pradimicinone II

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 并四苯
• 英文名称: pradimicinone II
• 英文别名: (2R)-2-[[(5S,6S)-1,5,6,7,9,14-hexahydroxy-11-methoxy-3-methyl-8,13-dioxo-5,6-dihydrobenzo[a]tetracene-2-carbonyl]amino]propanoic acid
• 化学式: C₂₈H₂₃NO₁₂
• 分子量: 565.49
• InChiKey: SBIJXMUETDVEQB-PMUKQDGASA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.4
• 重原子数：
  41
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.21
• 拓扑面积：
  231
• 氢给体数：
  8
• 氢受体数：
  12

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  pradimicinone II 、 S-腺苷-L-蛋氨酸 在 PdmT o-methyltransferase 作用下， 以 aq. buffer 为溶剂， 生成 7-O-methylpradimicinone II
  参考文献：
  名称：

  两种O-甲基转移酶揭示了对Pradimicin生物合成的新见解

  摘要：

  Pradimicins是一组来自Actinomadura hibisca的抗病毒和抗真菌天然产物。pradimicin生物合成基因簇中存在两个推定的O-甲基转移酶基因pdmF和pdmT。然而，在radimicins中仅存在一个甲氧基（11-OCH 3）。通过异源表达和与各种底物的体外反应，PdmF被表征为具有相对广泛的底物特异性的C-11 O-甲基转移酶。为了探测PdmT在Pradimicin生物合成中的作用，相应的基因通过同源重组被破坏，从而导致Pradimicinone II的产生。然后，该酶在具有N端His 6标签的大肠杆菌，并通过Ni-NTA色谱法纯化。与PDMT pradimicinone II的反应中生成的7- ø -methylpradimicinone II，证实了这种酶是一个C-7 Ò -methyltransferase。PdmT的表征提示了一种新的途径，该途径可导致P

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2017.05.068

文献信息

• New insights into pradimicin biosynthesis revealed by two O-methyltransferases
  作者：Fuchao Xu、Kandy Napan、Shuwei Zhang、Tyler Gladwin、Jon Takemoto、Jixun Zhan

  DOI：10.1016/j.bmcl.2017.05.068

  日期：2017.8

  Pradimicins are a group of antiviral and antifungal natural products from Actinomadura hibisca. Two putative O-methyltransferase genes, pdmF and pdmT, are present in the pradimicin biosynthetic gene cluster. However, there is only one methoxy group (11-OCH3) in pradimicins. Through heterologous expression and in vitro reactions with various substrates, PdmF was characterized as the C-11 O-methyltransferase

  Pradimicins是一组来自Actinomadura hibisca的抗病毒和抗真菌天然产物。pradimicin生物合成基因簇中存在两个推定的O-甲基转移酶基因pdmF和pdmT。然而，在radimicins中仅存在一个甲氧基（11-OCH 3）。通过异源表达和与各种底物的体外反应，PdmF被表征为具有相对广泛的底物特异性的C-11 O-甲基转移酶。为了探测PdmT在Pradimicin生物合成中的作用，相应的基因通过同源重组被破坏，从而导致Pradimicinone II的产生。然后，该酶在具有N端His 6标签的大肠杆菌，并通过Ni-NTA色谱法纯化。与PDMT pradimicinone II的反应中生成的7- ø -methylpradimicinone II，证实了这种酶是一个C-7 Ò -methyltransferase。PdmT的表征提示了一种新的途径，该途径可导致P