磷酰胺基咪唑化物添加到吸附在蒙脱石上的核苷中性pH下。大约30％的咪唑化物被转化为2'-5'二聚体和3'-5'二聚体，其余的则被水解为5'-单磷酸酯。通过多种组合进行的实验表明，该方法可能会受到限制，包括杂手性和嵌合合成。这种绿色化学方法使得能够从活化的核苷酸本身，具有核苷的活化核苷酸和具有核苷酸5'-单磷酸酯的活化核苷酸合成二聚体。 [本文提供补充材料。转到发布者的在线版《核苷酸，核苷酸和核酸》以查看免费的补充文件。]
• Natural Occurrence of 2′,5′-Linked Heteronucleotides in Marine Sponges
  作者：Annika Lopp、Tönu Reintamm、Anne Kuusksalu、Indrek Tammiste、Arno Pihlak、Merike Kelve

  DOI：10.3390/md8020235

  日期：——

  muricata and Chondrilla nucula are able to catalyze in vivo synthesis of 2-5A as well as the synthesis of a series 2',5'-linked heteronucleotides which accompanied high levels of 2',5'-diadenylates. In dephosphorylated perchloric acid extracts of the sponges, these heteronucleotides were identified as A2'p5'G, A2' p5'U, A2'p5'C, G2'p5'A and G2' p5'U. The natural occurrence of 2'-adenylated NAD(+) was also

  2',5'-寡聚腺苷酸合成酶 (OAS) 作为哺乳动物干扰素诱导的抗病毒酶系统的组成部分，催化细胞 ATP 寡聚化为 2',5'-连接的寡聚腺苷酸 (2-5A)。尽管脊椎动物 OAS 在体外条件下已被表征为 2'-核苷酸转移酶，但从未证明 2-5A 以外的 2',5'-寡核苷酸的自然存在。在这里，我们已经证明来自海洋海绵 Thenea muricata 和 Chondrilla nucula 的 OAS 能够催化 2-5A 的体内合成以及一系列 2',5' 连接的杂核苷酸的合成，这些杂核苷酸伴随着高水平的 2'， 5'-二腺苷酸。在海绵的去磷酸化高氯酸提取物中，这些异核苷酸被鉴定为 A2'p5'G、A2'p5'U、A2' p5'C、G2'p5'A 和 G2'p5'U。还检测到 2'-腺苷酸化 NAD(+) 的自然发生。体外试验表明，除了 ATP 外，GTP 还是海绵 OAS 的良好底物，尤其是来自
• OZAKI, HIROAKI;NAKAMOTO, AKIO;SHIMIDZU, TAKEO, CHEM. LETT.,(1990) N, C. 959-962
  作者：OZAKI, HIROAKI、NAKAMOTO, AKIO、SHIMIDZU, TAKEO

  DOI：——

  日期：——