5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-3'-O-acetyl-5-[N-(trifluoroacetyl)aminomethyl]-2'-deoxyuridine | 1357476-39-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-3'-O-acetyl-5-[N-(trifluoroacetyl)aminomethyl]-2'-deoxyuridine
• CAS: 1357476-39-1
• 化学式: C₃₅H₃₄F₃N₃O₉
• 分子量: 697.665
• InChiKey: JERHVIIACTVFNK-FRXPANAUSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.96
• 重原子数：
  50.0
• 可旋转键数：
  12.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.31
• 拓扑面积：
  147.18
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  10.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-3'-O-acetyl-5-[N-(trifluoroacetyl)aminomethyl]-2'-deoxyuridine 在 吡啶 、 ammonium hydroxide 、 三正丁胺 、 bis(tri-n-butylammonium) pyrophosphate 、 水 、 碘 、 溶剂黄146 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 4.75h， 生成 5-aminomethyl-2'-deoxyuridine triphosphate
  参考文献：
  名称：

  A divalent metal-dependent self-cleaving DNAzyme with a tyrosine side chain

  摘要：

  酶促结合的苯酚修饰的2′-脱氧尿苷三磷酸产生了一个修饰过的DNA文库，该文库随后用于在二价锌和镁阳离子的存在下进行体外选择，以筛选能够裂解核糖磷酸二酯的DNA酶。在经过11轮选择后，克隆和测序得到14个不同的序列，其中活性最强的是Dz11-17PheO。Dz11-17PheO在室温下的10 mM Mg2+和1 mM Zn2+存在下，自我裂解一个嵌入式核糖胞苷的观察速率常数为0.20 ± 0.02 min−1。在低浓度的Hg2+阳离子和稍高浓度的Eu3+阳离子下，其活性受到抑制。

  DOI：

  10.1039/c1ob05359k
• 作为产物：
  描述：

  在 氨 、 三乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 4.5h， 生成 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-3'-O-acetyl-5-[N-(trifluoroacetyl)aminomethyl]-2'-deoxyuridine
  参考文献：
  名称：

  A divalent metal-dependent self-cleaving DNAzyme with a tyrosine side chain

  摘要：

  酶促结合的苯酚修饰的2′-脱氧尿苷三磷酸产生了一个修饰过的DNA文库，该文库随后用于在二价锌和镁阳离子的存在下进行体外选择，以筛选能够裂解核糖磷酸二酯的DNA酶。在经过11轮选择后，克隆和测序得到14个不同的序列，其中活性最强的是Dz11-17PheO。Dz11-17PheO在室温下的10 mM Mg2+和1 mM Zn2+存在下，自我裂解一个嵌入式核糖胞苷的观察速率常数为0.20 ± 0.02 min−1。在低浓度的Hg2+阳离子和稍高浓度的Eu3+阳离子下，其活性受到抑制。

  DOI：

  10.1039/c1ob05359k