(4,4'-dimethoxytrityl)heptakis(ethylene glycol)

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: (4,4'-dimethoxytrityl)heptakis(ethylene glycol)
• 英文别名: 2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[Bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethanol；2-[2-[2-[2-[2-[2-[2-[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethanol
• 化学式: C₃₅H₄₈O₁₀
• 分子量: 628.76
• InChiKey: DJNLJPNBLCWJDK-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.1
• 重原子数：
  45
• 可旋转键数：
  26
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.49
• 拓扑面积：
  103
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-氰乙基N,N-二异丙基氯亚磷酰胺 、 (4,4'-dimethoxytrityl)heptakis(ethylene glycol) 在 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 0.33h， 以67%的产率得到(4,4'-dimethoxytrityl)heptakis(ethylene glycol) 2-cyanoethyl N,N-diisopropylphosphoramidite
  参考文献：
  名称：

  双链和三链 DNA 的非核苷酸环置换结构优化

  摘要：

  描述了系统地探索使用乙二醇 (EG) 寡聚体作为双链体和三链体 DNA 中核苷酸环的非核苷酸替代物的结构效应的研究。与先前描述的基于 EG 的接头相比，新的结构优化的环替换在双链体和三链体中更加稳定。一系列长度从三（乙二醇）到八（乙二醇）的化合物被衍生为一端的单二甲氧基三苯甲基醚和另一端的亚磷酰胺，以便能够通过自动化方法将它们整合到 DNA 链中。这些接头分子在扩展构象中的长度范围为 13 到 31 Å。它们被整合到一系列形成双链体和形成三链体的序列中，并通过热变性来测量相应螺旋的稳定性。在双链体系列中，结果表明最佳接头是源自七（乙二醇）的接头，它比之前研究的大多数环替换更长。这提供了比具有天然 T(4) 环的螺旋具有更高的热稳定性。在三链体系列中，环替换在四种不同的情况下进行了检查，其中环位于 5' 或 3' 方向，中央嘌呤靶链很短或延伸到环之外。结果表明，在所有情况下，源自八基（乙二醇

  DOI：

  10.1021/ja00126a004
• 作为产物：
  描述：

  O1-(二甲氧基三苯甲基)四乙烯GLYCOL 在 吡啶 、 六甲基磷酰三胺 、 4-二甲氨基吡啶 、 sodium hydride 、 caesium carbonate 作用下， 以 氯仿 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 42.5h， 生成 (4,4'-dimethoxytrityl)heptakis(ethylene glycol)
  参考文献：
  名称：

  双链和三链 DNA 的非核苷酸环置换结构优化

  摘要：

  描述了系统地探索使用乙二醇 (EG) 寡聚体作为双链体和三链体 DNA 中核苷酸环的非核苷酸替代物的结构效应的研究。与先前描述的基于 EG 的接头相比，新的结构优化的环替换在双链体和三链体中更加稳定。一系列长度从三（乙二醇）到八（乙二醇）的化合物被衍生为一端的单二甲氧基三苯甲基醚和另一端的亚磷酰胺，以便能够通过自动化方法将它们整合到 DNA 链中。这些接头分子在扩展构象中的长度范围为 13 到 31 Å。它们被整合到一系列形成双链体和形成三链体的序列中，并通过热变性来测量相应螺旋的稳定性。在双链体系列中，结果表明最佳接头是源自七（乙二醇）的接头，它比之前研究的大多数环替换更长。这提供了比具有天然 T(4) 环的螺旋具有更高的热稳定性。在三链体系列中，环替换在四种不同的情况下进行了检查，其中环位于 5' 或 3' 方向，中央嘌呤靶链很短或延伸到环之外。结果表明，在所有情况下，源自八基（乙二醇

  DOI：

  10.1021/ja00126a004

文献信息

• Structural Optimization of Non-Nucleotide Loop Replacements for Duplex and Triplex DNAs
  作者：Squire Rumney、Eric T. Kool

  DOI：10.1021/ja00126a004

  日期：1995.5

  greater thermal stability than one with a natural T(4) loop. In the triplex series, the loop replacements were examined in four separate situations, in which the loop lies in the 5' or 3' orientation and the central purine target strand is short or extends beyond the loop. Results show that in all cases the loop derived from octakis(ethylene glycol) (EG(8)) gives the greatest stability. In the cases

  描述了系统地探索使用乙二醇 (EG) 寡聚体作为双链体和三链体 DNA 中核苷酸环的非核苷酸替代物的结构效应的研究。与先前描述的基于 EG 的接头相比，新的结构优化的环替换在双链体和三链体中更加稳定。一系列长度从三（乙二醇）到八（乙二醇）的化合物被衍生为一端的单二甲氧基三苯甲基醚和另一端的亚磷酰胺，以便能够通过自动化方法将它们整合到 DNA 链中。这些接头分子在扩展构象中的长度范围为 13 到 31 Å。它们被整合到一系列形成双链体和形成三链体的序列中，并通过热变性来测量相应螺旋的稳定性。在双链体系列中，结果表明最佳接头是源自七（乙二醇）的接头，它比之前研究的大多数环替换更长。这提供了比具有天然 T(4) 环的螺旋具有更高的热稳定性。在三链体系列中，环替换在四种不同的情况下进行了检查，其中环位于 5' 或 3' 方向，中央嘌呤靶链很短或延伸到环之外。结果表明，在所有情况下，源自八基（乙二醇