5-(N-pentyl)carbamoylmethyl-2'-deoxyuridine | 384817-39-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 5-(N-pentyl)carbamoylmethyl-2'-deoxyuridine
• 英文别名: 2-[1-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-2,4-dioxopyrimidin-5-yl]-N-pentylacetamide
• CAS: 384817-39-4
• 化学式: C₁₆H₂₅N₃O₆
• 分子量: 355.391
• InChiKey: PJNYFNPOPWNDIF-OUCADQQQSA-N

物化性质

• 密度：
  1.302±0.06 g/cm3(Temp: 20 °C; Press: 760 Torr)(predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.5
• 重原子数：
  25
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.69
• 拓扑面积：
  128
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-(N-pentyl)carbamoylmethyl-2'-deoxyuridine 在 吡啶 、 4-二甲氨基吡啶 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 生成 3'-O-[(2-cyanoethyl)(diisopropylamino)]phosphino-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-5-(N-pentyl)carbamoylmethyl-2'-deoxyuridine
  参考文献：
  名称：

  接头臂的末端氨基基团及其在嘧啶核苷C5位置的长度对DNA双链体的热稳定性的影响。

  摘要：

  合成了在C5-位带有取代基的2'-脱氧尿苷衍生物，其具有不同的链长和不同的官能团（甲基或氨基），并掺入到寡脱氧核糖核苷酸中。通过紫外熔融实验研究了主凹槽中取代基对双链体稳定性的影响。发现末端氨基对这些双链体的稳定取决于连接臂的长度。

  DOI：

  10.1006/bioo.2001.1212
• 作为产物：
  描述：

  1-氨基戊烷 、 3',5'-di-O-acetyl-5-(methoxycarbonylmethyl)-2'-deoxyuridine 在 4-二甲氨基吡啶 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 以83.5%的产率得到5-(N-pentyl)carbamoylmethyl-2'-deoxyuridine
  参考文献：
  名称：

  接头臂的末端氨基基团及其在嘧啶核苷C5位置的长度对DNA双链体的热稳定性的影响。

  摘要：

  合成了在C5-位带有取代基的2'-脱氧尿苷衍生物，其具有不同的链长和不同的官能团（甲基或氨基），并掺入到寡脱氧核糖核苷酸中。通过紫外熔融实验研究了主凹槽中取代基对双链体稳定性的影响。发现末端氨基对这些双链体的稳定取决于连接臂的长度。

  DOI：

  10.1006/bioo.2001.1212