5-(3-acetamidophenyl)ethynyl-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-4N-methyl-2'-deoxycytidine | 1258747-65-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5-(3-acetamidophenyl)ethynyl-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-4N-methyl-2'-deoxycytidine
• CAS: 1258747-65-7
• 化学式: C₄₁H₄₀N₄O₇
• 分子量: 700.791
• InChiKey: YQIVGCXRDRRIBA-YXWIYCFASA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.32
• 重原子数：
  52.0
• 可旋转键数：
  11.0
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.24
• 拓扑面积：
  133.17
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  10.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-(3-acetamidophenyl)ethynyl-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-4N-methyl-2'-deoxycytidine 在 copper(l) iodide 、 三乙胺 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 N-[3-[3-[(2R,4S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-[2-cyanoethoxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxyoxolan-2-yl]-7-methyl-2-oxopyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl]phenyl]acetamide
  参考文献：
  名称：

  CG base pair recognition within DNA triple helices by modified N-methylpyrrolo-dC nucleosides

  摘要：

  合成了双环核苷 N-甲基-3H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-2(7H)-酮的 3-氨基苯基修饰类似物，并将其直接加入三聚体形成的寡核苷酸中，以利用其扩展的氢键结构识别 CG 碱基对。在 pH 值为 6.2 到 7.0 的范围内，所有类似物都表现出很强的结合亲和力和对 CG 的很好的选择性；与以前的修饰相比有了明显的改进。

  DOI：

  10.1039/c0ob00119h
• 作为产物：
  描述：

  3'-O-acetyl-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-5-iodo-2'-deoxyuridine 在 N-甲基咪唑 、 copper(l) iodide 、 三乙胺 、 三氯氧磷 作用下， 以 吡啶 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 1.17h， 生成 5-(3-acetamidophenyl)ethynyl-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-4N-methyl-2'-deoxycytidine
  参考文献：
  名称：

  CG base pair recognition within DNA triple helices by modified N-methylpyrrolo-dC nucleosides

  摘要：

  合成了双环核苷 N-甲基-3H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-2(7H)-酮的 3-氨基苯基修饰类似物，并将其直接加入三聚体形成的寡核苷酸中，以利用其扩展的氢键结构识别 CG 碱基对。在 pH 值为 6.2 到 7.0 的范围内，所有类似物都表现出很强的结合亲和力和对 CG 的很好的选择性；与以前的修饰相比有了明显的改进。

  DOI：

  10.1039/c0ob00119h