G2-多肽 | 361443-81-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机聚合物 - 多肽
• 中文名称: G2-多肽
• 英文名称: G2-peptide
• 英文别名: (2S,3R)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-4-[[(2R,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-5-[(2S,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-5-[(2S,3S,4S,5R,6R)-4-[(2S,3S,4S,5S,6R)-3-[(2S,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-4-hydroxy-6-(hydroxymethyl)-5-[(2S,3R,4S,5R,6R)-3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxyoxan-2-yl]oxy-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-6-[[(2S,3S,4S,5S,6R)-3-[(2S,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-4-hydroxy-6-(hydroxymethyl)-5-[(2S,3R,4S,5R,6R)-3,4,5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxyoxan-2-yl]oxy-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxymethyl]-3,5-dihydroxyoxan-2-yl]oxy-4-hydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-4-hydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]amino]-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2,6-diaminohexanoyl]amino]-3-methylbutanoyl]amino]propanoyl]amino]-4-oxobutanoyl]amino]-6-aminohexanoyl]amino]-3-hydroxybutanoic acid
• CAS: 361443-81-4
• 化学式: C₉₀H₁₅₅N₁₃O₅₄
• 分子量: 2283.28
• InChiKey: SUFZXARNDACTNQ-XHSQKUEPSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -23.2
• 重原子数：
  157
• 可旋转键数：
  53
• 环数：
  9.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.88
• 拓扑面积：
  1070
• 氢给体数：
  39
• 氢受体数：
  57

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  G2-多肽 在 galactosidase 、 BSA 作用下， 以 aq. acetate buffer 为溶剂， 生成 Agalactoglyco peptide
  参考文献：
  名称：

  蛋黄粉中唾液酸糖肽的分离和表征方法的改进

  摘要：

  唾液酸糖肽（SGP）是一种复杂的双天线N-聚糖，带有一个短肽片段，可以从鸡蛋的蛋黄中分离出来。这种天然产物作为半合成N-聚糖的起始原料而受到欢迎。我们已经发现，当前的分离方法提供了一种被几种相关结构污染的糖肽，一种是具有直接连接到肽主链上的己糖的糖肽，最像是通过苏氨酸部分的含羟基侧链。此外，当前的方法采用需要冻干的新鲜蛋黄，并且涉及几个繁琐的纯化步骤。本文中，我们报告了一种使用固/液萃取和HILIC-HPLC纯化从市售蛋黄粉中分离出克量均匀SGP的简便方法。

  DOI：

  10.1016/j.carres.2017.10.001
• 作为产物：
  描述：

  SGP 在 neuraminidase 作用下， 以 aq. acetate buffer 为溶剂， 生成 G2-多肽
  参考文献：
  名称：

  蛋黄粉中唾液酸糖肽的分离和表征方法的改进

  摘要：

  唾液酸糖肽（SGP）是一种复杂的双天线N-聚糖，带有一个短肽片段，可以从鸡蛋的蛋黄中分离出来。这种天然产物作为半合成N-聚糖的起始原料而受到欢迎。我们已经发现，当前的分离方法提供了一种被几种相关结构污染的糖肽，一种是具有直接连接到肽主链上的己糖的糖肽，最像是通过苏氨酸部分的含羟基侧链。此外，当前的方法采用需要冻干的新鲜蛋黄，并且涉及几个繁琐的纯化步骤。本文中，我们报告了一种使用固/液萃取和HILIC-HPLC纯化从市售蛋黄粉中分离出克量均匀SGP的简便方法。

  DOI：

  10.1016/j.carres.2017.10.001

文献信息

• Glycopeptides of the V3 loop of gp120 and derivatives; preparation and applications as HIV-1 vaccines.
  申请人：UNIVERSITY OF MARYLAND BIOTECHNOLOGY INSTITUTE

  公开号：EP1738764A1

  公开（公告）日：2007-01-03

  A method of making a synthetic glycopeptide, by addition of a synthetic oligosaccharide oxazoline to a GlcNAc-containing peptide precursor in the presence of an enzyme selected from among Endo-A and Endo-M. In a specific implementation, the method is utilized to synthesize a trivalent V3-domain glycopeptide including three V3-domain glycopeptides on a scaffold, wherein the three V3-domain glycopeptides are arranged to mimic the V3 domain presentation in trimeric gp120. Such trivalent V3- domain glycopeptides can be utilized in a vaccine for the treatment or prevention of HIV-1 infection.

  一种合成糖肽的方法，通过在Endo-A和Endo-M中选择的酶的存在下，将合成的寡糖噁唑线加入含有GlcNAc的肽前体。在一个具体的实现中，该方法被用于合成三价V3区域糖肽，包括三个V3区域糖肽在支架上，其中三个V3区域糖肽被排列以模拟三聚体gp120中的V3区域呈现。这样的三价V3区域糖肽可以用于治疗或预防HIV-1感染的疫苗中。