[(2R,3S,4S,5R)-5-(6-氨基嘌呤-9-基)-3,4-二羟基四氢呋喃-2-基]甲基(羟基-膦酰氧基磷酰)磷酸氢酯 | 3714-60-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷酸
• 中文名称: [(2R,3S,4S,5R)-5-(6-氨基嘌呤-9-基)-3,4-二羟基四氢呋喃-2-基]甲基(羟基-膦酰氧基磷酰)磷酸氢酯
• 英文名称: 2'-9β-D-arabinofuranosyladenine 5'-triphosphate
• 英文别名: 9-β-D-arabinofuranosyladenine-5'-triphosphate；adenine arabinofuranoside 5'-triphosphate；adeninearabinofuranoside 5'-triphosphate；ara-adenosine-5'-triphosphate；vidarabine triphosphate；vidarabine-TP；Ara-ATP；[[(2R,3S,4S,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl] phosphono hydrogen phosphate
• CAS: 3714-60-1
• 化学式: C₁₀H₁₆N₅O₁₃P₃
• 分子量: 507.184
• InChiKey: ZKHQWZAMYRWXGA-UHTZMRCNSA-N

物化性质

• 沸点：
  951.4±75.0 °C(Predicted)
• 密度：
  2.63±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -5.7
• 重原子数：
  31
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  279
• 氢给体数：
  7
• 氢受体数：
  17

制备方法与用途

Ara-ATP是一种ATP的结构类似物，能够通过与ATP竞争的方式抑制poly(A)聚合酶的活性。

上下游信息

• 上游原料

  中文名称	英文名称	CAS号	化学式	分子量
  阿糖腺苷	arabinosyl adenine	5536-17-4	C10H13N5O4	267.244

• 下游产品

  中文名称	英文名称	CAS号	化学式	分子量
  ——	adenosine(adenine arabinofuranoside) 5',5'''-P1,P4-tetraphosphate	——	C20H28N10O19P4	836.393

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  [(2R,3S,4S,5R)-5-(6-氨基嘌呤-9-基)-3,4-二羟基四氢呋喃-2-基]甲基(羟基-膦酰氧基磷酰)磷酸氢酯 、 5’-三磷酸腺苷 在 pyrophosphatase 、 L-赖氨酸 、 potassium chloride 、 magnesium chloride 作用下， 以 水 为溶剂， 反应 2.0h， 以52%的产率得到adenosine(adenine arabinofuranoside) 5',5'''-P¹,P⁴-tetraphosphate
  参考文献：
  名称：

  Enzymatic synthesis of diadenosine 5′, 5‴-P¹, P⁴-tetraphosphate (Ap₄A) analogues by stress protein LysU

  摘要：

  通过使用应激蛋白 LysU 进行酶催化，制备合成了具有重要生物学意义的分子二腺苷 5â²，5â´-P1，P4-tetraphosphate（Ap4A）的类似物，而且产量很高。

  DOI：

  10.1039/c39940000659
• 作为产物：
  描述：

  阿糖腺苷 在 human deoxycytidine kinase 、 5’-三磷酸腺苷 、 magnesium chloride 作用下， 以 水 为溶剂， 生成 [(2R,3S,4S,5R)-5-(6-氨基嘌呤-9-基)-3,4-二羟基四氢呋喃-2-基]甲基(羟基-膦酰氧基磷酰)磷酸氢酯
  参考文献：
  名称：

  L-腺苷和L-鸟苷的衍生物作为人脱氧胞苷激酶的底物。

  摘要：

  L-腺苷和L-鸟苷的一系列类似物，包括β-L-dA，β-L-Ado，β-L-araA和β-L-dG，已被证明是人脱氧胞苷激酶的底物因此证明该酶完全缺乏对映选择性。

  DOI：

  10.1080/15257779908041581

文献信息

• Enzymatic Preparation of 2′–5′,3′–5′-Cyclic Dinucleotides, Their Binding Properties to Stimulator of Interferon Genes Adaptor Protein, and Structure/Activity Correlations
  作者：Barbora Novotná、Lenka Vaneková、Martin Zavřel、Miloš Buděšínský、Milan Dejmek、Miroslav Smola、Ondrej Gutten、Zahra Aliakbar Tehrani、Markéta Pimková Polidarová、Andrea Brázdová、Radek Liboska、Ivan Štěpánek、Zdeněk Vavřina、Tomáš Jandušík、Radim Nencka、Lubomír Rulíšek、Evžen Bouřa、Jiří Brynda、Ondřej Páv、Gabriel Birkuš

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.9b01062

  日期：2019.12.12

  (NFκB) signaling cascades. In this work, we describe an enzymatic preparation of 2′–5′,3′–5′-cyclic dinucleotides (2′3′CDNs) with use of cyclic GMP–AMP synthases (cGAS) from human, mouse, and chicken. We profile substrate specificity of these enzymes by employing a small library of nucleotide-5′-triphosphate (NTP) analogues and use them to prepare 33 2′3′CDNs. We also determine affinity of these CDNs to

  环状二核苷酸是环状GMP-AMP合酶（cGAS）-干扰素基因刺激（STING）途径的第二信使，在识别肿瘤细胞和病毒或细菌感染中起着重要作用。它们与STING衔接蛋白结合并通过TANK结合激酶1（TBK1）/干扰素调节因子3（IRF3）和核因子-κB（IκB）激酶（IKK）/核因子-κB（NFκB）抑制剂触发细胞因子的表达信号级联。在这项工作中，我们描述了使用人，小鼠和鸡的环状GMP-AMP合成酶（cGAS）酶法制备2'-5'，3'-5'-环二核苷酸（2'3'CDNs）的方法。我们通过使用一个小的核苷酸5'-三磷酸（NTP）类似物文库来分析这些酶的底物特异性，并使用它们来制备33个2'3'CDN。我们还确定了这些CDN对基于细胞和生化分析的五种不同STING单倍型的亲和力，并描述了它们对所有STING单倍型的最佳活性所需的特性。接下来，我们研究它们对人外周血单核细胞（PBMC）诱导的细胞因子
• Characterisation of stress protein LysU. Enzymic synthesis of diadenosine 5′,5‴-P¹,P⁴-tetraphosphate (Ap₄A) analogues by LysU
  作者：Maria-Elena Theoclitou、E. Pernilla L. Wittung、Alison D. Hindley、Talal S. H. El-Thaher、Andrew D. Miller

  DOI：10.1039/p19960002009

  日期：——

  The stress protein LysU (lysyl tRNA synthetase) has been purified from a recombinant strain of Escherichia coli expressing the plasmid pXLys5, and kinetically characterised. Preparative syntheses of analogues of the biologically important molecule diadenosine 5',5'''-P-1,P-4-tetraphosphate (Ap(4)A) are then achieved in good yield by enzyme catalysis, using purified LysU.
• Derivatives of L-Adenosine and L-Guanosine as Substrates for Human Deoxycytidine Kinase
  作者：G. Gaubert、G. Gosselin、J-L. Imbach、S. Eriksson、G. Maury

  DOI：10.1080/15257779908041581

  日期：1999.4

  A series of analogues of L-adenosine and of L-guanosine, including beta-L-dA, beta-L-Ado, beta-L-araA, and beta-L-dG, have been shown to be substrates of human deoxycytidine kinase thus demonstrating the complete lack of enantioselectivity of this enzyme.

  L-腺苷和L-鸟苷的一系列类似物，包括β-L-dA，β-L-Ado，β-L-araA和β-L-dG，已被证明是人脱氧胞苷激酶的底物因此证明该酶完全缺乏对映选择性。
• Enzymatic synthesis of diadenosine 5′, 5‴-P¹, P⁴-tetraphosphate (Ap₄A) analogues by stress protein LysU
  作者：Maria-Elena Theoclitou、Talal S. H. El-Thaher、Andrew D. Miller

  DOI：10.1039/c39940000659

  日期：——

  Preparative synthesis of analogues of the biologically important molecule diadenosine 5′, 5‴-P1, P4-tetraphosphate (Ap4A) is achieved in good yield by enzyme catalysis using the stress protein LysU.

  通过使用应激蛋白 LysU 进行酶催化，制备合成了具有重要生物学意义的分子二腺苷 5â²，5â´-P1，P4-tetraphosphate（Ap4A）的类似物，而且产量很高。