N-[1-[(2R,3R,4R,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-3-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-4-hydroxyoxolan-2-yl]-5-iodo-2-oxopyrimidin-4-yl]benzamide | 256493-90-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: N-[1-[(2R,3R,4R,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-3-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-4-hydroxyoxolan-2-yl]-5-iodo-2-oxopyrimidin-4-yl]benzamide
• CAS: 256493-90-0
• 化学式: C₄₃H₄₈IN₃O₈Si
• 分子量: 889.859
• InChiKey: QFVDMHFIVZCMEW-JCQXPJLASA-N

物化性质

• 密度：
  1.35±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7.77
• 重原子数：
  56
• 可旋转键数：
  14
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.33
• 拓扑面积：
  128
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-氰乙基N,N-二异丙基氯亚磷酰胺 、 N-[1-[(2R,3R,4R,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-3-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-4-hydroxyoxolan-2-yl]-5-iodo-2-oxopyrimidin-4-yl]benzamide 在 4-二甲氨基吡啶 、 二异丙胺 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 以53%的产率得到N-[1-[(2R,3R,4R,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-3-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-4-[2-cyanoethoxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxyoxolan-2-yl]-5-iodo-2-oxopyrimidin-4-yl]benzamide
  参考文献：
  名称：

  The synthesis of 5-iodocytidine phosphoramidite for heavy atom derivatization of RNA

  摘要：

  The synthesis of an RNA phosphoramidite of 5-iodocytidine is reported. This heavy atom cytidine derivative was incorporated into four RNAs. Oligoribonucleotides with 5-iodocytidine will be useful for solving the X-ray crystallographic phase problem and for photochemical cross-linking studies. (C) 1999 Elsevier Science Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/s0040-4039(99)01650-0
• 作为产物：
  描述：

  胞苷 在 咪唑 、 水 、 碘 、 碘酸 、 三乙胺 作用下， 以 吡啶 、 甲醇 、 四氯化碳 、 水 、 溶剂黄146 为溶剂， 反应 24.5h， 生成 N-[1-[(2R,3R,4R,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-3-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-4-hydroxyoxolan-2-yl]-5-iodo-2-oxopyrimidin-4-yl]benzamide
  参考文献：
  名称：

  The synthesis of 5-iodocytidine phosphoramidite for heavy atom derivatization of RNA

  摘要：

  The synthesis of an RNA phosphoramidite of 5-iodocytidine is reported. This heavy atom cytidine derivative was incorporated into four RNAs. Oligoribonucleotides with 5-iodocytidine will be useful for solving the X-ray crystallographic phase problem and for photochemical cross-linking studies. (C) 1999 Elsevier Science Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/s0040-4039(99)01650-0