作者:Fumihiro Ishikawa、Robert W. Haushalter、Michael D. Burkart
DOI:10.1021/ja2082334
日期:2012.1.18
identification of DH enzymes in fatty acid synthases (FASs) and polyketide synthases (PKSs). The first reported mechanism-based inactivator, 3-decynoyl-N-acetylcysteamine (3-decynoyl-NAC), while active against the Escherichia coli β-hydroxydecanoyl thiol ester DH FabA, translates poorly to an activity-based probe because of nonspecific reactivity of the thioester moiety. Here we describe the design, synthesis
我们的目标是开发一种脱水酶 (DH) 特异性反应探针,该探针可以促进脂肪酸合酶 (FAS) 和聚酮化合物合酶 (PKS) 中 DH 酶的检测、富集和鉴定。第一个报道的基于机制的灭活剂,3-癸酰-N-乙酰半胱胺(3-癸酰-NAC),虽然对大肠杆菌β-羟基癸酰硫羟酸酯DH FabA 有活性,但由于其非特异性反应性,转化为基于活性的探针的效果很差。硫酯部分。在这里,我们描述了 DH 特异性探针的设计、合成和效用,该探针包含一个磺酰基 3-炔反应弹头,旨在避免水解或非酶失活。当与荧光标签结合时,该探针靶向来自重组 I 型和 II 型 FAS 和 PKS 酶系统以及整个蛋白质组中的 DH 酶。活动研究,包括 FabA 失活和抗生素敏感性,表明这种磺酰基 3-炔烃支架选择性地靶向常见的 DH 机制。这些研究表明,基于 DH 特异性机制的探针可以极大地加速复杂蛋白质组中几乎任何类型的 FAS 和 PKS