N⁴-bis(aminopropyl)spermidine

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氮化合物
• 英文名称: N⁴-bis(aminopropyl)spermidine
• 英文别名: N(4)-bis(aminopropyl)spermidine(1+)；4-aminobutyl-tris(3-aminopropyl)azanium
• 化学式: C₁₃H₃₄N₅
• 分子量: 260.446
• InChiKey: FMTAVYOBEGHWPT-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.7
• 重原子数：
  18
• 可旋转键数：
  13
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  1.0
• 拓扑面积：
  104
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  亚精胺 在 branched-chain polyamine synthase from Thermococcus kodakarensis 、 sodium hydroxide 作用下， 以 aq. buffer 为溶剂， 生成 N⁴-bis(aminopropyl)spermidine
  参考文献：
  名称：

  新型氨基丙基转移酶用于高嗜热菌特异性支链多胺生物合成的活性位点几何。

  摘要：

  支链多胺仅存在于嗜热细菌和Euryarchaeota中，并在高温下起着至关重要的作用。在本研究中，对超嗜热古细菌Thermococcus kodakarensis（Tk-BpsA）的支链多胺合酶进行了动力学分析，结果表明，通过顺序添加脱羧的S-腺苷甲硫氨酸（dcSAM）可以产生N4-双（氨基丙基）亚精胺。氨丙基为亚精胺，通过双功能催化作用。Tk-BpsA催化线性链多胺亚精胺，亚精胺，去甲精胺和叔支链多胺N4-氨基丙基亚精胺和N4-氨基丙基正精胺的氨丙基化，但不催化短链二胺，腐胺和尸胺 提示Tk-BpsA不能催化二胺的伯氨基的氨丙基化。在存在或不存在底物亚精胺和dcSAM的情况下，Tk-BpsA的X射线结构分析表明，较大的带负电荷的空腔是支链分支底物结合的原因。该结合不同于线性多胺亚精胺/亚精胺合酶的活性位点，并且在亚精胺结合后发生闭环。根据结构分析，对各种突变体进行了进一步的动力学研究，揭

  DOI：

  10.1111/febs.14262

文献信息

• Active site geometry of a novel aminopropyltransferase for biosynthesis of hyperthermophile-specific branched-chain polyamine
  作者：Ryota Hidese、Ka Man Tse、Seigo Kimura、Eiichi Mizohata、Junso Fujita、Yuhei Horai、Naoki Umezawa、Tsunehiko Higuchi、Masaru Niitsu、Tairo Oshima、Tadayuki Imanaka、Tsuyoshi Inoue、Shinsuke Fujiwara

  DOI：10.1111/febs.14262

  日期：——

  of Tk-BpsA in the presence or absence of the substrates spermidine and dcSAM revealed that a large, negatively charged cavity is responsible for the binding of branched-chain substrates. The binding is different from that in the active site of linear polyamine spermidine/spermine synthases, and loop-closures occur upon the binding of spermidine. Based on structural analyses, further kinetic studies

  支链多胺仅存在于嗜热细菌和Euryarchaeota中，并在高温下起着至关重要的作用。在本研究中，对超嗜热古细菌Thermococcus kodakarensis（Tk-BpsA）的支链多胺合酶进行了动力学分析，结果表明，通过顺序添加脱羧的S-腺苷甲硫氨酸（dcSAM）可以产生N4-双（氨基丙基）亚精胺。氨丙基为亚精胺，通过双功能催化作用。Tk-BpsA催化线性链多胺亚精胺，亚精胺，去甲精胺和叔支链多胺N4-氨基丙基亚精胺和N4-氨基丙基正精胺的氨丙基化，但不催化短链二胺，腐胺和尸胺 提示Tk-BpsA不能催化二胺的伯氨基的氨丙基化。在存在或不存在底物亚精胺和dcSAM的情况下，Tk-BpsA的X射线结构分析表明，较大的带负电荷的空腔是支链分支底物结合的原因。该结合不同于线性多胺亚精胺/亚精胺合酶的活性位点，并且在亚精胺结合后发生闭环。根据结构分析，对各种突变体进行了进一步的动力学研究，揭
• Processes and host cells for genome, pathway, and biomolecular engineering
  申请人：enEvolv, Inc.

  公开号：US10370654B2

  公开（公告）日：2019-08-06

  The present disclosure provides compositions and methods for genomic engineering.

  本公开提供了基因组工程的组合物和方法。
• PROCESSES AND HOST CELLS FOR GENOME, PATHWAY, AND BIOMOLECULAR ENGINEERING
  申请人：ENEVOLV, INC.

  公开号：US20160186168A1

  公开（公告）日：2016-06-30

  The present disclosure provides compositions and methods for genomic engineering.
• US9944925B2
  申请人：——

  公开号：US9944925B2

  公开（公告）日：2018-04-17
• The C‐terminal flexible region of branched‐chain polyamine synthase facilitates substrate specificity and catalysis
  作者：Ryota Hidese、Masataka Toyoda、Ken‐ichi Yoshino、Wakao Fukuda、Gita Adhirani Wihardja、Seigo Kimura、Junso Fujita、Masaru Niitsu、Tairo Oshima、Tadayuki Imanaka、Eiichi Mizohata、Shinsuke Fujiwara

  DOI：10.1111/febs.14949

  日期：2019.10

  to two of five aspartate/glutamate residues (Glu339 , Asp342 , Asp343 , Glu344 , and Glu345 ) in the C-terminal flexible region. Mutating each of these five amino acid residues to asparagine/glutamine resulted in a slight decrease in activity. The quadruple mutant D342N/D343N/E344Q/E345Q exhibited a severe reduction in catalytic efficiency, suggesting that these aspartate/glutamate residues function

  支链多胺合酶（BpsA）催化从供体脱羧S-腺苷甲硫氨酸（dcSAM）到受体线性链多胺的连续氨丙基转移，从而通过叔支化多胺中间体生产季支化多胺。在这里，我们分析了嗜热栖热菌的Tth-BpsA的催化性质和X射线晶体结构，并将其与来自柯达卡热栖热球菌的Tk-BpsA的催化性质和X射线晶体结构进行了比较，揭示了这两种酶之间受体底物特异性和C端结构的差异。为了研究C末端柔性区在受体识别中的作用，将Tth-BpsA中的区域（QDEEATTY）替换为Tk-BpsA（YDDEESSTT）中的区域，以创建嵌合的Tth-BpsA C9，其显示出对N4-氨基丙基去甲精胺的催化效率严重降低，但对N4-氨基丙基亚精胺的催化效率却没有降低，从而模仿了Tk-BpsA底物特异性。Tth-BpsA C9 Tyr346和Thr354有助于区分三级支链多胺底物，表明BpsA的C端区域识别受体底物。在Tk-BpsA反应混合物和d