1-(3-C-methyl-2,3-dideoxy-β-D-erythro-pentofuranosyl)thymine | 121687-71-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 1-(3-C-methyl-2,3-dideoxy-β-D-erythro-pentofuranosyl)thymine
• 英文别名: 1-(2,3-dideoxy-3-C-methyl-β-D-erythro-pentofuranosyl)thymine；1-[(2R,4S,5S)-5-(hydroxymethyl)-4-methyloxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 121687-71-6
• 化学式: C₁₁H₁₆N₂O₄
• 分子量: 240.259
• InChiKey: HSPRVZHNPSWIJU-NBEYISGCSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.2
• 重原子数：
  17
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.64
• 拓扑面积：
  78.9
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  1-(5-O-benzoyl-2,3-dideoxy-3-C-methyl-β-D-erythro-pentofuranosyl)thymine 在 氨 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 12.0h， 以86%的产率得到1-(3-C-methyl-2,3-dideoxy-β-D-erythro-pentofuranosyl)thymine
  参考文献：
  名称：

  3'-脱氧-3'-C-甲基核苷衍生物的合成。

  摘要：

  合成带有五个天然存在的核酸碱基的2'，3'-二脱氧-3'-C-甲基核苷。另外，制备了带有5-氨基咪唑-4-羧酰胺以及1,2,4-三唑-3-羧酰胺部分的3'-脱氧-3'-C-甲基核苷类似物。还完成了相应的2'，3'-二脱氧-3'-C-甲基三唑衍生物的合成。通过从它们的3'-脱氧-3'-C-甲基母体核糖核苷进行自由基脱氧制备二脱氧核苷衍生物。当在细胞培养实验中评估其抗病毒活性时，这些化合物均未显示任何显着的抗病毒活性。

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2008.06.011

文献信息

• Synthesis and evaluation of a series of 1-(3-alkyl-2,3-dideoxy-α,β-d-erythro-pentofuranosyl)thymines
  作者：Kwasi Agyei-Aye、David C. Baker

  DOI：10.1016/0008-6215(88)84079-5

  日期：1988.12

  A series of 1-(3-alkyl-2,3-dideoxy-alpha,beta-D-erythro-pentofuranosyl)thymines (3'-alkyl-3'-deoxythymidines) has been prepared from 5-O-(tert-butyldiphenylsilyl)-2,3-dideoxy-D-glycero-pent-2- enono-1,4-lactone ((S)-5-[(tert-butyldiphenylsilyl)oxymethyl]-2(5H)- furanone) by Michael addition of the appropriate organocopper reagent, followed by reduction of the lactone, acetylation of the resulting hemiacetal

  由5-O-（叔丁基二苯基甲硅烷基）制备了一系列1-（3-烷基-2,3-二脱氧-α，β-D-赤型-呋喃呋喃糖基）胸腺嘧啶（3'-烷基-3'-脱氧胸苷） ）-2,3-二脱氧-D-甘油-2-烯诺-1,4-内酯（（S）-5-[（叔丁基二苯基甲硅烷基）氧基甲基] -2（5H）-呋喃酮）适当的有机铜试剂，然后还原内酯，使所得的半缩醛乙酰化，并用三氟甲磺酸三甲基甲硅烷基酯催化与2，4-二-O-（三甲基甲硅烷基）胸腺嘧啶偶联。通过使用氟化四丁基铵使被保护的核苷脱甲硅烷基化，得到游离核苷的端基异构体混合物。类似地，由5-O-（叔丁基二苯基甲硅烷基）-2，3-二脱氧-D-甘油-戊烯-1制备未取代的2'，3'-二脱氧核苷类似物。
• STACKING NUCLEIC ACID AND METHODS FOR USE THEREOF
  申请人：Schneider Uffe Vest

  公开号：US20140065676A1

  公开（公告）日：2014-03-06

  The present invention provides a novel modified oligonucleotide monomer useful in molecular biological techniques such as capture and/or detection of nucleic acids, amplification of nucleic acids and sequencing of nucleic acids. The modified oligonucleotide monomer comprises an intercalator that can intercalate into an antiparallel duplex from the major groove.

  本发明提供了一种新型的修饰寡核苷酸单体，在分子生物学技术中具有捕获和/或检测核酸、核酸扩增和核酸测序等方面的应用。该修饰寡核苷酸单体包括一种可以插入到反平行双链的主沟槽中的插入剂。
• MULTIMERIC OLIGONUCLEOTIDE COMPOUNDS
  申请人：Translate Bio MA, Inc.

  公开号：EP3533873A1

  公开（公告）日：2019-09-04

  The disclosure provides multimeric oligonucleotide compounds, comprising two or more target-specific oligonucleotides (e.g., antisense oligonucleotides (ASOs)), each being resistant to cleavage, and linked together by a cleavable linker. In particular, two or more linked target-specific oligonucleotides, each to a different target, allows concomitant inhibition of multiple genes' expression levels, while exhibiting favorable pharmacokinetic and pharmacodynamic properties. Methods of making and uses of the described compounds are also provided

  本公开提供了多聚物寡核苷酸化合物，包括两个或多个靶向特异性寡核苷酸（如反义寡核苷酸（ASO）），每个寡核苷酸都具有抗裂解性，并通过可裂解连接体连接在一起。特别是两个或更多链接的靶标特异性寡核苷酸，每个都针对不同的靶标，可以同时抑制多个基因的表达水平，同时表现出良好的药代动力学和药效学特性。还提供了所述化合物的制造方法和用途
• [EN] PHOSPHAMIDE DERIVATIVE, METHOD FOR MANUFACTURING THE SAME, AND USES THEREOF<br/>[FR] DÉRIVÉ DE PHOSPHAMIDE, SON PROCÉDÉ DE FABRICATION ET SES UTILISATIONS<br/>[ZH] 一种磷酰胺衍生物及制备方法和用途
  申请人：SICHUAN HAISCO PHARMACEUTICAL CO LTD

  公开号：WO2017133517A1

  公开（公告）日：2017-08-10

  公开了一种磷酰胺衍生物及制备方法和用途。特别公开了一种通式(I)所示化合物及其药学上可接受的盐或立体异构体 (I)，其中，G、L、Q、s如说明书中所定义。
• Revisited 3′-Deoxy-3′-<i>C</i>-Methyl-β-D-Ribonucleoside Series
  作者：Mohamed Aljarah、Sarah Couturier、Gilles Gosselin、Christophe Mathé、Christian Périgaud

  DOI：10.1080/15257770701521730

  日期：2007.11.26

  The synthesis of some 3'-deoxy-3'-C-methylnucleoside analogues bearing naturally occuring nucleic acid bases was achieved from the preparation of a suitable peracylated 3-deoxy-3-C-methyl sugar using a stereoselective pathway. In addition, examples of chemical modifications at the 2' position are presented.