β-D-arabinofuranosyl-5-methylisocytosine | 10212-31-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: β-D-arabinofuranosyl-5-methylisocytosine
• 英文别名: 1-β-D-Arabinofuranosyl-5-methyl-isocytosin；2-amino-1-β-D-arabinofuranosyl-5-methyl-1H-pyrimidin-4-one；2-Amino-1-(b-D-arabinofuranosyl)-5-methyl-4(1H)-pyrimidinone；2-amino-1-[(2R,3S,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-5-methylpyrimidin-4-one
• CAS: 10212-31-4
• 化学式: C₁₀H₁₅N₃O₅
• 分子量: 257.246
• InChiKey: JUFWRFOUTDSMSO-JAGXHNFQSA-N

物化性质

• 沸点：
  537.5±60.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.79±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2
• 重原子数：
  18
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  129
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  2,2'-O-脱水-5-甲基尿嘧啶核苷 在 氨 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 生成 β-D-arabinofuranosyl-5-methylisocytosine
  参考文献：
  名称：

  带有阿拉伯呋喃糖基嘧啶衍生物的寡聚脱氧核糖核苷酸的方便合成及其与互补DNA的双链体形成。

  摘要：

  合成了带有2,2'-脱水β-D-阿拉伯呋喃糖基尿嘧啶衍生物的寡脱氧核糖核苷酸，并通过合成后修饰方法将修饰的残基转化为β-D-阿拉伯呋喃糖基尿嘧啶衍生物或β-D-阿拉伯呋喃糖基异胞嘧啶衍生物。研究了它们的ODN与互补DNA的熔解曲线。

  DOI：

  10.1016/s0960-894x(03)00500-6

文献信息

• Convenient synthesis of oligodeoxyribonucleotides bearing arabinofuranosyl pyrimidine derivatives and its duplex formation with complementary DNA
  作者：Hiroaki Ozaki、Kiyohiro Nakajima、Kaoru Tatsui、Chieko Izumi、Masayasu Kuwahara、Hiroaki Sawai

  DOI：10.1016/s0960-894x(03)00500-6

  日期：2003.8

  The oligodeoxyribonucleotides bearing 2,2'-anhydro-beta-D-arabinofuranosyluracil derivatives were synthesized and the modified residue was converted to beta-D-arabinofuranosyluracil derivatives or beta-D-arabinofuranosylisocytosine derivatives by post-synthetic modification method. The melting profiles of their ODNs with complementary DNA were studied.

  合成了带有2,2'-脱水β-D-阿拉伯呋喃糖基尿嘧啶衍生物的寡脱氧核糖核苷酸，并通过合成后修饰方法将修饰的残基转化为β-D-阿拉伯呋喃糖基尿嘧啶衍生物或β-D-阿拉伯呋喃糖基异胞嘧啶衍生物。研究了它们的ODN与互补DNA的熔解曲线。