chlorofluoromethanediphosphonate

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 有机膦酸及其衍生物
• 英文名称: chlorofluoromethanediphosphonate
• 英文别名: chlorofluoromethylenebis(phosphonic acid)；chlorofluoromethylenediphosphonic acid；[chloro(fluoro)phosphonomethyl]phosphonic acid；(Chloro-fluoro-phosphono-methyl)phosphonic acid；(chloro-fluoro-phosphonomethyl)phosphonic acid
• 化学式: CH₄ClFO₆P₂
• 分子量: 228.438
• InChiKey: PFMKUSJLTVEYCW-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.3
• 重原子数：
  11
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  1.0
• 拓扑面积：
  115
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  chlorofluoromethanediphosphonate 、 二环己胺 生成 (chloro-fluoro-phosphonomethyl)phosphonic acid;N-cyclohexylcyclohexanamine
  参考文献：
  名称：

  MCKENNA, CHARLES E.;KHAWLI, LESLIE A.;AHMAD, WAN YAACOB;PHAM, PHUONG;BONG+, PHOSPHORUS AND SULFUR., 37,(1988) N-2, C. 1-12

  摘要：

  DOI：
• 作为产物：
  描述：

  tetraisopropyl chlorofluoromethanediphosphonate 在 盐酸 作用下， 以 水 为溶剂， 反应 3.0h， 生成 chlorofluoromethanediphosphonate
  参考文献：
  名称：

  双膦酸盐生成的 ATP 类似物抑制细胞信号通路

  摘要：

  双膦酸盐是一类主要用于治疗骨质疏松症、佩吉特病和癌症的药物。已经提出它们通过抑制一种或多种靶标起作用，包括蛋白质异戊二烯化、表皮生长因子受体或腺嘌呤核苷酸移位酶。后者的抑制是由于 ATP 类似物在细胞中的形成：ATP 的异戊烯酯 (ApppI) 或 ATP 的 AppXp 型类似物，例如 AMP-氯膦酸盐 (AppCCl2p)。我们针对一组 369 种激酶筛选了 ApppI 和 AppCCl2p，发现 AppCCl2p 能有效抑制某些酪氨酸激酶，这归因于酪氨酸和末端膦酸酯之间形成强氢键。然后我们合成了在细胞中转化为其他 ATP 类似物的双膦酸盐前体药物，发现了抑制细胞信号通路的低 nM 激酶抑制剂。

  DOI：

  10.1021/jacs.8b02363

文献信息

• Completing the β,γ-CXY-dNTP Stereochemical Probe Toolkit: Synthetic Access to the dCTP Diastereomers and ³¹P and ¹⁹F NMR Correlations with Absolute Configurations
  作者：Pouya Haratipour、Corinne Minard、Maryam Nakhjiri、Amirsoheil Negahbani、Brian T. Chamberlain、Jorge Osuna、Thomas G. Upton、Michelle Zhao、Boris A. Kashemirov、Charles E. McKenna

  DOI：10.1021/acs.joc.0c01204

  日期：2020.11.20

  documented here, but the reductive deprotection step is not compatible with dCTP or the bromo substituent in β,γ-CHBr-dNTP analogues. To complete assembly of the toolkit, we describe an alternative synthetic strategy featuring ethylbenzylamine or phenylglycine-derived chiral BP synthons incorporating a photolabile protecting group. After acid-catalyzed removal of the (R)-(+)-α-ethylbenzylamine auxiliary

  β，γ-氧被一个CXY基团模拟的核苷5'-三磷酸（dNTP）类似物（β，γ-CXY-dNTPs）提供了有关DNA聚合酶催化和保真度的信息。CXY立体化学的定义对于阐明精确的结合模式非常重要。我们之前曾报道过通过P，C-二吗啉酰胺CHCl（6a，6b）和CHF（7a，7b）双膦酸酯制备的（R）-和（S）-β，γ-CHX-dGTP非对映异构体（X = F，Cl）（BPs）配备（R）-扁桃酸作为手性助剂，并使用H 2 / Pd进行最终脱保护。该方法还提供了β，γ-CHCl-dTTP（11a，11b），β，γ-CHF（12a，12b）和β，γ-CHCl（13a，13b）dATP非对映异构体，但还原脱保护步骤与dCTP或β，γ-CHBr中的溴取代基不相容-dNTP类似物。为了完成该工具包的组装，我们描述了一种替代合成策略，其特征在于乙基苄胺或苯基甘氨酸衍生的手性BP合成子并入了对光不稳定的保护基团。
• Transition State in DNA Polymerase β Catalysis: Rate-Limiting Chemistry Altered by Base-Pair Configuration
  作者：Keriann Oertell、Brian T. Chamberlain、Yue Wu、Elena Ferri、Boris A. Kashemirov、William A. Beard、Samuel H. Wilson、Charles E. McKenna、Myron F. Goodman

  DOI：10.1021/bi500101z

  日期：2014.3.25

  G•T). Brønsted plots of the catalytic rate constant (log(kpol)) versus pKa4 for the leaving group exhibit linear free energy relationships (LFERs) with negative slopes ranging from −0.6 to −2.0, consistent with chemical rate-determining transition-states in which the active-site adjusts to charge-stabilization demand during chemistry depending on base-pair configuration. The Brønsted slopes as well as

  对具有焦磷酸盐模拟 β,γ-pCXYp 离去基团和可变 X 和 Y 取代的 dNTP 类似物的动力学研究揭示了 DNA 聚合酶 β 的化学过渡态能量的显着差异，这取决于碱基配对构型的所有方面，包括传入的 dNTP 是嘌呤或嘧啶，并且碱基配对是正确的（T•A 和 G•C）还是错误的（T•G 和 G•T）。催化速率常数 (log( k pol )) 与 p K a4 的Brønsted 图离去基团表现出线性自由能关系 (LFER)，负斜率范围为 -0.6 至 -2.0，与化学速率决定过渡态一致，其中活性位点在化学过程中根据基数调整电荷稳定需求配对配置。Brønsted 斜率和截距显着不同，并提供了第一个直接证据表明酶-引物-模板复合物对 dNTP 碱基的识别触发了活性位点催化区域的构象变化，从而显着改变了决定速率的化学步骤.
• Halogenated β,γ-Methylene- and Ethylidene-dGTP-DNA Ternary Complexes with DNA Polymerase β: Structural Evidence for Stereospecific Binding of the Fluoromethylene Analogues
  作者：Vinod K. Batra、Lars C. Pedersen、William A. Beard、Samuel H. Wilson、Boris A. Kashemirov、Thomas G. Upton、Myron F. Goodman、Charles E. McKenna

  DOI：10.1021/ja909370k

  日期：2010.6.9

  enzyme that plays an important role in base excision repair (BER) and oncogenesis. We report X-ray crystallographic results for a series of beta,gamma-CXY dGTP analogues, where X,Y = H, F, Cl, Br, and/or CH(3). For all three R/S monofluorinated analogues examined (CHF, 3/4; CCH(3)F, 13/14; CClF 15/16), a single CXF-diastereomer (3, 13, 16) is observed in the active site complex, with the CXF fluorine

  核苷酸的β，γ-氟亚甲基类似物被认为是天然底物的有用模拟物，但尚无定义其活性位点相互作用的直接结构证据，包括在 CHF 碳上引入的新手性中心的影响，如β ,γ-氟亚甲基-dGTP，与 DNA 聚合酶 β 形成活性位点复合物，DNA 聚合酶是一种在碱基切除修复 (BER) 和肿瘤发生中起重要作用的修复酶。我们报告了一系列 beta、γ-CXY dGTP 类似物的 X 射线晶体学结果，其中 X、Y = H、F、Cl、Br 和/或 CH(3)。对于检查的所有三个 R/S 单氟化类似物（CHF，3/4；CCH(3)F，13/14；CClF 15/16），在活性位点观察到单个 CXF-非对映异构体（3、13、16）复杂的，CXF 氟原子与 Arg183 的胍 N 相距约 3 A（键合）距离。相比之下，对于 CHCl、CHBr 和 CHCH(3) 类似物，两种非对映异构体（6/7、8/9、10/11）大致相等地填充酶复合物中的
• McKenna, Charles E.; Khawli, Leslie A.; Ahmad, Wan-Yaacob, Phosphorus and Sulfur and the Related Elements, 1988, vol. 37, p. 1 - 12
  作者：McKenna, Charles E.、Khawli, Leslie A.、Ahmad, Wan-Yaacob、Pham, Phuong、Bongartz, Jean-Pierre

  DOI：——

  日期：——