P1-(7-methylguanosin-5'-yl) 1,2-methylenediphosphate triethylammonium salt

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷酸
• 英文名称: P1-(7-methylguanosin-5'-yl) 1,2-methylenediphosphate triethylammonium salt
• 化学式: C18H34N6O10P2
• 分子量: 556.4
• InChiKey: OZAGPKIXLMQXMO-YCSZXMBFSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.78
• 重原子数：
  36
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.72
• 拓扑面积：
  241
• 氢给体数：
  6
• 氢受体数：
  14

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  P1-(7-methylguanosin-5'-yl) 1,2-methylenediphosphate triethylammonium salt 、 GDP-imidazolide 在 zinc(II) chloride 、 ammonium acetate 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 、 甲醇 为溶剂， 反应 4.0h， 以38%的产率得到P1-(7-methylguanosin-5'-yl) P4-guanosin-5'-yl 1,2-methylenetetraphosphate ammonium salt
  参考文献：
  名称：

  Synthetic dinucleotide mRNA cap analogs with tetraphosphate 5′,5′ bridge containing methylenebis(phosphonate) modification

  摘要：

  本文介绍了一种有效而简便的合成方法，即用亚甲基双（膦酸盐）分子修饰六种新型四磷酸帽类似物（1â6）。这些类似物经过合理设计，能与真核生物起始因子 4E（eIF4E）紧密结合，该因子在翻译起始过程中负责帽的结合，并且由于耐酶降解而具有更高的稳定性。最终化合物与 eIF4E 的结合常数（KAS）明显更高（比标准值高 5â9 倍）。其中四种类似物对人类解旋清道夫酶（DcpS）的酶降解具有抗性。非水解类似物与 DcpS 的结合研究显示，不同类似物的 KAS 值范围很广。在兔网状细胞裂解物系统（RRL）中，所有类似物都是有效的翻译抑制剂，而且对 DcpS 具有抗性的类似物在延长预孵育时间后变得稳定，而标准类似物的抑制效力则在这些条件下减弱。对于抗逆转录酶帽类似物（ARCA）二核苷酸（4â6），我们已经证明它们能有效地结合到 mRNA 中，并且用这些类似物封端的转录本会在体外进行翻译。

  DOI：

  10.1039/b911347a
• 作为产物：
  描述：

  亚甲基双膦酰二氯 、 三乙基碳酸氢铵缓冲液 、 7-甲基鸟苷 以 磷酸三甲酯 为溶剂， 反应 1.0h， 以77%的产率得到P1-(7-methylguanosin-5'-yl) 1,2-methylenediphosphate triethylammonium salt
  参考文献：
  名称：

  Synthetic dinucleotide mRNA cap analogs with tetraphosphate 5′,5′ bridge containing methylenebis(phosphonate) modification

  摘要：

  本文介绍了一种有效而简便的合成方法，即用亚甲基双（膦酸盐）分子修饰六种新型四磷酸帽类似物（1â6）。这些类似物经过合理设计，能与真核生物起始因子 4E（eIF4E）紧密结合，该因子在翻译起始过程中负责帽的结合，并且由于耐酶降解而具有更高的稳定性。最终化合物与 eIF4E 的结合常数（KAS）明显更高（比标准值高 5â9 倍）。其中四种类似物对人类解旋清道夫酶（DcpS）的酶降解具有抗性。非水解类似物与 DcpS 的结合研究显示，不同类似物的 KAS 值范围很广。在兔网状细胞裂解物系统（RRL）中，所有类似物都是有效的翻译抑制剂，而且对 DcpS 具有抗性的类似物在延长预孵育时间后变得稳定，而标准类似物的抑制效力则在这些条件下减弱。对于抗逆转录酶帽类似物（ARCA）二核苷酸（4â6），我们已经证明它们能有效地结合到 mRNA 中，并且用这些类似物封端的转录本会在体外进行翻译。

  DOI：

  10.1039/b911347a

文献信息

• mRNA Cap Modification through Carb­amate Chemistry: Synthesis of Amino- and Carboxy-Functionalised Cap Analogues Suitable for Labelling and Bioconjugation
  作者：Marcin Warminski、Zofia Warminska、Joanna Kowalska、Jacek Jemielity

  DOI：10.1002/ejoc.201500672

  日期：2015.10

  A simple and efficient synthesis of dinucleotide mRNA 5′ cap analogues functionalised by the addition of an amine or carboxylic acid group onto one of the ribose rings is reported. Selection of the modification sites was dictated by the recognition specificity for the 5′ cap by various cap-binding proteins, including eIF4E, DcpS, and Dcp2, as well as by bacteriophage RNA polymerase, which enables the

  报道了一种简单有效的合成二核苷酸 mRNA 5' 帽类似物，通过在其中一个核糖环上添加胺或羧酸基团进行功能​​化。修饰位点的选择取决于各种帽结合蛋白（包括 eIF4E、DcpS 和 Dcp2）以及噬菌体 RNA 聚合酶对 5'帽的识别特异性，这使得合成帽能够并入 mRNA链。一些类似物通过三磷酸桥中的 O-to-CH2 取代进一步修饰，以赋予对特定水解酶的抗性。通过使用通过氨基甲酸酯部分连接到核糖的不同长度的二胺和氨基酸来平衡空间拥挤和结构刚性。通过 1 H NMR 光谱研究了这些取代对核糖组分构象平衡的影响。在 NHS 活化化学的帮助下，证明了类似物用于标记荧光染料和亲和标签的效用。
• 5′-Phosphorothiolate Dinucleotide Cap Analogues: Reagents for Messenger RNA Modification and Potent Small-Molecular Inhibitors of Decapping Enzymes
  作者：Blazej A. Wojtczak、Pawel J. Sikorski、Kaja Fac-Dabrowska、Anna Nowicka、Marcin Warminski、Dorota Kubacka、Elzbieta Nowak、Marcin Nowotny、Joanna Kowalska、Jacek Jemielity

  DOI：10.1021/jacs.8b02597

  日期：2018.5.9

  translation initiation in eukaryotes. Cap analogues that influence mRNA translation and turnover (either as small molecules or as part of an RNA transcript) are valuable tools for studying gene expression, which is often also of therapeutic relevance. Here, we synthesized a series of 15 dinucleotide cap (m7GpppG) analogues containing a 5'-phosphorothiolate (5'-PSL) moiety (i.e., an O-to-S substitution within

  5' 帽由 7-甲基鸟苷 (m7G) 组成，通过 5'-5'-三磷酸桥连接到信使 RNA (mRNA)，并作为真核生物中 mRNA 转换和翻译起始的主要调节器。影响 mRNA 翻译和转换的帽类似物（作为小分子或作为 RNA 转录的一部分）是研究基因表达的宝贵工具，这通常也具有治疗相关性。在这里，我们合成了一系列含有 5'-硫代磷酸酯 (5'-PSL) 部分（即 5'-磷酸酯内的 O-to-S 取代）的 15 个二核苷酸帽 (m7GpppG) 类似物，并研究了它们在三种主要帽结合蛋白的背景：翻译起始因子 4E (eIF4E) 和两种脱帽酶 DcPS 和 Dcp2。虽然 5' -PSL 部分对于与 eIF4E 的帽相互作用是中性或略微稳定的，它显着影响了对去帽的敏感性。用 5'-PSL 部分 (γ-PSL) 代替 γ-磷酸酯阻止了 DcPS 对 β-γ-焦磷酸键的裂解，并赋予了强抑制特性。将 γ-PSL
• Enzymatically stable 5′ mRNA cap analogs: Synthesis and binding studies with human DcpS decapping enzyme
  作者：Marcin Kalek、Jacek Jemielity、Zbigniew M. Darzynkiewicz、Elzbieta Bojarska、Janusz Stepinski、Ryszard Stolarski、Richard E. Davis、Edward Darzynkiewicz

  DOI：10.1016/j.bmc.2005.12.045

  日期：2006.5

  Four novel 5' mRNA cap analogs have been synthesized with one of file pyrophosphate bridge oxygen atoms of the triphosphate linkage replaced with a methylene group. The analogs were prepared via reaction of nucleoside phosphor/phosphon-I-imidazolidates with nucleoside phosphate/phosphonate in the presence of ZnCl2. Three of the new cap analogs are completely resistant to degradation by human DcpS, the enzyme responsible for hydrolysis of free cap resulting from 3' to 5' Cellular mRNA decay. One of the new analogs has very high affinity for binding to human DcpS. Two of these analogs are Anti Reverse Cap Analogs which ensures that they are incorporated into mRNA chains exclusively in the correct orientation. These new cap analogs should be useful in a variety of biochemical studies, in the analysis of the cellular function of decapping enzymes, and as a basis for further development of modified cap analogs as potential anti-cancer and anti-parasite drugs. (c) 2005 Elsevier Ltd. All rights reserved.