N-
溴乙酰
双霉素 (BO) 是一种设计好的分子,具有两个具有不同功能的结构域:与双螺旋 DNA 的序列特异性结合和 DNA 主链的切割。亲电
溴乙酰基团附加到来自
天然产物多他霉素 A 的三肽的
氨基末端。 足迹研究表明,N-
溴乙酰
双霉素在几分钟内与 167 个碱基对 (bp) 限制性片段结合,位于四个富含 A、T 的位点 5 个碱基对尺寸为 5'-T
TTAA、GT
TTA、AAA
TT 和 GAAAT-3'。在 37 °C 下反应 5 小时后,该 167 bp 限制性片段中 GT
TTA 位点的单个
腺嘌呤处发生切割,并遵循
哌啶处理程序。BD 的共价连接发生在
腺嘌呤的 N3。3-(乙酰基二霉素)
腺嘌呤是 BD 与 15 碱基对寡核苷酸双链体 5'-CGGTAGT
TTATCACA-3' 在 37 °C 下反应释放的产物。
哌啶处理后切割位点的 3' 和 5' DNA 末端是
磷酸基团。BD 对双链 DNA