N-(6-(dimethylamino)-9-(5-(dimethylamino)-4-((4-((2-(dimethylamino)ethyl)amino)-4-oxobutyl)(ethyl)amino)-2-methoxyphenyl)-3H-xanthen-3-ylidene)-N-methylmethanaminium 2,2,2-trifluoroacetate | 1616501-26-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 苯并吡喃
• 英文名称: N-(6-(dimethylamino)-9-(5-(dimethylamino)-4-((4-((2-(dimethylamino)ethyl)amino)-4-oxobutyl)(ethyl)amino)-2-methoxyphenyl)-3H-xanthen-3-ylidene)-N-methylmethanaminium 2,2,2-trifluoroacetate
• CAS: 1616501-26-8
• 化学式: C₂F₃O₂*C₃₆H₅₁N₆O₃
• 分子量: 728.855
• InChiKey: FEGXCTFRJUPVSD-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.96
• 重原子数：
  52.0
• 可旋转键数：
  13.0
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.45
• 拓扑面积：
  107.57
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  9.0

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  succinimidyl 4-(((2-dimethylamino)-5-methoxyphenyl-4-tetramethylrhodaminyl)(ethyl)amino)butanoate 、 N,N-二甲基乙二胺 在 N,N-二异丙基乙胺 、 Methanaminium,N-[(dimethylamino)(3H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-3-yloxy)methylene]-N-methyl-, hexafluorophosphate(1-) 、 三氟乙酸 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 、 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 以100%的产率得到N-(6-(dimethylamino)-9-(5-(dimethylamino)-4-((4-((2-(dimethylamino)ethyl)amino)-4-oxobutyl)(ethyl)amino)-2-methoxyphenyl)-3H-xanthen-3-ylidene)-N-methylmethanaminium 2,2,2-trifluoroacetate
  参考文献：
  名称：

  可通过酸性pH激活的荧光探针观察胞吐动力学

  摘要：

  胞吐动力学的实时成像对于精确时空了解分泌现象至关重要，但是目前的方法存在严重局限性。我们设计并合成了经过化学优化可检测酸性囊泡内pH值的小分子荧光探针，并确定它们可用于敏感和可靠地观察刺激后的囊泡动力学。这种用于可视化胞吐作用以及具有高时空精度的胞吞作用/再酸化过程的直观技术，有望成为研究涉及pH值变化的动态细胞现象的有力工具。

  DOI：

  10.1002/anie.201402030