N⁹-xanthine acetic acid

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 咪唑并嘧啶类
• 英文名称: N⁹-xanthine acetic acid
• 英文别名: 2-(2,6-dioxo-3H-purin-9-yl)acetic acid
• 化学式: C₇H₆N₄O₄
• 分子量: 210.149
• InChiKey: VTQYQFOVGPLMGU-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.1
• 重原子数：
  15
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.14
• 拓扑面积：
  113
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  氯乙酸 、 黄嘌呤 在 sodium hydroxide 作用下， 反应 5.0h， 以38%的产率得到2-(2,6-dioxo-2,3-dihydro-1H-purin-7(6H)-yl)acetic acid
  参考文献：
  名称：

  PNA-Directed Triple-Helix Formation byN ⁷-Xanthine

  摘要：

  我们报告了未衍生化黄嘌呤与氯乙酸烷基化的首个例子，得到了可分离的N7-和N9-(亚甲基羧基)黄嘌呤混合物，并将其转化为与基于Fmoc的寡聚化学兼容的肽核酸单体。此外，我们还通过对2-N-异丁酰鸟苷进行烷基化，同时制备了N7-和N9-PNA的鸟苷单体，并进行了分离。分子建模结果表明，N7-黄嘌呤和N7-鸟苷与腺嘌呤和鸟苷形成同晶体三联体。我们还表明，含有N7-黄嘌呤的聚酰胺与三重螺旋的形成是兼容的。

  DOI：

  10.1055/s-2005-868503

文献信息

• PNA-Directed Triple-Helix Formation by<i>N</i> ⁷-Xanthine
  作者：Robert H. Hudson、Mykhaylo Goncharenko、Andrew P. Wallman、Filip Wojciechowski

  DOI：10.1055/s-2005-868503

  日期：——

  We report the first example of alkylation of underivatized xanthine with chloroacetic acid to yield a separable mixture of N 7- and N 9-(methylenecarboxyl)xanthine and its conversion to a peptide nucleic acid monomer compatible with Fmoc-based oligomerization chemistry. Additionally, we have simultaneously prepared the N 7 - and N 9-PNA monomers of guanine by alkylation of 2-N-isobutyrylguanine which were subsequently separated. Molecular modeling of the nucleobase base triplets indicates that N 7-xanthine and N 7-guanine form isomorphous triplets with adenine and guanine, respectively. We also show that polyamides containing N 7-xanthine are compatible with triple-helix formation.

  我们报告了未衍生化黄嘌呤与氯乙酸烷基化的首个例子，得到了可分离的N7-和N9-(亚甲基羧基)黄嘌呤混合物，并将其转化为与基于Fmoc的寡聚化学兼容的肽核酸单体。此外，我们还通过对2-N-异丁酰鸟苷进行烷基化，同时制备了N7-和N9-PNA的鸟苷单体，并进行了分离。分子建模结果表明，N7-黄嘌呤和N7-鸟苷与腺嘌呤和鸟苷形成同晶体三联体。我们还表明，含有N7-黄嘌呤的聚酰胺与三重螺旋的形成是兼容的。