受到许多报道的 DNA 编码
化学库在具有蛋白质靶标的药物发现项目中的成功应用的启发,我们决定将此平台应用于核酸靶标。我们使用了 33 个不同的 DNA 编码
化学文库和亲和介导选择的 1200 亿化合物组来发现一组 DNA 靶标的结合物。在这里,我们报告成功发现了与 DNA G 四重体特异性相互作用的小分子,这些小分子是在
基因组 DNA 的富含 G 的区域(包括癌
基因的启动子区域)中发现的稳定结构基序。在这项研究中,我们选择了在 c-myc 启动子中发现的 G-四重奏序列作为主要目标。使用针对该目标的亲和介导选择富集的化合物表现出对不含 G-四重体基序的 DNA 序列的高亲和力结合和高特异性。这些化合物表现出区分不同 G-四重体基序的中等能力,并且在基于细胞的测定中也表现出活性,表明细胞中的直接靶标参与。DNA 编码的
化学文库和亲和介导的选择特别适合发现与在细胞环境之外没有固有活性的靶标的结