N-(2-(2-(2-(2-(4-((4-(4-(5,5-dioxido-4H-thieno[3,2-c]thiochromene-2-carbonyl)piperazin-1-yl)phenoxy)methyl)-1H-1,2,3-triazol-1-yl)ethoxy)ethoxy)ethoxy)ethyl)-5-((3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl)pentanamide

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 生物素及其衍生物
• 英文名称: N-(2-(2-(2-(2-(4-((4-(4-(5,5-dioxido-4H-thieno[3,2-c]thiochromene-2-carbonyl)piperazin-1-yl)phenoxy)methyl)-1H-1,2,3-triazol-1-yl)ethoxy)ethoxy)ethoxy)ethyl)-5-((3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl)pentanamide
• 英文别名: ML349-biotin；5-[(3aS,4S,6aR)-2-oxo-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]-N-[2-[2-[2-[2-[4-[[4-[4-(5,5-dioxo-4H-thieno[3,2-c]thiochromene-2-carbonyl)piperazin-1-yl]phenoxy]methyl]triazol-1-yl]ethoxy]ethoxy]ethoxy]ethyl]pentanamide
• 化学式: C₄₃H₅₄N₈O₉S₃
• 分子量: 923.148
• InChiKey: UHTZSHFDYVGELL-VXMGAWDISA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.1
• 重原子数：
  63
• 可旋转键数：
  22
• 环数：
  8.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.51
• 拓扑面积：
  258
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  14

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  1-对羟基苯基哌嗪 在 potassium carbonate 、 O-(1H-benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 、 copper(II) sulfate 、 sodium ascorbate 、 N,N-二异丙基乙胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 、 二甲基亚砜 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 65.0h， 生成 N-(2-(2-(2-(2-(4-((4-(4-(5,5-dioxido-4H-thieno[3,2-c]thiochromene-2-carbonyl)piperazin-1-yl)phenoxy)methyl)-1H-1,2,3-triazol-1-yl)ethoxy)ethoxy)ethoxy)ethyl)-5-((3aS,4S,6aR)-2-oxohexahydro-1H-thieno[3,4-d]imidazol-4-yl)pentanamide
  参考文献：
  名称：

  酰基蛋白质硫酯酶2类选择性竞争抑制剂的基于亲和力的选择性分析。

  摘要：

  基于活性的蛋白质谱分析（ABPP）彻底改变了跨不同酶家族的活性位点配体的发现和优化，为同类选择性谱分析提供了强大的平台。但是，这种方法对于分析可逆抑制剂的方法不太直接，并且不能访问ABPP探针目标图谱以外的蛋白质。尽管活性位点竞争性酰基蛋白硫酯酶2抑制剂ML349（Ki = 120 nM）在丝氨酸水解酶家族中具有高度选择性，但它仍可与其他细胞靶标相互作用。在这里，我们提出了一种化学代谢的工作流程，以丰富和剖析候选ML349结合蛋白。在人细胞裂解物中，生物素化的ML349丰富了一组重复出现的蛋白质，包括可能由亲和力驱动的多聚体相互作用增强的代谢物激酶和黄素依赖性氧化还原酶。通过天然质谱和荧光偏振进行的确证分析迅速将这些弱的脱靶目标进行了排序，从而为探索ABPP以外的配体相互作用和化学计量提供了依据。

  DOI：

  10.1021/acsmedchemlett.6b00441

文献信息

• Affinity-Based Selectivity Profiling of an In-Class Selective Competitive Inhibitor of Acyl Protein Thioesterase 2
  作者：Sang Joon Won、Joseph D. Eschweiler、Jaimeen D. Majmudar、Fei San Chong、Sin Ye Hwang、Brandon T. Ruotolo、Brent R. Martin

  DOI：10.1021/acsmedchemlett.6b00441

  日期：2017.2.9

  distinct enzyme families, providing a robust platform for in-class selectivity profiling. Nonetheless, this approach is less straightforward for profiling reversible inhibitors and does not access proteins outside the ABPP probe's target profile. While the active-site competitive acyl protein thioesterase 2 inhibitor ML349 (Ki = 120 nM) is highly selective within the serine hydrolase enzyme family, it could

  基于活性的蛋白质谱分析（ABPP）彻底改变了跨不同酶家族的活性位点配体的发现和优化，为同类选择性谱分析提供了强大的平台。但是，这种方法对于分析可逆抑制剂的方法不太直接，并且不能访问ABPP探针目标图谱以外的蛋白质。尽管活性位点竞争性酰基蛋白硫酯酶2抑制剂ML349（Ki = 120 nM）在丝氨酸水解酶家族中具有高度选择性，但它仍可与其他细胞靶标相互作用。在这里，我们提出了一种化学代谢的工作流程，以丰富和剖析候选ML349结合蛋白。在人细胞裂解物中，生物素化的ML349丰富了一组重复出现的蛋白质，包括可能由亲和力驱动的多聚体相互作用增强的代谢物激酶和黄素依赖性氧化还原酶。通过天然质谱和荧光偏振进行的确证分析迅速将这些弱的脱靶目标进行了排序，从而为探索ABPP以外的配体相互作用和化学计量提供了依据。