Probing the human estrogen receptor-α binding requirements for phenolic mono- and di-hydroxyl compounds: A combined synthesis, binding and docking study
作者:Christopher McCullough、Terrence S. Neumann、Jayapal Reddy Gone、Zhengjie He、Christian Herrild、Julie Wondergem (nee Lukesh)、Rajesh K. Pandey、William A. Donaldson、Daniel S. Sem
DOI:10.1016/j.bmc.2013.11.024
日期:2014.1
Various estrogen analogs were synthesized and tested for binding to human ERα using a fluorescence polarization displacement assay. Binding affinity and orientation were also predicted using docking calculations. Docking was able to accurately predict relative binding affinity and orientation for estradiol, but only if a tightly bound water molecule bridging Arg394/Glu353 is present. Di-hydroxyl compounds
合成了各种雌激素类似物,并使用荧光偏振置换试验测试其与人 ERα 的结合。还使用对接计算预测了结合亲和力和方向。对接能够准确预测雌二醇的相对结合亲和力和方向,但前提是存在桥接 Arg394/Glu353 的紧密结合的水分子。二羟基化合物有时会以两个方向结合,这两个方向在其羟基的相对位置方面是相反的。预测二羟基化合物与其脂肪族羟基结合,与 ERα 中的 His524 相互作用。一种基于非甾体的二羟基化合物对 ERβ 的特异性是 ERα 的 1000 倍,并且对激动剂 ERβ 的特异性是拮抗剂活性的 25 倍。对接预测表明,这种特异性可能是由于脂肪族羟基与 ERβ 激动剂形式的 His475 与拮抗剂形式的 Thr299 的相互作用。但是,并非所有化合物都需要存在这种脂肪族羟基,因为单羟基(酚类)化合物通过与 ERα Arg394/Glu353/水三元组的羟基氢键相互作用以及范德华相互作用以高亲和力结合