N4-(N2,N6-bis-benzyloxycarbonyl-L(?)-lysyl)-cytidine | 108017-79-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: N4-(N2,N6-bis-benzyloxycarbonyl-L(?)-lysyl)-cytidine
• 英文别名: N⁴-(N²,N⁶-bis-benzyloxycarbonyl-L-lysyl)-cytidine；N⁴-(N²,N⁶-Bis-benzyloxycarbonyl-L-lysyl)-cytidin
• CAS: 108017-79-4
• 化学式: C₃₁H₃₇N₅O₁₀
• 分子量: 639.662
• InChiKey: RDXAIKRCMAEBLR-QIIVFUCJSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.19
• 重原子数：
  46.0
• 可旋转键数：
  14.0
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.39
• 拓扑面积：
  210.57
• 氢给体数：
  6.0
• 氢受体数：
  12.0

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  胞苷 、 alkaline earth salt of/the/ methylsulfuric acid 在 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 生成 N4-(N2,N6-bis-benzyloxycarbonyl-L(?)-lysyl)-cytidine
  参考文献：
  名称：

  Quantitative characterization of the interaction between purified human estrogen receptor   and DNA using fluorescence anisotropy

  摘要：

  为了更好地确定人类雌激素受体α功能特异性的分子机制，我们进行了平衡结合试验，研究受体与来自卵黄素ERE的回旋雌激素反应元件的相互作用。这些测定是基于观察与目标寡核苷酸共价结合的荧光素分子的荧光各向异性。由于游离寡核苷酸在溶液中快速翻滚，导致各向异性值较低，当受体与标记的ERE结合后，各向异性值会大幅增加。我们的数据质量足以确定这种结合具有明显的合作性质，排除了简单的单体相互作用，而暗示了在纳摩尔范围内与 DNA 结合的能量耦合二聚化。亲和力的盐浓度依赖性表明，在低盐浓度下会形成高化学计量、低特异性的复合物。将 KCl 浓度提高到 200 mM 以上会导致 ER 二聚体的特异性结合。我们将表观亲和力与温度无关的现象解释为一种熵驱动的相互作用。最后，使用对ER半位点中的每个碱基对进行突变的荧光靶ERE进行的结合试验表明，ER与其靶点之间的相互作用能量在整个位点上分布相对均匀。

  DOI：

  10.1093/nar/28.13.2494