氯膦酸盐杂质D | 87591-00-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 有机膦酸及其衍生物
• 中文名称: 氯膦酸盐杂质D
• 英文名称: chloromethanediphosphonate
• 英文别名: chloromethanediphosphonic acid；[chloro(phosphono)methyl]phosphonic acid；(chloromethylene)diphosphonic acid；(chloromethanediyl)bis(phosphonic acid)
• CAS: 87591-00-2
• 化学式: CH₅ClO₆P₂
• mdl: MFCD00184529
• 分子量: 210.448
• InChiKey: FVXIZAQSPMLAMD-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  535.6±60.0 °C(Predicted)
• 密度：
  2.212±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.6
• 重原子数：
  10
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  1.0
• 拓扑面积：
  115
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-对甲苯磺酸腺苷 、 氯膦酸盐杂质D 生成 [[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]-chloromethyl]phosphonic acid
  参考文献：
  名称：

  BLACKBURN, G. MICHAEL;GUO, MAO-JUN;LANGSTON, STEVEN P.;TAYLOR, GRAHAM E., TETRAHEDRON LETT., 31,(1990) N9, C. 5637-5640

  摘要：

  DOI：
• 作为产物：
  描述：

  tetra-isopropyl monochloromethylene bisphosphonate 在 盐酸 作用下， 以 乙醇 、 水 为溶剂， 反应 24.0h， 生成 氯膦酸盐杂质D
  参考文献：
  名称：

  通过相反的pH依赖性的CEST效应，使用Co II 2 MRI探针进行比例pH成像

  摘要：

  我们报告了一种基于Co 2的磁共振（MR）探针，该探针能够通过化学交换饱和转移（CEST）实现比例定量和pH值成像。该方法在一系列具有CEST活性四（羧酰胺）和/或羟基取代的双膦酸酯配体的耐空气和水稳定性的Co II 2配合物中得到了说明。对于带有两个配体的复合物，可变pH的CEST和NMR分析显示出高度偏移的羧酰胺峰和羟基峰，其强度分别随pH的增加而增加和减少。在6.5-7.6的生理范围内，将104和64 ppm处CEST峰强度的比率与溶液pH相关联，以构建log（CEST 104 ppm / CEST 64 ppm）相对于pH值，在37°C时具有0.99（7）pH单位–1的极高pH敏感性。相反，具有CEST失活的双膦酸酯配体的类似Co II 2配合物则没有这种pH响应，这证明pH敏感性是由于酰胺和羟基CEST效应的整合而产生的，后者分别显示了碱和酸催化的质子交换。重要的是，pH校准曲线

  DOI：

  10.1021/jacs.7b08574

文献信息

• Completing the β,γ-CXY-dNTP Stereochemical Probe Toolkit: Synthetic Access to the dCTP Diastereomers and ³¹P and ¹⁹F NMR Correlations with Absolute Configurations
  作者：Pouya Haratipour、Corinne Minard、Maryam Nakhjiri、Amirsoheil Negahbani、Brian T. Chamberlain、Jorge Osuna、Thomas G. Upton、Michelle Zhao、Boris A. Kashemirov、Charles E. McKenna

  DOI：10.1021/acs.joc.0c01204

  日期：2020.11.20

  documented here, but the reductive deprotection step is not compatible with dCTP or the bromo substituent in β,γ-CHBr-dNTP analogues. To complete assembly of the toolkit, we describe an alternative synthetic strategy featuring ethylbenzylamine or phenylglycine-derived chiral BP synthons incorporating a photolabile protecting group. After acid-catalyzed removal of the (R)-(+)-α-ethylbenzylamine auxiliary

  β，γ-氧被一个CXY基团模拟的核苷5'-三磷酸（dNTP）类似物（β，γ-CXY-dNTPs）提供了有关DNA聚合酶催化和保真度的信息。CXY立体化学的定义对于阐明精确的结合模式非常重要。我们之前曾报道过通过P，C-二吗啉酰胺CHCl（6a，6b）和CHF（7a，7b）双膦酸酯制备的（R）-和（S）-β，γ-CHX-dGTP非对映异构体（X = F，Cl）（BPs）配备（R）-扁桃酸作为手性助剂，并使用H 2 / Pd进行最终脱保护。该方法还提供了β，γ-CHCl-dTTP（11a，11b），β，γ-CHF（12a，12b）和β，γ-CHCl（13a，13b）dATP非对映异构体，但还原脱保护步骤与dCTP或β，γ-CHBr中的溴取代基不相容-dNTP类似物。为了完成该工具包的组装，我们描述了一种替代合成策略，其特征在于乙基苄胺或苯基甘氨酸衍生的手性BP合成子并入了对光不稳定的保护基团。
• Transition State in DNA Polymerase β Catalysis: Rate-Limiting Chemistry Altered by Base-Pair Configuration
  作者：Keriann Oertell、Brian T. Chamberlain、Yue Wu、Elena Ferri、Boris A. Kashemirov、William A. Beard、Samuel H. Wilson、Charles E. McKenna、Myron F. Goodman

  DOI：10.1021/bi500101z

  日期：2014.3.25

  G•T). Brønsted plots of the catalytic rate constant (log(kpol)) versus pKa4 for the leaving group exhibit linear free energy relationships (LFERs) with negative slopes ranging from −0.6 to −2.0, consistent with chemical rate-determining transition-states in which the active-site adjusts to charge-stabilization demand during chemistry depending on base-pair configuration. The Brønsted slopes as well as

  对具有焦磷酸盐模拟 β,γ-pCXYp 离去基团和可变 X 和 Y 取代的 dNTP 类似物的动力学研究揭示了 DNA 聚合酶 β 的化学过渡态能量的显着差异，这取决于碱基配对构型的所有方面，包括传入的 dNTP 是嘌呤或嘧啶，并且碱基配对是正确的（T•A 和 G•C）还是错误的（T•G 和 G•T）。催化速率常数 (log( k pol )) 与 p K a4 的Brønsted 图离去基团表现出线性自由能关系 (LFER)，负斜率范围为 -0.6 至 -2.0，与化学速率决定过渡态一致，其中活性位点在化学过程中根据基数调整电荷稳定需求配对配置。Brønsted 斜率和截距显着不同，并提供了第一个直接证据表明酶-引物-模板复合物对 dNTP 碱基的识别触发了活性位点催化区域的构象变化，从而显着改变了决定速率的化学步骤.
• Halogenated β,γ-Methylene- and Ethylidene-dGTP-DNA Ternary Complexes with DNA Polymerase β: Structural Evidence for Stereospecific Binding of the Fluoromethylene Analogues
  作者：Vinod K. Batra、Lars C. Pedersen、William A. Beard、Samuel H. Wilson、Boris A. Kashemirov、Thomas G. Upton、Myron F. Goodman、Charles E. McKenna

  DOI：10.1021/ja909370k

  日期：2010.6.9

  enzyme that plays an important role in base excision repair (BER) and oncogenesis. We report X-ray crystallographic results for a series of beta,gamma-CXY dGTP analogues, where X,Y = H, F, Cl, Br, and/or CH(3). For all three R/S monofluorinated analogues examined (CHF, 3/4; CCH(3)F, 13/14; CClF 15/16), a single CXF-diastereomer (3, 13, 16) is observed in the active site complex, with the CXF fluorine

  核苷酸的β，γ-氟亚甲基类似物被认为是天然底物的有用模拟物，但尚无定义其活性位点相互作用的直接结构证据，包括在 CHF 碳上引入的新手性中心的影响，如β ,γ-氟亚甲基-dGTP，与 DNA 聚合酶 β 形成活性位点复合物，DNA 聚合酶是一种在碱基切除修复 (BER) 和肿瘤发生中起重要作用的修复酶。我们报告了一系列 beta、γ-CXY dGTP 类似物的 X 射线晶体学结果，其中 X、Y = H、F、Cl、Br 和/或 CH(3)。对于检查的所有三个 R/S 单氟化类似物（CHF，3/4；CCH(3)F，13/14；CClF 15/16），在活性位点观察到单个 CXF-非对映异构体（3、13、16）复杂的，CXF 氟原子与 Arg183 的胍 N 相距约 3 A（键合）距离。相比之下，对于 CHCl、CHBr 和 CHCH(3) 类似物，两种非对映异构体（6/7、8/9、10/11）大致相等地填充酶复合物中的
• β,γ-CHF- and β,γ-CHCl-dGTP Diastereomers: Synthesis, Discrete ³¹P NMR Signatures, and Absolute Configurations of New Stereochemical Probes for DNA Polymerases
  作者：Yue Wu、Valeria M. Zakharova、Boris A. Kashemirov、Myron F. Goodman、Vinod K. Batra、Samuel H. Wilson、Charles E. McKenna

  DOI：10.1021/ja300218x

  日期：2012.5.30

  characterized by (31)P, (1)H, and (19)F NMR spectroscopy and by mass spectrometry. After treatment with Chelex-100 to remove traces of paramagnetic ions, at pH ~10 the diastereomer pairs 12a,b exhibit discrete P(α) and P(β)(31)P resonances. The more upfield P(α) and more downfield P(β) resonances (and also the more upfield (19)F NMR resonance in 12b) are assigned to the R configuration at the P(β)-CHX-P(γ)

  脱氧核苷 5'-三磷酸类似物（其中 β,γ-桥氧已被 CXY 基团取代）是研究 DNA 聚合酶催化和碱基选择机制的有用化学探针。此类探针的局限性在于，当桥接碳取代不等价（X≠Y）时，常规合成方法会产生非对映异构体的混合物。我们在这里报告了这个长期存在的问题的通用解决方案，其中包括四个 β,γ-CXY dNTP 非对映体示例：(S)- 和 (R)-β,γ-CHCl-dGTP (12a-1/12a-2) 和(S)-和(R)-β,γ-CHF-dGTP (12b-1/12b-2)。其制备的核心是将前手性母体双膦酸转化为其 (R)-扁桃酸单酯的 P,C-二吗啉酰胺衍生物 7，从而获得各个非对映异构体 7a-1、7a-2、7b-1、和7b-2通过制备型HPLC。然后选择性酸性水解 PN 键，得到“门户”非对映异构体，该非对映异构体很容易与吗啉激活的 dGMP 偶联。通过 H(2) (Pd/C) 去除手性辅助物，得到四种单独的非对映核苷酸
• Jurisson, Silvia S.; Benedict, James J.; Elder, Inorganic Chemistry, 1983, vol. 22, # 9, p. 1332 - 1338
  作者：Jurisson, Silvia S.、Benedict, James J.、Elder、Whittle、Deutsch, Edward

  DOI：——

  日期：——