1-[(2R,4S,5R)-5-[[[(2R,3S,5R)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-3-yl]oxy-(4-nitrophenoxy)phosphinothioyl]oxymethyl]-4-hydroxyoxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione | 864924-76-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 1-[(2R,4S,5R)-5-[[[(2R,3S,5R)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-3-yl]oxy-(4-nitrophenoxy)phosphinothioyl]oxymethyl]-4-hydroxyoxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
• CAS: 864924-76-5
• 化学式: C₄₇H₄₈N₅O₁₅PS
• 分子量: 985.962
• InChiKey: XTMOPXAQPPTCMY-GYJRVMTCSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.9
• 重原子数：
  69
• 可旋转键数：
  17
• 环数：
  8.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.32
• 拓扑面积：
  271
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  16

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-[(2R,4S,5R)-5-[[[(2R,3S,5R)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-3-yl]oxy-(4-nitrophenoxy)phosphinothioyl]oxymethyl]-4-hydroxyoxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione 在 1,1,3,3-tetramethylguanidinium oximate 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 水 为溶剂， 生成
  参考文献：
  名称：

  通过引入带有 O-4-硝基苯基硫代磷酸酯保护基团的硫代磷酸二核苷的 P-立体控制合成 PO/PS-嵌合寡核苷酸

  摘要：

  受保护的模型二核苷 (3',5')-O-芳基硫代磷酸酯的合成，将它们分离成纯的非对映异构体，并成功掺入寡核苷酸，然后用肟酸离子（反转）立体特异性脱保护 O-芳基硫代磷酸酯功能，使制备在每个核苷酸间硫代磷酸酯位置具有预定的 P-手性意义的嵌合 PO/PS-寡核苷酸。已经指定了“二聚体结构单元”中核苷酸间 O-芳基硫代磷酸酯的磷的绝对构型。3'-末端 SP-硫代磷酸酯键有效地保护此类嵌合构建体免于被人血浆外切核酸酶降解（© Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA，69451 Weinheim，德国，2005）

  DOI：

  10.1002/ejoc.200400910
• 作为产物：
  描述：

  保护胸苷 在 吡啶 、 N-甲基咪唑 作用下， 以 1,4-二氧六环 为溶剂， 反应 2.5h， 生成 1-[(2R,4S,5R)-5-[[[(2R,3S,5R)-2-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-3-yl]oxy-(4-nitrophenoxy)phosphinothioyl]oxymethyl]-4-hydroxyoxolan-2-yl]-5-methylpyrimidine-2,4-dione
  参考文献：
  名称：

  通过引入带有 O-4-硝基苯基硫代磷酸酯保护基团的硫代磷酸二核苷的 P-立体控制合成 PO/PS-嵌合寡核苷酸

  摘要：

  受保护的模型二核苷 (3',5')-O-芳基硫代磷酸酯的合成，将它们分离成纯的非对映异构体，并成功掺入寡核苷酸，然后用肟酸离子（反转）立体特异性脱保护 O-芳基硫代磷酸酯功能，使制备在每个核苷酸间硫代磷酸酯位置具有预定的 P-手性意义的嵌合 PO/PS-寡核苷酸。已经指定了“二聚体结构单元”中核苷酸间 O-芳基硫代磷酸酯的磷的绝对构型。3'-末端 SP-硫代磷酸酯键有效地保护此类嵌合构建体免于被人血浆外切核酸酶降解（© Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA，69451 Weinheim，德国，2005）

  DOI：

  10.1002/ejoc.200400910

文献信息

• The P-Stereocontrolled Synthesis of PO/PS-Chimeric Oligonucleotides by Incorporation of Dinucleoside Phosphorothioates Bearing anO-4-Nitrophenyl Phosphorothioate Protecting Group
  作者：Lucyna A. Wozniak、Marcin Góra、Małgorzata Bukowiecka-Matusiak、Sophie Mourgues、Geneviève Pratviel、Bernard Meunier、Wojciech J. Stec

  DOI：10.1002/ejoc.200400910

  日期：2005.7

  The synthesis of protected model dinucleoside (3',5')-O-aryl phosphorothioates, their separation into pure diastereomers, and their successful incorporation into oligonucleotides followed by stereospecific deprotection of the O-aryl phosphorothioate function with oximate ion (inversion) enables the preparation of chimeric PO/PS-oligonucleotides with a predetermined sense of P-chirality at each internucleotide

  受保护的模型二核苷 (3',5')-O-芳基硫代磷酸酯的合成，将它们分离成纯的非对映异构体，并成功掺入寡核苷酸，然后用肟酸离子（反转）立体特异性脱保护 O-芳基硫代磷酸酯功能，使制备在每个核苷酸间硫代磷酸酯位置具有预定的 P-手性意义的嵌合 PO/PS-寡核苷酸。已经指定了“二聚体结构单元”中核苷酸间 O-芳基硫代磷酸酯的磷的绝对构型。3'-末端 SP-硫代磷酸酯键有效地保护此类嵌合构建体免于被人血浆外切核酸酶降解（© Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA，69451 Weinheim，德国，2005）