[6-[双(4-甲氧基苯基)苯基甲氧基]-5-(羟基甲基)己基]-氨基甲酸-9H-氟-9-甲酯 (9CI) | 147190-32-7

• 物质功能分类: 化学试剂 - 有机试剂 - 酯类
• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 中文名称: [6-[双(4-甲氧基苯基)苯基甲氧基]-5-(羟基甲基)己基]-氨基甲酸-9H-氟-9-甲酯 (9CI)
• 中文别名: [6-[双(4-甲氧基苯基)苯基甲氧基]-5-(羟基甲基)己基]-氨基甲酸-9H-氟-9-甲酯(9CI)
• 英文名称: 6-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino-2-((bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)methyl)hexan-1-ol
• 英文别名: 1-O-dimethoxytrityl-2-(N-Fmoc-4-aminobutyl)-1,3-propanediol；1-o-Dimethoxytrityl-2-(N-Fmoc-4-aminobutyl)-1,3-propandiol；(9H-Fluoren-9-yl)methyl (6-(bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)-5-(hydroxymethyl)hexyl)carbamate；9H-fluoren-9-ylmethyl N-[5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-6-hydroxyhexyl]carbamate
• CAS: 147190-32-7
• 化学式: C₄₃H₄₅NO₆
• 分子量: 671.833
• InChiKey: IJJDBZXVQQQARK-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 熔点：
  51-54°C
• 沸点：
  828.9±65.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.178±0.06 g/cm3(Predicted)
• 溶解度：
  可溶于氯仿（少量）、二氯甲烷（少量）、乙酸乙酯（少量）

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  8.2
• 重原子数：
  50
• 可旋转键数：
  17
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.28
• 拓扑面积：
  86.2
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  [6-[双(4-甲氧基苯基)苯基甲氧基]-5-(羟基甲基)己基]-氨基甲酸-9H-氟-9-甲酯 (9CI) 在 咪唑 、 4-二甲氨基吡啶 、 四丁基氟化铵 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 58.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  NUCLEIC ACID DERIVATIVE HAVING IMMUNOSTIMULATORY ACTIVITY

  摘要：

  本发明的目的是提供包含如下所述CpG寡核苷酸的双链寡核苷酸，作为一种具有免疫刺激活性的核酸衍生物。 一种包含双链寡核苷酸的佐剂，其中 第一链是由8到50个核苷酸组成的CpG寡核苷酸， 第二链是由8到60个核苷酸组成的寡核苷酸，并且包括 能够与第一链杂交的序列，以及通过连接器与第二链结合的脂质。

  公开号：

  US20180264105A1

文献信息

• BRANCHED LIPID CONJUGATES OF siRNA FOR SPECIFIC TISSUE DELIVERY
  申请人：UNIVERSITY OF MASSACHUSETTS

  公开号：US20210108200A1

  公开（公告）日：2021-04-15

  This disclosure relates to an siRNA-lipid conjugate of formula Y-L-(H) n . Y is an siRNA molecule, L is a linker covalently bonded to Y and H, each H is independently a hydrophobic chain comprising 5 to 50 carbon atoms, n is 1, 2, or 3, and linker L is bonded to the 3′ end of the sense strand of the siRNA.

  这项披露涉及到一个公式为Y-L-(H)n的siRNA-脂质共轭物。其中，Y是一个siRNA分子，L是与Y和H共价结合的连接物，每个H都是独立的由5到50个碳原子组成的疏水链，n为1、2或3，连接物L与siRNA的sense链的3'端结合。
• STABILIZED NUCLEIC ACID DARK QUENCHER-FLUOROPHORE PROBES
  申请人：Cook Ronald M.

  公开号：US20090259030A1

  公开（公告）日：2009-10-15

  The present invention provides a new class of solids supports for synthesis of modified oligomers of nucleic acids, and nucleic acid probes that have a format expediently synthesized on the new supports. Exemplary solid supports include at least one quencher bound through a linker to the solid support. Various exemplary embodiments include a moiety that stabilizes a duplex, triplex or higher order aggregation (e.g., hybridization) of nucleic acids of which the oligomer of the invention is a component. Other components of the solid support include moieties that stabilize aggregations of nucleic acids, e.g., intercalators, minor groove binding moieties, bases modified with a stabilizing moiety (e.g., alkynyl moieties, and fluoroalkyl moieties), and conformational stabilizing moieties, such as those described in commonly owned U.S. Patent Application Publication No. 2007/0059752.

  本发明提供了一种新型固体支持体，用于合成修饰寡核苷酸的新类固体支持体以及具有在新支持体上方便合成的核酸探针。示例固体支持体包括至少通过连接剂与固体支持体结合的一个猝灭剂。各种示例实施例包括稳定双链、三链或更高级别聚集（例如，杂交）的基团，其中该发明的寡聚物是其中的一个组分的基团。固体支持体的其他组分包括稳定核酸聚集的基团，例如，插入剂、小沟结合基团、经过稳定基团修饰的碱基（例如，炔基基团和氟烷基团）和构象稳定基团，例如，如同在共同拥有的美国专利申请公开号2007/0059752中描述的那样。
• Solid support reagents for the direct synthesis of 3'-labeled polynucleotides
  申请人：THE PERKIN-ELMER CORPORATION

  公开号：EP0786468A2

  公开（公告）日：1997-07-30

  The compounds of the invention are exemplified by the class of diglycolate synthesis supports particularly useful as support reagents for the direct synthesis of 3'-labeled polynucleotides. Generally, the compounds of the invention have the structure where T is an acid-cleavable hydroxyl protecting group, e.g., 4,4'-dimethoxytrityl; L1 is a linker for connecting a 3'-terminal nitrogen to carbon; L2 and L3 are linkers for connecting oxygen and carbon; W is a solid support, e.g., CPG or polystyrene; L4 is a linker for connecting the solid support to nitrogen; R1 and R2 are nitrogen substituents, e.g., hydrogen, lower alkyl, nitrogen protecting group, or label; and R3 through R7 are carbon substituents, e.g., hydrogen or lower alkyl. In a first particularly preferred embodiment, the synthesis supports of the invention are exemplified by compounds having the structure where DMT is 4,4'-dimethoxytrityl and W is polystyrene. In a second particularly preferred embodiment, the synthesis supports of the invention are exemplified by compounds having the structure where DMT and W are defined above.

  本发明的化合物属于二羟基乙酸酯合成支持物，特别适用于直接合成 3'- 标记的多核苷酸。一般来说，本发明的化合物具有如下结构 其中，T 是可被酸水解的羟基保护基团，如 4,4'-二甲氧基三苯甲基；L1 是连接 3'末端氮和碳的连接体；L2 和 L3 是连接氧和碳的连接体；W 是固体支持物，如 CPG 或聚苯乙烯；L2 和 L3 是连接氧和碳的连接体、R1和R2是氮取代基，如氢、低级烷基、氮保护基团或标签；R3至R7是碳取代基，如氢或低级烷基。在第一个特别优选的实施方案中，本发明的合成支持物以具有以下结构的化合物为例 其中 DMT 为 4,4'-二甲氧基三苯甲基，W 为聚苯乙烯。在第二个特别优选的实施方案中，本发明的合成支持物以具有以下结构的化合物为例 其中 DMT 和 W 定义如上。
• Automated synthesis of double dye-labeled oligonucleotides using tetramethylrhodamine (TAMRA) solid supports
  作者：Bashar Mullah、Alex Andrus

  DOI：10.1016/s0040-4039(97)01286-0

  日期：1997.8

  TAMRA fluorescent dye-labeled non-nucleosidic synthesis supports have been derivatized for automated synthesis of 3'dye-labeled oligonucleotides.(1) Synthesis with 5' fluorescent dye phosphoramidites leads to 5' and 3'double labeled oligonucleotides, useful in Taqman assay and FRET experiments. Cleavage and deprotection of dye-labeled dye-labeled oligonucleotides are carried out with tert-butylamine:methnnol:water (1:1:2) without any degradation and/or modification of dyes and nucleobases. (C) 1997 Elsevier Science Ltd.
• US5736626A
  申请人：——

  公开号：US5736626A

  公开（公告）日：1998-04-07