N-苯甲酰基-3’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-脱氧腺苷 | 140712-79-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 中文名称: N-苯甲酰基-3’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-脱氧腺苷
• 英文名称: N-benzoyl-3'-O-[bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methyl]-2'-deoxyadenosine
• 英文别名: N6-Benzoyl-3'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-deoxyadenosine；N-[9-[(2R,4S,5R)-4-[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]purin-6-yl]benzamide
• CAS: 140712-79-4
• 化学式: C₃₈H₃₅N₅O₆
• 分子量: 657.726
• InChiKey: LFXBQKFIXWICJR-WIHCDAFUSA-N

物化性质

• 熔点：
  125-126 °C
• 密度：
  1.32±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.8
• 重原子数：
  49
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.21
• 拓扑面积：
  130
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-苯甲酰基-3’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-脱氧腺苷 在 吡啶 、 sodium hydride 作用下， 以 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 36.0h， 生成 {(2R,3S,5R)-5-(6-Benzoylamino-purin-9-yl)-3-[bis-(4-methoxy-phenyl)-phenyl-methoxy]-tetrahydro-furan-2-ylmethoxymethyl}-phosphonic acid monomethyl ester
  参考文献：
  名称：

  核苷-O-甲基膦酸酯：修饰寡核苷酸的单体池

  摘要：

  四种天然 2'-脱氧核糖核苷、1-（2-脱氧-β-D-苏式-戊呋喃糖基）胸腺嘧啶、5'-O- 和 2' 的一组独特的 5'-O- 和 3'-O-膦酰基甲基衍生物1-(3-脱氧-β-D-赤型-戊呋喃糖基)胸腺嘧啶和1-(3-脱氧-β-D-苏式-戊呋喃糖基)胸腺嘧啶的-O-膦酰基甲基衍生物已被合成为单体库修饰寡核苷酸的合成。膦酸酯部分用 4-甲氧基-1-氧化-2-吡啶基甲酯基团保护，在偶联步骤中也作为分子内催化剂。

  DOI：

  10.1081/ncn-200033912
• 作为产物：
  描述：

  N-苯甲酰基-2’-脱氧腺苷 在 吡啶 、 四丁基氟化铵 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 为溶剂， 生成 N-苯甲酰基-3’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)-2’-脱氧腺苷
  参考文献：
  名称：

  核苷-O-甲基膦酸酯：修饰寡核苷酸的单体池

  摘要：

  四种天然 2'-脱氧核糖核苷、1-（2-脱氧-β-D-苏式-戊呋喃糖基）胸腺嘧啶、5'-O- 和 2' 的一组独特的 5'-O- 和 3'-O-膦酰基甲基衍生物1-(3-脱氧-β-D-赤型-戊呋喃糖基)胸腺嘧啶和1-(3-脱氧-β-D-苏式-戊呋喃糖基)胸腺嘧啶的-O-膦酰基甲基衍生物已被合成为单体库修饰寡核苷酸的合成。膦酸酯部分用 4-甲氧基-1-氧化-2-吡啶基甲酯基团保护，在偶联步骤中也作为分子内催化剂。

  DOI：

  10.1081/ncn-200033912

文献信息

• Methyl 4-toluenesulfonyloxymethylphosphonate, a new and versatile reagent for the convenient synthesis of phosphonate-containing compounds
  作者：Ivana Kóšiová、Zdeněk Točík、Miloš Buděšínský、Ondřej Šimák、Radek Liboska、Dominik Rejman、Ondřej Pačes、Ivan Rosenberg

  DOI：10.1016/j.tetlet.2009.09.062

  日期：2009.12

  A straightforward procedure leading to the new phosphonylating reagent, methyl 4-toluenesulfonyloxymethylphosphonate, requiring no chromatographic purification is described. This stable reagent works with the same efficiency as dimethyl and other dialkyl esters for the introduction of an O-phosphonomethyl moiety while, in contrast to dimethyl ester, it does not cause any unwanted methylation of sensitive

  描述了一种无需新的色谱纯化方法即可直接产生新的膦酰化试剂4-甲苯磺酰氧基甲基膦酸甲酯的方法。对于引入O-膦酰基甲基部分，该稳定的试剂与二甲基和其他二烷基酯具有相同的效率，而与二甲基酯相反，它不会引起敏感官能团的任何不希望的甲基化。举例说明了其以高产率用于被保护的核苷的烷基化的效用。
• 3'3' CYCLIC DINUCLEOTIDES WITH AN ALKENYLENE
  申请人：Institute of Organic Chemistry and Biochemistry ASCR, V.V.I.

  公开号：EP3936514A1

  公开（公告）日：2022-01-12

  The present disclosure relates to 3'3' cyclic phosphonate dinucleotides of general formula (J), their pharmaceutically acceptable salts, their pharmaceutical composition and combinations of said substances and other medicaments or pharmaceuticals. The disclosure also relates to the use of said compounds for the treatment or prevention of diseases or conditions modifiable by STING protein modulation, such as cancer or viral, allergic and inflammatory diseases. In addition, these substances can be used as adjuvants in vaccines.

  本公开涉及一般式（J）的3'3'环磷酸二核苷酸，其药用盐，其药物组合物以及所述物质与其他药物或药品的组合物。该公开还涉及利用所述化合物治疗或预防可通过STING蛋白调节改变的疾病或症状，如癌症或病毒性、过敏性和炎症性疾病。此外，这些物质可用作疫苗的辅助剂。
• Method for purifying 5' -protected 2' -deoxypurine nucleosides
  申请人：——

  公开号：US20030009028A1

  公开（公告）日：2003-01-09

  A method for efficiently purifying 5′ protected 2′-deoxypurine nucleosides, efficient production of which has previously been difficult. Impurities can be separated by obtaining the 5′ protected 2′-deoxypurine nucleoside as an inclusion crystal including a solvent such as that having a nitrile structure in order to purify the 5′ protected 2′-deoxypurine nucleoside at a high purity. This invention enables synthesis of highly purified protected deoxypurine nucleosides easily on a large scale, which has previously been performed by column chromatography method.

  一种用于高效纯化5′保护的2′-去氧嘌呤核苷的方法，先前其高效生产曾经困难。通过获得含有类似腈结构的溶剂的包含晶体，可将杂质分离以纯化5′保护的2′-去氧嘌呤核苷。该发明使得在大规模上轻松合成高纯度的保护去氧嘌呤核苷成为可能，而此前通常通过柱层析法进行。
• Method for purifying 5′-protected 2′-deoxypurine nucleosides
  申请人：Komatsu Hironori

  公开号：US06958391B2

  公开（公告）日：2005-10-25

  A method for efficiently purifying 5′ protected 2′-deoxypurine nucleosides, efficient production of which has previously been difficult. Impurities can be separated by obtaining the 5′ protected 2′-deoxypurine nucleoside as an inclusion crystal including a solvent such as that having a nitrile structure in order to purify the 5′ protected 2′-deoxypurine nucleoside at a high purity. This invention enables synthesis of highly purified protected deoxypurine nucleosides easily on a large scale, which has previously been performed by column chromatography method.

  一种高效纯化5'保护的2'-脱氧嘌呤核苷的方法，其高效生产先前曾经困难。通过获得包括具有腈结构的溶剂的包含晶体，可以分离杂质，以便高纯度地纯化5'保护的2'-脱氧嘌呤核苷。这项发明使得高纯度保护的脱氧嘌呤核苷易于大规模合成，这先前是通过柱层析法进行的。
• Method for purifying 5′ -protected 2′ -deoxypurine nucleosides
  申请人：Mitsui Chemicals, Inc.

  公开号：US07074917B2

  公开（公告）日：2006-07-11

  A method for efficiently purifying 5′ protected 2′-deoxypurine nucleosides, efficient production of which has previously been difficult. Impurities can be separated by obtaining the 5′ protected 2′-deoxypurine nucleoside as an inclusion crystal including a solvent such as that having a nitrile structure in order to purify the 5′ protected 2′-deoxypurine nucleoside at a high purity. This invention enables synthesis of highly purified, protected deoxypurine nucleosides easily on a large scale, which has previously been performed by column chromatography method.

  一种高效纯化5'保护的2'-去氧嘌呤核苷的方法，此前其高效生产一直很困难。可以通过得到包含有类似于腈的溶剂的包含晶体的5'保护的2'-去氧嘌呤核苷来分离杂质，以高纯度纯化5'保护的2'-去氧嘌呤核苷。这项发明使得高度纯化的保护去氧嘌呤核苷易于大规模合成，而此前一直采用柱层析法进行合成。