5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-3'-O-[(2-cyanoethoxy)(N,N-diisopropylamino)phosphino]-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-2-fluoro-6-O-(4-nitrophenethyl)inosine

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-3'-O-[(2-cyanoethoxy)(N,N-diisopropylamino)phosphino]-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-2-fluoro-6-O-(4-nitrophenethyl)inosine
• 英文别名: 3-[[(2R,3R,4R,5R)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-5-[2-fluoro-6-[2-(4-nitrophenyl)ethoxy]purin-9-yl]oxolan-3-yl]oxy-[di(propan-2-yl)amino]phosphanyl]oxypropanenitrile
• 化学式: C₅₄H₆₇FN₇O₁₀PSi
• 分子量: 1052.22
• InChiKey: XABRTQBSJSMHIN-YAACOCNLSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  11.47
• 重原子数：
  74
• 可旋转键数：
  24
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.44
• 拓扑面积：
  190
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  16

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  鸟苷 在 咪唑 、 4-二甲氨基吡啶 、 亚硝酸特丁酯 、 氢氟酸 、 三乙胺 、 N,N-二异丙基乙胺 、 三苯基膦 、 偶氮二甲酸二乙酯 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 吡啶 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 50.0h， 生成 5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-3'-O-[(2-cyanoethoxy)(N,N-diisopropylamino)phosphino]-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-2-fluoro-6-O-(4-nitrophenethyl)inosine
  参考文献：
  名称：

  RNA 位点特异性修饰的化学方法：可转换核苷方法

  摘要：

  RNA结构的知识可以极大地促进对其生物学功能的理解。然而，RNA 的物理特性，尤其是其构象异质性，阻碍了高分辨率结构分析。因此，较低分辨率的方法，如生化探测、系统发育分析和分子建模，已在 RNA 科学中发挥重要作用。这种情况导致需要一种方法来约束 RNA 结构，以减少其构象灵活性或帮助区分替代结构模型。为了满足这一需求，我们开发了化学方法，允许将可功能化的系链特定于位点引入 RNA。在这里，我们报告了用于固相 RNA 合成的试剂的设计和合成，这些试剂允许 G、C 和 A 残基的碱基部分的功能化。在掺入寡核苷酸中并随后用烷基胺处理后，可转化的核苷衍生物...

  DOI：

  10.1021/ja962858n

文献信息

• A Chemical Method for Site-Specific Modification of RNA:  The Convertible Nucleoside Approach
  作者：Charles R. Allerson、Swaine L. Chen、Gregory L. Verdine

  DOI：10.1021/ja962858n

  日期：1997.8.1

  for a means by which to constrain RNA structure, either to reduce its conformational flexibility or to help distinguish between alternative structural models. To address this need, we have developed chemistry that permits the site-specific introduction of functionalizable tethers into RNA. Here we report the design and synthesis of reagents for use in solid-phase RNA synthesis that allow the functionalization

  RNA结构的知识可以极大地促进对其生物学功能的理解。然而，RNA 的物理特性，尤其是其构象异质性，阻碍了高分辨率结构分析。因此，较低分辨率的方法，如生化探测、系统发育分析和分子建模，已在 RNA 科学中发挥重要作用。这种情况导致需要一种方法来约束 RNA 结构，以减少其构象灵活性或帮助区分替代结构模型。为了满足这一需求，我们开发了化学方法，允许将可功能化的系链特定于位点引入 RNA。在这里，我们报告了用于固相 RNA 合成的试剂的设计和合成，这些试剂允许 G、C 和 A 残基的碱基部分的功能化。在掺入寡核苷酸中并随后用烷基胺处理后，可转化的核苷衍生物...