3alpha,12alpha-Dihydroxy-5beta-cholanate

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 类固醇和类固醇衍生物
• 英文名称: 3alpha,12alpha-Dihydroxy-5beta-cholanate
• 英文别名: (4R)-4-[(3R,5R,8R,9S,10S,12S,13R,14S,17R)-3,12-dihydroxy-10,13-dimethyl-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthren-17-yl]pentanoate
• 化学式: C24H39O4-
• 分子量: 391.6
• InChiKey: KXGVEGMKQFWNSR-LLQZFEROSA-M

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.6
• 重原子数：
  28
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.96
• 拓扑面积：
  80.6
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3alpha,12alpha-Dihydroxy-5beta-cholanate 、 UDP-alpha-D-glucuronate(3-) 生成 1-O-(3alpha,12alpha-dihydroxy-24-oxo-5beta-cholan-24-yl)-beta-D-glucopyranuronate 、 UDP
  参考文献：
  名称：

  The Human UDP-Glucuronosyltransferase UGT2A1 and UGT2A2 Enzymes Are Highly Active in Bile Acid Glucuronidation

  摘要：

  胆汁酸（BA）是脂质、葡萄糖和胆固醇稳态的重要调节剂，但在胆汁淤积的肝脏中会产生细胞毒性。由UDP-葡萄糖醛酸转移酶（UGT）催化的葡萄糖醛酸化是BA解毒过程中一个重要的药理过程。本研究对2A亚家族中研究较少的人UGTs的BA结合活性进行了表征：UGT2A1、2A2和2A3。在杆状病毒感染的昆虫细胞中表达的重组UGT2A对六种主要胆汁酸的葡萄糖醛酸化进行了检测：鹅去氧胆酸（CDCA）、胆酸（CA）、石胆酸（LCA）、脱氧胆酸（DCA）、牛胆酸（HCA）和猪去氧胆酸（HDCA）。UGT2A3对所有测试的BA底物表现出可检测但非常低的活性。UGT2A1在形成LCA-3和LCA-24G、CDCA-24、DCA-24、HCA-24和HDCA-24G方面非常高效，而UGT2A2是形成CA-24G和CDCA-24G的最活跃的酶，并且能够产生HDCA-6G、HDCA-24G、LCA-24G和HCA-24G。UGT2A1的K m

  DOI：

  10.1124/dmd.113.052613
• 作为产物：
  描述：

  Glycodeoxycholate 、 水 生成 3alpha,12alpha-Dihydroxy-5beta-cholanate 、 聚甘氨酸
  参考文献：
  名称：

  长双歧杆菌胆汁盐水解酶的生化和遗传学表征。

  摘要：

  从长双歧杆菌SBT2928分离出胆汁盐水解酶（BSH），纯化并鉴定。此外，我们首次描述了双歧杆菌属成员中编码BSH（bsh）的基因的克隆和分析。根据推导的氨基酸序列测定，该酶的天然分子量为125,000-130,000，亚单位分子量为35,024，表明该酶是四聚体。长双歧杆菌BSH的最适pH为5至7，最适温度为40℃。该酶被硫醇酶抑制剂强烈抑制，表明Cys残基可能参与催化反应。长双歧杆菌的BSH可以水解所有六种主要的人胆汁盐和至少两种动物胆汁盐。基于特异性和K（m）值，检测到对甘氨酸缀合的胆汁酸略有偏爱。确定了bsh的核苷酸序列，并将其用于同源性研究，转录本分析以及各种突变体的构建和分析。与其他细菌的BSH和球形芽孢杆菌的青霉素V酰基转移酶（PVA）的同源性很高。基于已经阐明晶体结构的BSH和PVA的相似性，可以将BSH分类为N末端亲核水解酶，而将Cys作为N末端氨基酸。通过定点诱变进行的

  DOI：

  10.1128/aem.66.6.2502-2512.2000

文献信息

• CYP3A Specifically Catalyzes 1 -Hydroxylation of Deoxycholic Acid: Characterization and Enzymatic Synthesis of a Potential Novel Urinary Biomarker for CYP3A Activity
  作者：M. A. Hayes、X.-Q. Li、G. Gronberg、U. Diczfalusy、T. B. Andersson

  DOI：10.1124/dmd.116.070805

  日期：2016.8.2

  The endogenous bile acid metabolite 1β-hydroxy-deoxycholic acid (1β-OH-DCA) excreted in human urine may be used as a sensitive CYP3A biomarker in drug development reflecting in vivo CYP3A activity. An efficient and stereospecific enzymatic synthesis of 1β-OH-DCA was developed using a Bacillus megaterium (BM3) cytochrome P450 (P450) mutant, and its structure was confirmed by nuclear magnetic resonance

  在人尿中分泌的内源胆汁酸代谢物1β-羟基-脱氧胆酸（1β-OH-DCA）可用作反映体内CYP3A活性的敏感CYP3A生物标志物。利用巨大芽孢杆菌（BM3）细胞色素P450（P450）突变体开发了有效的立体定向酶促合成1β-OH-DCA，并通过核磁共振（NMR）光谱证实了其结构。还制备了[（2）H4]标记的1β-OH-DCA类似物。通过与UPLC-HRMS分析的合成参考文献进行比较，将人肝微粒体温育中脱氧胆酸（DCA）的主要羟基化代谢产物鉴定为1β-OH-DCA。CYP3A抑制剂酮康唑强烈抑制其形成。对21种重组人细胞色素P450（P450）酶的筛选显示，除肝外CYP46A1外，最丰富的肝脏P450亚家族CYP3A，包括CYP3A4、3A5和3A7，特别地催化了1β-OH-DCA的形成。这表明DCA的1β-羟基化可能是体外CYP3A活性的有用标志物反应。人肝细胞中DCA和1β-OH-DCA的
• The bile acid-inducible baiB gene from Eubacterium sp. strain VPI 12708 encodes a bile acid-coenzyme A ligase
  作者：D H Mallonee、J L Adams、P B Hylemon

  DOI：10.1128/jb.174.7.2065-2071.1992

  日期：1992.4

  baiB gene from Eubacterium sp. strain VPI 12708 was previously cloned, sequenced, and shown to be part of a large bile acid-inducible operon encoding polypeptides believed to be involved in bile acid 7 alpha-dehydroxylation. In the present study, the baiB gene was subcloned and expressed in Escherichia coli and shown to encode a bile acid-coenzyme A (CoA) ligase. This ligase required a C-24 bile acid

  来自Eubacterium sp。的baiB基因。菌株VPI 12708先前已被克隆，测序，并显示出是大胆汁酸诱导的操纵子编码多肽的一部分，该多肽被认为与胆汁酸7α-脱羟基有关。在本研究中，baiB基因被亚克隆并在大肠杆菌中表达，并显示其编码胆汁酸辅酶A（CoA）连接酶。该连接酶需要具有游离羧基，ATP，Mg2 +和CoA的C-24胆汁酸来合成最终的胆汁酸-CoA共轭物。通过反相高效液相色谱法进行的产物分析显示，最终反应产物与胆甾醇CoA和AMP竞争。当反应混合物中未加入CoA时，检测到推测的胆汁酸-AMP中间体。胆汁酸-CoA连接酶与涉及AMP或CoA的ATP依赖性连接的其他几种多肽的氨基酸序列相似，与环状羧化化合物。胆汁酸-CoA的连接被认为是真细菌中胆汁酸7α-脱羟基途径的第一步。VPI 12708株。
• A biosynthetic pathway for a prominent class of microbiota-derived bile acids
  作者：A Sloan Devlin、Michael A Fischbach

  DOI：10.1038/nchembio.1864

  日期：2015.9

  A bioinformatic and phylogenetic search identifies five enzymes involved in the conversion of DCA to isoDCA in the bacterial bile acid biosynthetic pathway. An investigation of the biological roles of bile acids defines a mutualism between the producer R. gnavus and the nonproducer Bacteroides. The gut bile acid pool is millimolar in concentration, varies widely in composition among individuals and is linked to metabolic disease and cancer. Although these molecules are derived almost exclusively from the microbiota, remarkably little is known about which bacterial species and genes are responsible for their biosynthesis. Here we report a biosynthetic pathway for the second most abundant class in the gut, 3β-hydroxy(iso)-bile acids, whose levels exceed 300 μM in some humans and are absent in others. We show, for the first time, that iso–bile acids are produced by Ruminococcus gnavus, a far more abundant commensal than previously known producers, and that the iso–bile acid pathway detoxifies deoxycholic acid and thus favors the growth of the keystone genus Bacteroides. By revealing the biosynthetic genes for an abundant class of bile acids, our work sets the stage for predicting and rationally altering the composition of the bile acid pool.

  通过生物信息学和系统发生学搜索，确定了在细菌胆汁酸生物合成途径中参与将二氯苯甲醚（DCA）转化为异二氯苯甲醚（isoDCA）的五种酶。对胆汁酸生物学作用的研究确定了生产者 R. gnavus 和非生产者 Bacteroides 之间的互作关系。 肠道胆汁酸池的浓度为毫摩尔，个体之间的组成差异很大，并且与代谢疾病和癌症有关。虽然这些分子几乎全部来自微生物群，但人们对负责其生物合成的细菌种类和基因知之甚少。在这里，我们报告了肠道中含量第二高的3δ²-羟基（异）-胆酸的生物合成途径，在一些人体内，3δ²-羟基（异）-胆酸的含量超过300 ¼M，而在另一些人体内则没有。我们首次发现gnavus反刍球菌能产生异胆酸，它是一种比以前已知的生产者更丰富的共生菌，异胆酸途径能解毒脱氧胆酸，从而有利于关键菌属Bacteroides的生长。通过揭示一类丰富胆汁酸的生物合成基因，我们的工作为预测和合理改变胆汁酸库的组成奠定了基础。
• Ye H.Q.; Mallonee D.H.; Wells J.E., J Lipid Res, 1999, 0022-2275, 17-23
  作者：Ye H.Q.、Mallonee D.H.、Wells J.E.、Bjorkhem I.、Hylemon P.B.

  DOI：——

  日期：——
• Hylemon P.B.; Melone P.D.; Franklund C.V., J Lipid Res, 1991, 0022-2275, 89-96
  作者：Hylemon P.B.、Melone P.D.、Franklund C.V.、Lund E.、Bjorkhem I.

  DOI：——

  日期：——