[(2R,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl] N-[[(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxysulfonyl]carbamate | 1013630-96-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: [(2R,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl] N-[[(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxysulfonyl]carbamate
• CAS: 1013630-96-0
• 化学式: C₁₈H₂₆N₄O₁₅S
• 分子量: 570.488
• InChiKey: WAJXKVVPAXZDBW-CFRASDGPSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -5
• 重原子数：
  38
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.67
• 拓扑面积：
  288
• 氢给体数：
  8
• 氢受体数：
  15

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  5'-O-<<<<(2''-acetamido-3'',4'',6''-tri-O-acetyl-2''-deoxy-α-D-glucopyranosyl)oxy>carbonyl>amino>sulfonyl>uridine 在 氨 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 4.0h， 以90%的产率得到[(2R,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl] N-[[(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxysulfonyl]carbamate
  参考文献：
  名称：

  探索糖基转移酶的特异性：合成新的糖核苷酸相关分子作为推定的供体底物

  摘要：

  我们研究了糖基转移酶在两个互补方向上对供体底物的特异性。首先，我们准备了简单的N-乙酰基-α-D-氨基葡萄糖1-二磷酸酯：甲基-（2-乙酰氨基-2-脱氧-α-D-吡喃葡萄糖基）-二磷酸酯，苄基-（2-乙酰氨基-2-脱氧-α-磷酸酯D-吡喃葡萄糖基）-二磷酸酯，4-苯基丁基-（2-乙酰氨基-2-脱氧-α-D-吡喃葡萄糖基）-二磷酸酯，通过将相应的活化烷基磷酸酯与N-乙酰基-α-D-葡糖胺1-偶联磷酸盐。在脑膜炎奈瑟氏菌N-乙酰氨基葡萄糖氨基转移酶（LgtA）催化的反应中，作为N-乙酰氨基葡萄糖的供体，测试了这些二磷酸以及2-乙酰氨基-2-脱氧-α-D-吡喃葡萄糖1-二磷酸的活性。评估为抑制剂，只有2-乙酰氨基-2-脱氧-α-D-吡喃葡萄糖1-二磷酸酯显示出一定的抑制活性，IC50值为7 mM。在第二种方法中，我们准备了糖核苷酸模拟物，其二磷酸桥被氧羰基氨基磺酰基接头取代。GDP-Fuc的替代

  DOI：

  10.1016/j.carres.2007.11.009

文献信息

• Exploring specificity of glycosyltransferases: synthesis of new sugar nucleotide related molecules as putative donor substrates
  作者：Amira Khaled、Olga Piotrowska、Katarzyna Dominiak、Claudine Augé

  DOI：10.1016/j.carres.2007.11.009

  日期：2008.2

  with an IC50 value of 7 mM. In the second approach, we prepared sugar nucleotide mimics having the diphosphate bridge replaced by the oxycarbonylaminosulfonyl linker. The surrogate of GDP-Fuc was synthesized as a 9:1 alpha/beta anomeric mixture, in 40% yield, starting from chlorosulfonyl isocyanate, perbenzylated l-fucopyranose, and a guanosine derivative, protected on the exocyclic amine and secondary

  我们研究了糖基转移酶在两个互补方向上对供体底物的特异性。首先，我们准备了简单的N-乙酰基-α-D-氨基葡萄糖1-二磷酸酯：甲基-（2-乙酰氨基-2-脱氧-α-D-吡喃葡萄糖基）-二磷酸酯，苄基-（2-乙酰氨基-2-脱氧-α-磷酸酯D-吡喃葡萄糖基）-二磷酸酯，4-苯基丁基-（2-乙酰氨基-2-脱氧-α-D-吡喃葡萄糖基）-二磷酸酯，通过将相应的活化烷基磷酸酯与N-乙酰基-α-D-葡糖胺1-偶联磷酸盐。在脑膜炎奈瑟氏菌N-乙酰氨基葡萄糖氨基转移酶（LgtA）催化的反应中，作为N-乙酰氨基葡萄糖的供体，测试了这些二磷酸以及2-乙酰氨基-2-脱氧-α-D-吡喃葡萄糖1-二磷酸的活性。评估为抑制剂，只有2-乙酰氨基-2-脱氧-α-D-吡喃葡萄糖1-二磷酸酯显示出一定的抑制活性，IC50值为7 mM。在第二种方法中，我们准备了糖核苷酸模拟物，其二磷酸桥被氧羰基氨基磺酰基接头取代。GDP-Fuc的替代