phosphoenol pyruvate

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 有机磷酸及其衍生物
• 英文名称: phosphoenol pyruvate
• 英文别名: PEP；1-Carboxyethenyl phosphate
• 化学式: C₃H₃O₆P
• 分子量: 166.027
• InChiKey: DTBNBXWJWCWCIK-UHFFFAOYSA-L

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.5
• 重原子数：
  10
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.0
• 拓扑面积：
  110
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  phosphoenol pyruvate 、 L-色氨酸 在 tryptophan lyase wild type 、 S-腺苷-L-蛋氨酸 、 连二亚硫酸盐 、 phosphoenolpyruvate carboxylase 、 magnesium chloride 作用下， 以 aq. phosphate buffer 、 重水 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 2-氧代丁二酸
  参考文献：
  名称：

  色氨酸裂解酶 (NosL) 的机理研究：氰化物作为反应产物的鉴定

  摘要：

  色氨酸裂解酶 (NosL) 催化 3-甲基吲哚-2-羧酸和 3-甲基吲哚从 l-色氨酸形成。在本文中，我们提供了支持甲酸自由基中间体的证据，并证明氰化物是 NosL 催化与 l-色氨酸反应的副产物。这些实验需要对 NosL 机制进行重大修改，并揭示 NosL 和 HydG 之间的意外联系，HydG 是一种自由基 SAM 酶，在 [Fe-Fe] 氢化酶的金属簇生物合成过程中，由酪氨酸形成氰化物和一氧化碳。

  DOI：

  10.1021/jacs.7b09000
• 作为试剂：
  描述：

  [6-14C]D-glucose 、 乳清酸 在 glucose-6-phosphate dehydrogenase 、 双甘肽 、 phosphoriboisomerase 、 L-glutamic acid dehydrogenase 、 6-磷酸葡萄糖脱氢酶 、 2-氧代-戊二酸离子(2-) 、 烟酰胺腺嘌呤双核苷酸磷酸盐 、 phosphoenol pyruvate 、 5’-三磷酸腺苷 、 hexokinase 作用下， 反应 20.0h， 生成 [5'-(14)C]-orotidine 5'-monophosphate
  参考文献：
  名称：

  Zhang, Yong; Luo, Minkui; Schramm, Vern L., Journal of the American Chemical Society, 2009, vol. 131, p. 4685 - 4694

  摘要：

  DOI：

文献信息

• Caged CO₂for the Direct Observation of CO₂-Consuming Reactions
  作者：Katharina Lommel、Gabriela Schäfer、Konstantin Grenader、Christoph Ruland、Andreas Terfort、Werner Mäntele、Georg Wille

  DOI：10.1002/cbic.201200659

  日期：2013.2.11

  How to see CO2 too: Photodecarboxylation of 3‐nitrophenyl acetic acid has been used to release CO2 in aqueous thin‐layer samples. CO2 and its reactions can then be measured directly and conveniently by time‐resolved infrared spectroscopy.

  如何看到CO 2 太：3-硝基苯基乙酸Photodecarboxylation已被用来释放CO 2的水薄层样品英寸 然后可以通过时间分辨红外光谱法直接，方便地测量CO 2及其反应。
• Conformational Dynamics and Allostery in Pyruvate Kinase
  作者：Katherine A. Donovan、Shaolong Zhu、Peter Liuni、Fen Peng、Sarah A. Kessans、Derek J. Wilson、Renwick C.J. Dobson

  DOI：10.1074/jbc.m115.676270

  日期：2016.4

  mass spectrometry coupled to hydrogen-deuterium exchange studies, followed by mutagenic analysis to test the activation mechanism. Global exchange experiments, supported by thermostability studies, demonstrate that fructose-1,6-bisphosphate binding to the allosteric domain causes a shift towards a globally more dynamic ensemble of conformations. Mapping deuterium exchange to peptides within the enzyme

  丙酮酸激酶催化糖酵解的最后一步，并且被变构调节以控制通过该途径的通量。提出了两个模型来解释大肠埃希氏大肠杆菌丙酮酸激酶类型是如何变构调节的：“结构域旋转模型”表明，单体中的结构域和四聚体中的单体都彼此重新定向；“刚性体重新定向模型”仅提出四聚体中单体的重新定向，从而导致活性位点刚性化。为了测试这些假设并阐明驱动构象的构象和动态变化，我们进行了时间分辨电喷雾电离质谱联用氢-氘交换研究，然后进行了诱变分析以测试激活机制。全球交流实验 在热稳定性研究的支持下，证明果糖1，，6-二磷酸结合到变构域会导致向构象的整体动态变化转变。将氘交换映射到酶内的肽突出显示具有改变的构象动力学的位点特异性区域，其中许多构象灵活性增加。基于这些和诱变研究，我们提出了一种变构机制，据此，果糖1,6-双磷酸酯的结合破坏了在单体单元中桥接变构和活性位点域的α-螺旋。这使（beta / alpha）8-桶结构域和负责底物结