N-(pyridin-3-yl)-3α,12α-dihydroxy-5β-cholan-24-amide

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 类固醇和类固醇衍生物
• 英文名称: N-(pyridin-3-yl)-3α,12α-dihydroxy-5β-cholan-24-amide
• 英文别名: (3alpha,5beta,12alpha)-3,12-dihydroxy-N-(pyridin-3-yl)cholan-24-amide；(4R)-4-[(3R,5R,8R,9S,10S,12S,13R,14S,17R)-3,12-dihydroxy-10,13-dimethyl-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthren-17-yl]-N-pyridin-3-ylpentanamide
• 化学式: C₂₉H₄₄N₂O₃
• 分子量: 468.68
• InChiKey: VVEBJZDKDJCYQK-FKKYTCBOSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.2
• 重原子数：
  34
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.79
• 拓扑面积：
  82.4
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  去氧胆酸 在 4-二甲氨基吡啶 、 草酰氯 、 三乙胺 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 potassium hydroxide 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 21.0h， 生成 N-(pyridin-3-yl)-3α,12α-dihydroxy-5β-cholan-24-amide
  参考文献：
  名称：

  胆汁酸的新型半合成衍生物作为有效的酪氨酰-DNA磷酸二酯酶1抑制剂。

  摘要：

  寻找肿瘤和神经退行性疾病的重要任务是寻找新的DNA修复系统酶抑制剂。酪氨酰-DNA磷酸二酯酶1（Tdp1）是一种DNA修复系统酶，与消除拓扑异构酶I抑制剂引起的DNA损伤有关。因此，降低Tdp1的活性可以增加当前使用的抗癌药的有效性。我们在此描述基于胆汁酸支架的一类新的半合成小分子Tdp1抑制剂，该抑制剂最初是通过虚拟筛选确定的。研究了胆汁酸的官能团（类固醇骨架中的羟基和乙酰氧基以及侧链中的酰胺片段）对抑制活性的影响。体外研究表明，半合成衍生物能够有效抑制Tdp1，IC50高达0.29 µM。此外，当对接至Tdp1酶的活性位点时，配体实现了极好的配合。

  DOI：

  10.3390/molecules23030679

文献信息

• Novel Semisynthetic Derivatives of Bile Acids as Effective Tyrosyl-DNA Phosphodiesterase 1 Inhibitors
  作者：Oksana Salomatina、Irina Popadyuk、Alexandra Zakharenko、Olga Zakharova、Dmitriy Fadeev、Nina Komarova、Jóhannes Reynisson、H. Arabshahi、Raina Chand、Konstantin Volcho、Nariman Salakhutdinov、Olga Lavrik

  DOI：10.3390/molecules23030679

  日期：——

  oncological and neurodegenerative diseases is the search for new inhibitors of DNA repair system enzymes. Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1 (Tdp1) is one of the DNA repair system enzymes involved in the removal of DNA damages caused by topoisomerase I inhibitors. Thus, reducing the activity of Tdp1 can increase the effectiveness of currently used anticancer drugs. We describe here a new class of semisynthetic

  寻找肿瘤和神经退行性疾病的重要任务是寻找新的DNA修复系统酶抑制剂。酪氨酰-DNA磷酸二酯酶1（Tdp1）是一种DNA修复系统酶，与消除拓扑异构酶I抑制剂引起的DNA损伤有关。因此，降低Tdp1的活性可以增加当前使用的抗癌药的有效性。我们在此描述基于胆汁酸支架的一类新的半合成小分子Tdp1抑制剂，该抑制剂最初是通过虚拟筛选确定的。研究了胆汁酸的官能团（类固醇骨架中的羟基和乙酰氧基以及侧链中的酰胺片段）对抑制活性的影响。体外研究表明，半合成衍生物能够有效抑制Tdp1，IC50高达0.29 µM。此外，当对接至Tdp1酶的活性位点时，配体实现了极好的配合。