platensimycin ML16

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷酸
• 英文名称: platensimycin ML16
• 英文别名: 5'-O-[(R)-Hydroxy{[(7beta,8alpha,9beta,10alpha,11beta,13alpha)-7-Hydroxy-19-Oxo-11,16-Epoxykauran-19-Yl]oxy}phosphoryl]adenosine；[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl] (1R,2R,4S,5R,9R,10S,11S,13S,14S)-2-hydroxy-5,9,13-trimethyl-12-oxapentacyclo[11.2.1.111,14.01,10.04,9]heptadecane-5-carboxylate
• 化学式: C₃₀H₄₂N₅O₁₀P
• 分子量: 663.665
• InChiKey: FXLLSKDPBMRMHG-INWXLQENSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.2
• 重原子数：
  46
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  9.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.8
• 拓扑面积：
  222
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  14

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  platensimycin ML16 、 辅酶 A 在 ferrous(II) sulfate heptahydrate 、 nonheme diiron monooxygenase PtmU₃ 、 PtmA₂ 、 氧气 、 维生素 C 作用下， 以 二甲基亚砜 为溶剂， 反应 17.0h， 生成 platensimycin ML18
  参考文献：
  名称：

  参与平板霉素和平板菌素生物合成的非血红素二铁单加氧酶的表征和晶体结构

  摘要：

  非血红素二铁单加氧酶构成了一个快速增长的加氧酶家族，在次级代谢中很少发现。在此，我们报告了非血红素二铁单加氧酶 PtmU3 的体内、体外和结构特征，该酶在平板霉素和平板霉素的统一生物合成中安装了一个 C-5 -羟基，这两种高度功能化的二萜类化合物可作为细菌和哺乳动物脂肪酸合成酶的有效和选择性抑制剂。这种羟基化作用为随后的 A 环裂解步骤奠定了基础，该步骤的关键是独特的二萜衍生支架的平板霉素和平板菌素。PtmU3 为此类酶采用了前所未有的磷酸丙糖异构酶 (TIM)-桶状结构折叠，并具有非经典的二铁活性位点结构，其饱和六配位铁中心缺乏 μ-氧桥。这项研究揭示了以前未知的 TIM 桶折叠酶超家族的第一个成员，用于金属依赖的双氧活化，其中大多数预测作用于 CoA 连接的底物，从而扩展了我们对自然界中非血红素二铁单加氧酶和TIM-桶折叠酶。

  DOI：

  10.1021/jacs.9b06183

文献信息

• Characterization and Crystal Structure of a Nonheme Diiron Monooxygenase Involved in Platensimycin and Platencin Biosynthesis
  作者：Liao-Bin Dong、Yu-Chen Liu、Alexis J. Cepeda、Edward Kalkreuter、Ming-Rong Deng、Jeffrey D. Rudolf、Changsoo Chang、Andrzej Joachimiak、George N. Phillips、Ben Shen

  DOI：10.1021/jacs.9b06183

  日期：2019.8.7

  group in the unified biosynthesis of platensimycin and platencin, two highly functional-ized diterpenoids that act as potent and selective inhibitors of bacterial and mammalian fatty acid synthases. This hydroxyla-tion sets the stage for the subsequent A-ring cleavage step key to the unique diterpene-derived scaffolds of platensimycin and platencin. PtmU3 adopts an unprecedented triosephosphate isomerase

  非血红素二铁单加氧酶构成了一个快速增长的加氧酶家族，在次级代谢中很少发现。在此，我们报告了非血红素二铁单加氧酶 PtmU3 的体内、体外和结构特征，该酶在平板霉素和平板霉素的统一生物合成中安装了一个 C-5 -羟基，这两种高度功能化的二萜类化合物可作为细菌和哺乳动物脂肪酸合成酶的有效和选择性抑制剂。这种羟基化作用为随后的 A 环裂解步骤奠定了基础，该步骤的关键是独特的二萜衍生支架的平板霉素和平板菌素。PtmU3 为此类酶采用了前所未有的磷酸丙糖异构酶 (TIM)-桶状结构折叠，并具有非经典的二铁活性位点结构，其饱和六配位铁中心缺乏 μ-氧桥。这项研究揭示了以前未知的 TIM 桶折叠酶超家族的第一个成员，用于金属依赖的双氧活化，其中大多数预测作用于 CoA 连接的底物，从而扩展了我们对自然界中非血红素二铁单加氧酶和TIM-桶折叠酶。