1,2-bis(tert-butyldimethylsiloxy)propane

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机金属化合物 - 有机类金属化合物
• 英文名称: 1,2-bis(tert-butyldimethylsiloxy)propane
• 英文别名: 1,2-Propanediol, bis-DMTBS；tert-butyl-[1-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxypropan-2-yloxy]-dimethylsilane
• 化学式: C₁₅H₃₆O₂Si₂
• 分子量: 304.621
• InChiKey: ZQRKEAQIASQDNT-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.42
• 重原子数：
  19
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  1.0
• 拓扑面积：
  18.5
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  2

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1,2-bis(tert-butyldimethylsiloxy)propane 在 吡啶 、 氟化氢吡啶 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 以54%的产率得到2-tert-butyldimethylsiloxy-1-propanol
  参考文献：
  名称：

  亲核脱质子超过HDV核酶过渡态中的键形成的证据。

  摘要：

  蛋白质和RNA酶活性位点施加的立体约束对研究这些系统中的结构与功能之间的关系提出了重大挑战。作为一种规避HDV核酶中此类限制的策略，我们已经从丙二醇衍生物合成了亚磷酰胺，并将它们掺入RNA和DNA寡核苷酸的5'末端，从而产生了一系列新颖的底物，其亲核试剂通过宝石氟化作用受到电子干扰。在非酶的，氢氧化物催化的DNA底物的分子内转磷酸作用中，pH-速率曲线显示氟取代降低了最大速率和动力学p K a，与预期的吸电子效果一致。在HDV核酶反应中，我们观察到RNA底物相对有效地进行了磷酸化作用，这表明核酶催化并不需要严格要求由呋喃核糖环施加的构象约束。然而，与非酶反应相反，底物氟化适度增加了核酶的反应速率，这与以下机理一致：（1）2'-羟基亲核试剂主要以中性，质子化形式存在于基态，（2） 2'-羟基在速率确定步骤中带有一些负电荷，与2'-OH去质子化程度超过P–O键形成程度的过渡态一致。

  DOI：

  10.1021/acs.biochem.8b00031
• 作为产物：
  描述：

  1,2-丙二醇 、 叔丁基二甲基氯硅烷 在 咪唑 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 1.75h， 生成 1,2-bis(tert-butyldimethylsiloxy)propane
  参考文献：
  名称：

  Silicon-29 NMR Spectra of tert-Butyldimethylsilyl and Trimethylsilyl Derivatives of Some Non-Rigid Diols

  摘要：

  29Si核磁共振谱测定了选定二醇的三甲基硅基（TMS）和叔丁基二甲基硅基（TBDMS）衍生物在标准化条件下（即在稀释的CDCl3溶液中）。应用最近报道的TMS和TBDMS衍生物化学位移之间的相关性显示出明显和系统性的偏差，超过了实验误差和相关性误差估计。对偏差的两种可能解释是：两个笨重取代基之间的相互作用以及对简单羟基衍生物的报道相关性的无效性。对单羟基化合物的类似衍生物的独立研究表明，线性相关性成立，但斜率和截距与以前基于氨基酸衍生物研究所报告的值显著不同。对二醇衍生物获得的数据非常符合新的相关性，没有发现叔丁基TBDMS基团之间的相互作用的迹象。然而，在支链二醇衍生物中确实存在偏差，其中支链减少了氧原子表面与质子供体结合的可及性。当形成分子内氢键时，发现最大的偏差。

  DOI：

  10.1135/cccc19970761

文献信息

• Silicon-29 NMR Spectra of tert-Butyldimethylsilyl and Trimethylsilyl Derivatives of Some Non-Rigid Diols
  作者：Magdalena Kvíčalová、Vratislav Blechta、Krzysztof Kobylczyk、Ryszard Piekos、Jan Schraml

  DOI：10.1135/cccc19970761

  日期：——

  ²⁹Si NMR spectra of trimethylsilyl (TMS) and tert-butyldimethylsilyl (TBDMS) derivatives of selected diols were measured under standardized conditions (i.e., in diluted CDCl₃ solutions). Application of the recently reported correlation between the chemical shifts in TMS and TBDMS derivatives revealed considerable and systematic deviations which exceeded experimental errors and error estimates from the correlation. Two possible explanations of the deviations are considered: interaction between the two bulky substituent groups and invalidity of the reported correlation for simple hydroxy derivatives. An independent study of analogous derivatives of monohydroxy compounds has shown that the linear correlation holds but the slope and intercept are significantly different from those reported previously on the basis of a study of amino acid derivatives. The data obtained for the diol derivatives fit the new correlation very well and no indication of an interaction between the bulky TBDMS groups was noticed. However, deviations do occur in branched diol derivatives in which branching reduces accessibility of the oxygen atoms surface to associate with proton donors. The largest deviation was found when intramolecular hydrogen bond was formed.

  29Si核磁共振谱测定了选定二醇的三甲基硅基（TMS）和叔丁基二甲基硅基（TBDMS）衍生物在标准化条件下（即在稀释的CDCl3溶液中）。应用最近报道的TMS和TBDMS衍生物化学位移之间的相关性显示出明显和系统性的偏差，超过了实验误差和相关性误差估计。对偏差的两种可能解释是：两个笨重取代基之间的相互作用以及对简单羟基衍生物的报道相关性的无效性。对单羟基化合物的类似衍生物的独立研究表明，线性相关性成立，但斜率和截距与以前基于氨基酸衍生物研究所报告的值显著不同。对二醇衍生物获得的数据非常符合新的相关性，没有发现叔丁基TBDMS基团之间的相互作用的迹象。然而，在支链二醇衍生物中确实存在偏差，其中支链减少了氧原子表面与质子供体结合的可及性。当形成分子内氢键时，发现最大的偏差。
• Evidence That Nucleophile Deprotonation Exceeds Bond Formation in the HDV Ribozyme Transition State
  作者：Jun Lu、Selene C. Koo、Benjamin P. Weissman、Michael E. Harris、Nan-Sheng Li、Joseph A. Piccirilli

  DOI：10.1021/acs.biochem.8b00031

  日期：2018.6.26

  by a ribofuranose ring are not strictly required for ribozyme catalysis. In contrast to the nonenzymatic reactions, however, substrate fluorination modestly increases the ribozyme reaction rate, consistent with a mechanism in which (1) the 2′-hydroxyl nucleophile exists predominantly in its neutral, protonated form in the ground state and (2) the 2′-hydroxyl bears some negative charge in the rate-determining

  蛋白质和RNA酶活性位点施加的立体约束对研究这些系统中的结构与功能之间的关系提出了重大挑战。作为一种规避HDV核酶中此类限制的策略，我们已经从丙二醇衍生物合成了亚磷酰胺，并将它们掺入RNA和DNA寡核苷酸的5'末端，从而产生了一系列新颖的底物，其亲核试剂通过宝石氟化作用受到电子干扰。在非酶的，氢氧化物催化的DNA底物的分子内转磷酸作用中，pH-速率曲线显示氟取代降低了最大速率和动力学p K a，与预期的吸电子效果一致。在HDV核酶反应中，我们观察到RNA底物相对有效地进行了磷酸化作用，这表明核酶催化并不需要严格要求由呋喃核糖环施加的构象约束。然而，与非酶反应相反，底物氟化适度增加了核酶的反应速率，这与以下机理一致：（1）2'-羟基亲核试剂主要以中性，质子化形式存在于基态，（2） 2'-羟基在速率确定步骤中带有一些负电荷，与2'-OH去质子化程度超过P–O键形成程度的过渡态一致。