8-iodoimidazo[1,2-c]pyrimidin-5-ol

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 咪唑并嘧啶类
• 英文名称: 8-iodoimidazo[1,2-c]pyrimidin-5-ol
• 英文别名: 8-iodo-6H-imidazo[1,2-c]pyrimidin-5-one
• 化学式: C₆H₄IN₃O
• 分子量: 261.022
• InChiKey: QYBVGWFSIYHZEG-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.1
• 重原子数：
  11
• 可旋转键数：
  0
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.0
• 拓扑面积：
  46.9
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  2

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  8-iodoimidazo[1,2-c]pyrimidin-5-ol 在 N,N-二异丙基乙胺 、 三氯氧磷 作用下， 反应 4.0h， 以29.8%的产率得到5-chloro-8-iodoimidazo[1,2-c]pyrimidine
  参考文献：
  名称：

  PYRIMIDINE-FUSED CYCLIC COMPOUND, PREPARATION METHOD THEREFOR AND APPLICATION THEREOF

  摘要：

  本公开涉及一种嘧啶融合的环状化合物或其药用可接受的盐、水合物、前药、立体异构体、溶剂合物或同位素标记化合物。本公开还提供了该化合物的制备方法、包含该化合物的组合物以及该化合物用于制备与异常SHP2活性相关的疾病或病况的药物的用途。

  公开号：

  US20210053989A1
• 作为产物：
  描述：

  2-chloro-N-(2,2-dimethoxyethyl)-5-iodopyrimidine-4-amine 在 硫酸 作用下， 反应 2.0h， 以84.5%的产率得到8-iodoimidazo[1,2-c]pyrimidin-5-ol
  参考文献：
  名称：

  SPIRO AROMATIC RING COMPOUND AND APPLICATION THEREOF

  摘要：

  提供的是化合物I的结构或其药用可接受的盐、对映体、二对映体、互变异构体、溶剂合物、同位素取代基、多型体、前药或其代谢物。还提供了一种制备化合物I的方法。化合物I具有更高的对SHP2的抑制活性，因此可用于预防或治疗与SHP2相关的疾病。

  公开号：

  US20200317695A1

文献信息

• Synthesis, structure and rearrangement of iodinated imidazo[1,2- c ]pyrimidine-5(6 H )-ones derived from cytosine
  作者：Josef Jansa、Antonín Lyčka、Aleš Růžička、Martin Grepl、Jan Vaněček

  DOI：10.1016/j.tet.2014.11.049

  日期：2015.1

  8-substituted imidazo[1,2-c]pyrimidine-5(6H)-ones (ethenocytosines). Starting ethenocytosines were obtained by cyclization of 5-halogenocytosines with chloroacetaldehyde or by subsequent Suzuki–Miyaura cross-coupling between 8-iodoimidazo[1,2-c]pyrimidine-5(6H)-one 1d and corresponding arylboronic acids. When imidazo[1,2-c]pyrimidine-5(6H)-one or 8-iodoimidazo[1,2-c]pyrimidine-5(6H)-one 1d was iodinated

  我们描述了各种8-取代的咪唑并[1,2 - c ]嘧啶-5（6 H）-ones（ethenocytosines）的温和和选择性碘化。通过将5-卤代胞嘧啶与氯乙醛环化或随后的Suzuki-Miyaura交叉偶联在8-碘咪唑并[1,2 - c ]嘧啶-5（6 H）-1d和相应的芳基硼酸中获得起始的胞嘧啶。当咪唑并[1,2 Ç ]嘧啶5（6 ħ） -酮或8碘咪唑并[1,2- c ^ ]嘧啶5（6 ħ） -酮1D通过碘化Ñ在DMF碘代丁二酰亚胺（NIS） ，纯3,8-二碘代衍生物2d获得了。在碱性或酸性条件下，该分子会重排为2,8-二十二烷基衍生物3d，随后可将其碘代为2,3,8-三十二烷基衍生物4d。由于仅通过NMR光谱不能令人信服地确定碘原子在咪唑环上的位置，因此对2d进行X射线分析以毫无疑问地确认其结构。将相同的反应顺序应用于另外八个乙炔胞嘧啶，可提供出色的区域选择性，易重排和高产率的碘化产物。通过1
• New Imidazo[1,2-<i>c</i>]pyrimidin-5(6<i>H</i>)-Ones Derived from Cytosine: Synthesis, Structure, and Cytotoxic Activity
  作者：Josef Jansa、Antonín Lyčka、Zdeňka Padělková、Martin Grepl、Petr Konečný、Marián Hajdúch、Petr Džubák

  DOI：10.1002/jhet.2243

  日期：2015.9

  This work describes the synthesis of 8‐iodoimidazo[1,2‐c]pyrimidin‐5(6H)‐one 2 from 5‐iodocytosine 1. This compound was subjected to Suzuki cross‐coupling reaction with aryl and heteroarylboronic acids. After optimization, 10 products 3a, 3b, 3c, 3d, 3e, 3f, 3g, 3h, 3i, 3j were obtained in good yields 61‐90%. Cytotoxic activity of all new products was evaluated on seven tumor cell lines including resistant

  这项工作描述了从5-碘胞嘧啶1合成8-碘咪唑并[1,2- c ]嘧啶-5（6 H）-one 2。该化合物与芳基和杂芳基硼酸进行了铃木交叉偶联反应。经过优化后，有10个产品3a，3b，3c，3d，3e，3f，3g，3h，3i，3j获得了61-90％的高收率。在包括抗性变体在内的七个肿瘤细胞系和正常人成纤维细胞上评估了所有新产品的细胞毒活性。在3h的情况下，两种衍生物表现出良好的生物活性和良好的治疗指数。
• Imidazo[1,2-<i>c</i> ]pyrimidin-5(6<i>H</i> )-one as a novel core of cyclin-dependent kinase 2 inhibitors: Synthesis, activity measurement, docking, and quantum mechanical scoring
  作者：Haresh Ajani、Josef Jansa、Cemal Köprülüoğlu、Pavel Hobza、Vladimír Kryštof、Antonín Lyčka、Martin Lepsik

  DOI：10.1002/jmr.2720

  日期：2018.9

  We report on the synthesis, activity testing, docking, and quantum mechanical scoring of novel imidazo[1,2‐c]pyrimidin‐5(6H)‐one scaffold for cyclin‐dependent kinase 2 (CDK2) inhibition. A series of 26 compounds substituted with aromatic moieties at position 8 has been tested in in vitro enzyme assays and shown to inhibit CDK2. 2D structure‐activity relationships have ascertained that small substituents

  我们报告了新型咪唑并[1,2 - c ]嘧啶-5（6 H）-1支架对细胞周期蛋白依赖性激酶2（CDK2）抑制的合成，活性测试，对接和量子力学评分。在体外酶法中已经测试了一系列在位置8处被芳香族部分取代的26种化合物，并显示出抑制CDK2的作用。二维结构与活性的关系已确定，位置8处的小取代基（最大为萘基或甲氧基苯基的大小）通常会导致单位数微摩尔IC 50较大的取代基（取代的联苯）会降低化合物的活性。使用Glide对接获得的化合物的结合模式在CDK2上显示出最多2个铰链区氢键，并且在抑制剂核心的取向和8个取代基的位置上有所不同。基于半经验量子力学的计分方法确定了可能的有利结合模式，这将有助于未来基于结构的设计以及杂环核取代基的合成优化。总之，我们已经确定了CDK2抑制的新核心，并将进一步探索以增加化合物的效力并监测其对其他蛋白激酶的选择性。
• Imidazo[1,2-c]pyrimidin-5(6H)-one inhibitors of CDK2: Synthesis, kinase inhibition and co-crystal structure
  作者：Josef Jansa、Radek Jorda、Jana Škerlová、Petr Pachl、Miroslav Peřina、Eva Řezníčková、Tomáš Heger、Tomáš Gucký、Pavlína Řezáčová、Antonín Lyčka、Vladimír Kryštof

  DOI：10.1016/j.ejmech.2021.113309

  日期：2021.4

  substituted imidazo[1,2-c]pyrimidin-5(6H)-ones as inhibitors of cyclin-dependent kinase 2 (CDK2). Here, we report the synthesis of derivatives modified at positions 2, 3, 6 or 8 prepared using Suzuki-Miyaura cross-coupling, halogenation, Dimroth-type rearrangement and alkylation as the main synthetic methods. The compounds displayed micro- to submicromolar inhibition of CDK2/cyclin E activity. Binding

  细胞周期蛋白依赖性激酶的药理学抑制作用已成为多种癌症的可能治疗选择。我们最近确定了取代的咪唑并[1,2 - c ]嘧啶-5（6 H）-ones作为细胞周期蛋白依赖性激酶2（CDK2）的抑制剂。在这里，我们报道了使用铃木宫浦交叉偶联，卤化，Dimroth型重排和烷基化作为主要合成方法制备的，在2、3、6或8位修饰的衍生物的合成。这些化合物显示出对CDK2 / cyclin E活性的微摩尔至亚微摩尔抑制作用。用等温滴定热法测定最有效的化合物3b与CDK2的结合。3b的共晶体结构解决了与具有完全活性的CDK2的复合物中的Aβ ，揭示了3b在ATP口袋中的结合模式以及与铰链区残基Leu83的氢键相互作用。对白血病细胞系的评估显示出低细胞毒性，这与对CDK2的高选择性相符。这项研究表明，取代的咪唑并[1,2- c ]嘧啶可用于未来激酶抑制剂的开发。
• 一种含芳基并氮杂七元环类化合物及其制备方法与应用
  申请人：中国药科大学

  公开号：CN114539223A

  公开（公告）日：2022-05-27

  本发明属于药物化学领域，具体涉及一种含芳基并氮杂七元环类化合物及其制备方法与应用。含有通式I的一种芳基并氮杂七元环类化合物及其药学上可接受的盐、对映异构体、非异构体、互变异构体、溶剂化物、多晶型物或前药；本发明基于SHP099为先导化合物，制备出一类芳基并氮杂七元环的全新化合物，以解决目前SHP2抑制剂结构骨架单一等问题；本发明重要意义在于提供很多修饰位点，为后期结构改造提供基础。同时本发明的实施例证实了化合物对SHP2磷酸酶具有变构抑制作用，为后续开发SHP2磷酸酶抑制剂提供骨架支持。